免疫印迹(Western Blot) 采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。SDS-PAGE 可对蛋白质样品进行分离,转移到固相载体——例如硝酸纤维素薄膜(NC)上。固相载体可以吸附蛋白质,并保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。转移后的 NC 膜就称为一个印迹(blot),用蛋白溶液(如 5%BSA 或脱脂奶粉溶液)处理,封闭 NC 膜上的疏水结合位点。用目标蛋白的抗体(一抗)处理 NC 膜——只有待研究的蛋白质才能与一抗特异结合形成抗原抗体复合物,这样清洗除去未结合的一抗后,只有在目标蛋白的位置上结合着一抗。用一抗处理过的 NC 膜再用标记的二抗处理,二抗是指一抗的抗体,如一抗是从鼠中获得的,则二抗就是抗鼠IgG 的抗体。处理后,带有标记的二抗与一抗结合形成抗体复合物可以指示一抗的位置,即是待研究的蛋白质的位置。
使待测样品中的蛋白质按分子量大小在凝胶中分成带。 1. Western blot 结果中的背景为什么较高? 可能的原因及建议 1) 膜封闭不够——延长封闭的时间;选择更加适合的封闭液。Abcam 推荐 5% 脱脂奶粉、3% BSA 或血清封闭 30 分钟。这些可以包含在抗体缓冲液中。 2) 一抗稀释度不适宜——对抗体进行滴度测试,选择最适宜的抗体稀释度。 3) 一抗孵育的温度偏高——建议 4℃结合过夜。 4) 膜在实验过程中干过——实验过程中要注意保持膜的湿润。 5) 检测时曝光时间过长——减少曝光时间。 6) 二抗与封闭剂非特异性结合或反应——设置二抗对照(不加一抗)。 7) 一抗或二抗与封闭剂有交叉反应——在孵育和洗涤液中加入温和去污剂如吐温 -20。脱脂奶粉含有酪蛋白,该蛋白本身就是一种磷酸化蛋白,会结合磷酸化特异性抗体而易产生 高背景。使用 BSA 代替奶粉作为封闭剂。 8) 未结合蛋白质洗涤不充分——增加洗涤次数。 9) 膜的选择导至的高背景——NC 膜比 PVDF 膜背景低。 2. Western blot 结果中杂带较多可能的原因及建议
可能的原因及建议 1) 检测样本不表达目的蛋白——选择表达量高的细胞作为阳性对照,用于确定检测样本是否为阴性。 2) 检测样本低表达目的蛋白——提高上样量,不 低于20-30ug,裂解液中注意加入蛋白酶抑制剂。 3) 转移不完全或过转移——可以用丽春红染膜并结合染胶(考马斯亮蓝)后确定条带是否转至膜上或转移过头;适当调整转膜的时间和电流。 4) 抗体不能识别测试种属的相关蛋白——购买抗体前应当认真阅读抗体说明书,确定其是否能够交叉识别测试种属的对应蛋白。 5) 一抗孵育时间不足或一抗不足或一抗失效——建议 4℃结合过夜,使用高浓度抗体,使用新鲜抗体,重复使用有效浓度会降低。 6) 二抗与一抗不匹配——选择针对一抗来源的种属的抗体。 7) 洗膜过度——洗膜时间不宜过长,加入的去垢剂不宜过强或过多,建议使用 0.1%的弱去垢剂 Tween-20。 8) 封闭剂和一抗或二抗有交叉反应——使用使用温和的去污剂如吐温-20,或更换封闭剂(常用的脱脂奶粉、BSA、血清或明胶)。 9) 二抗受叠氮钠抑制——避免叠氮钠和 HRP 标记抗体一起使用。 3. 其它现象:1) 膜上多处出现黑点或黑斑——抗体与封闭试剂发生非特异性的结合,过滤封闭剂。 2) 反白(条带显白色)——目的蛋白含量太高或者一抗浓度偏高,稀释抗体的浓度。 3) 蛋白分子量偏低或偏高——胶浓度不适合,高分子量要用低浓度胶;小分子蛋白要用高浓度胶。 4) 分子量蛋白标准条带呈黑色——抗体和分子量蛋白标准发生了反应,在分子量蛋白标准和第一个样品之间增加一个空白条带。 5) 目的条带染色过低/过高——分离不彻底,改变凝胶比例:分子量大的蛋白用低浓度胶,分子量小的蛋白用高浓度胶。 6) 相同的蛋白杂交出现大小不均匀条带——制备凝胶时凝胶凝固太快,致使泳道中丙烯酰胺的比例不均匀,参照凝胶的配方,在凝胶中加入适量 TEMED,放置时在凝胶顶部加入适量 0.1% SDS(水稀释)以防凝胶变干。 4. “微笑”条带1) 迁移速度过快——降低电泳电压。 2) 电泳温度过高(改变了 pH 值和迁移速度)——降低迁移速度或低温电泳(冷库或冰上)。 5. 凝胶染色不均匀1) 细菌污染——4°C 保存抗体并使用新鲜的缓冲液浸泡凝胶。 2) 抗体量不足——确保在振荡孵育时抗体充分浸没膜。 6. TBS 与 PBS 的区别PBS 的缓冲能力强于 TBS(因为混合缓冲液在一定的离子强度下常常具有更宽的缓冲范围),TBS 在 PH7.0 以下缓冲能力较弱(不过 PBS 易污染)。但我们常常要根据我们实验目的选用合适的缓冲液,如在蛋白纯化中进行阴离子交换层析,阳离子缓冲液首选 TBS;阳离子交换层析时,阴离子缓冲液则首选 PBS。 Western blot 中使用 TBS 和 PBS 均可,只是要根据需要选择合适的浓度。 7. Western 是否可以同时加两种或者多种一抗通常情况下只加一种一抗。做 Western 在同一张膜上检测目的蛋白和内对照,也是先上目的蛋白的一抗、二抗,ECL 显色、压片、洗片;漂洗以后,再上内对照的一抗、二抗,ECL 显色、压片、洗片。 8. PVDF 与 NC 膜的区别PVDF 膜价格较贵,可重复使用,但结合能力较强。 NC 膜价格比较便宜,应用较广,结合牢固性较 PVDF 膜差,韧性也不如 PVDF,不能重复使用,但蛋白吸附容量高,亲水性较好。 9. Western 一抗的选用 理论上单抗比多抗的特异性要好,但单抗种类较少一般价格偏高,所以一般来说多抗足够了。 10. Western 抗体和 ELISA 抗体的区别一般来说用于 western 的抗体主要识别氨基酸序列特异性;而可用于 ELISA 的抗体则要看抗原种类,有些是识别氨基酸序列特异性,有些是识别构像特异性。所以一般根据抗体说明书来确定。 做免疫印迹时选择抗体主要应考虑两个问题,一是所选抗体是否能识别凝胶电泳后转印至膜上的变性蛋白,另一个是所选抗体是否会引起交叉反应条带。 11. “短路”现象的产生和处理如果纸、膜比凝胶大就比较容易形成短路了,上下两层虑纸也不能因过大而相互接触,这样同样会短路,电流不会通过胶和虑纸。转移前和转移过程中看看电压就行,正常的半干是慢慢变高的,最后结束时一般是开始的 1.5-3 倍都是正常的。一般 Buffer 和滤纸选的对就不会短路。 12. Western Blot 的染色1) 阴离子染料是较常用的,特别是氨基黑,脱色快,背景低检测极限可达到 1.5μg,考马斯亮蓝虽然与氨基黑有相同的灵敏度,但脱色慢,背景高。丽春红 S 和快绿在检测后容易从蛋白质中除去,以便进行随后的氨基酸分析。缺点是:溶剂系统的甲醇会引起硝化纤维素膜的 皱缩或破坏。不能用语正电贺的膜。灵敏度低。 2) 胶体金,灵敏度高,检测范围可到 pg 级,但染色比稳定。 3) 生物素化灵敏度位于 1、2 之间,可用于任何一种膜。 13. 大分子量蛋白转移效率低的解决方法可以在转移缓冲液中加入 20%甲醇(是指终浓度),因为甲醇能增加蛋白质和 NC 膜的结合能力,同时可以延长高分子量蛋白质转移时间;转移缓冲液加入终浓度 0.1% SDS,也是为了增加转移效率;选用优质的转移膜,或使用小孔径的 NC 膜(0.2 微米);使用戊二醛交联。太大时还可以考虑用琼脂糖胶;提高转移电压/电流;增加转移时间。 14. DAB 显色、碱性磷酸酶-抗碱性磷酸酶显色原理DAB 显色在辣根过氧化酶的作用下能形成一种灰褐色的产物,该产物难溶于醇和其他有机溶剂,DAB 的氧化还能引起聚合作用,导至与四氧化锇反应而增加其染色强度和电子密度。碱性磷酸酶-抗碱性磷酸酶显色中,酶将奈酚磷酸(底物)水解成酚类和磷酸。酚和无色的重氮盐(显色原)结合而产生有色的、不溶性偶氮染料。 15. 酶显色与荧光显色的优缺点免疫酶技术就是用酶标记已知抗体(或抗原),然后与组织标本在一定条件下反应并结合,结合形成的复合物中所含有的酶分子遇到底物时,会催化底物水解、氧化或还原,从而发生显色反应。免疫酶组化技术分为酶标记法与非标记抗体技术,前者是将酶通过交联剂结合在抗体分子上,形成酶标记抗体。后者是将酶作为抗原与相应的特异性抗体连接进行的免疫反应,称为非标记抗体酶技术。 免疫荧光技术中的荧光抗体染色标本不能长期保存,对组织细胞的细微结构分辨不清,但免疫酶技术则能克服上述不足,标记免疫酶技术的敏感性更优于免疫荧光法。酶显色产物具有较高的电子密度,经过适当处理还可以进行免疫电镜观察。 16. 为什么蛋白质印迹条带大小与预期的不同?蛋白质印迹是一种基于蛋白质大小来分离蛋白质的技术。一般来讲,蛋白质越小,在胶上的迁移速度越快。但迁移速度也受其它因素的影响,因此,观察到的实际条带大小可能与预测的不同。常见的因素包括: 1) 翻译后修饰 - 例如磷酸化、糖基化等,可增加蛋白质大小。 2) 翻译后切割 - 例如,许多蛋白先被合成为前蛋白,然后被切割产生活性形式,例如前半胱天冬酶。 3) 剪接变体和异形体 - 可变剪接和异形体可能从同一基因产生不同大小的蛋白质。 4) 相对电荷-氨基酸(带电和不带电)多聚体组分,例如蛋白质的二聚化。这种情况通常在还原条件下需要防止,但强相互作用会导至较大的条带出现。 17. 应该上样多少样品?细胞裂解物、膜裂解物和核裂解物:每孔上样 20 至 30 μg 总蛋白。 这可能需要根据测试样品中的蛋白质表达水平进行一些优化。纯化蛋白(重组或内源):上样 10 至 100 ng 蛋白。 18. 检测重组蛋白时难以获得条带。为什么?抗体检测重组蛋白质时,存在难以克服的困难,有必要加以考虑。我们推荐确保样品中表达的重组蛋白包含所用抗体的免疫原序列。 同时,如果重组蛋白带有标签,标签可能阻止抗体接近表位。尽可能让标签位于重组蛋白的 C 或 N 末端,以降低这种情况发生的可能性(而不是位于蛋白质的阅读框中间)。 在蛋白质印迹中检测重组蛋白时,我们始终推荐运行内源阳性对照。 19. 样品需要还原和变性吗?我们推荐查看数据表获取更多详情。Abcam 抗体将仅在还原和变性条件下进行测试,除非数据表中另有说明,我们推荐使用还原和变性条件。 在一些情况下,Abcam 抗体也将在非还原条件下进行测试,在这种情况下,我们将在数据表上详细说明(参见应用备注部分或 Abreviews)。如果我们有表明抗体在某种或其它条件下无效的数据,数据表会加以说明。 20. 牛奶和 BSA 封闭有区别吗?抗体可能对封闭剂敏感,我们推荐查看数据表确定是否有数据表明抗体在 BSA 还是牛奶中效果更好。如果有,Abcam 将在数据表中加以说明。 一般来讲,BSA 会产生更清晰的结果,因为 BSA 含有较少的蛋白,因而抗体较少与其发生交叉反应。但并非总是如此,有些抗体在牛奶中的效果更好,因为牛奶含有更多种类的封闭蛋白,能封闭更多不同类型的蛋白质。 21. 能否用室温下孵育一抗 1 小时代替 4 ℃ 过夜孵育?蛋白质印迹中一抗孵育时间需要最终用户进行优化。一般来讲,4 ℃ 过夜孵育将产生更高效、更特异的染色。但许多抗体在室温下孵育 1 或 2 小时效果也非常好。 我们推荐查看数据表上关于合适孵育时间的数据(参见可用的Abreviews、出版物和图像数据)。 22. WB不建议分装抗体,可能会导至抗体失效; 四、参考来源: 1. http://www.detaibio.com/material-western-blot-faq.html 2. https://www.abcam.cn/products?keywords=westernblot |