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[分享] 微流控硕博可以从事哪些工作?

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发表于 2024-9-5 15:15 | 显示全部楼层 |阅读模式
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发表于 2024-9-5 15:15 | 显示全部楼层
企业的话基本就是类器官和做单细胞的比较多吧,类器官基本都是用微流控在做,单细胞最成熟的商用平台10x和BD的Rhapsody分别用的就是液滴微流控和微孔微流控,硕士进研发岗或者当个BD的技术支持都是ok的,如果读到博士进公司应该直接就项目总监吧。微流控作为一个技术在就业市场上还是比传统的生物学好不少的,不过这么小的圈子你大可以咨询你的导师,他很有可能就有个开公司的师兄弟或者师父能给你内推的机会,这种时候都是看师门的一般不会去看你的学校,毕竟一个985所有搞化学的生物的材料的加一块儿也未必能有几个搞微流控的
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发表于 2024-9-5 15:16 | 显示全部楼层
一、比色法核酸检测背景介绍:
      比色法核酸检测,一种通过肉眼观察就能检测食源性病菌的新方法方法。朗伯-比尔定律(Beer-Lambert Law),又称比尔定律,或者布格-朗伯-比尔定律,是光吸收的基本定律,适用于所有的电磁辐射和所有的吸光物质,包括气体、固体、液体、分子、原子和离子。比尔-朗伯定律是吸光光度法、比色分析法和光电比色法的定量基础。光被吸收的量正比于光程中产生光吸收的分子数目。
比尔-朗伯定律数学表达式
A=lg(1/T)=Kbc
A为吸光度,T为透射比。
K为摩尔吸收系数.它与吸收物质的性质及入射光的波长λ有关。
c为吸光物质的浓度,b为吸收层厚度。
物理意义:当一束平行单色光垂直通过某一均匀非散射的吸光物质时,其吸光度A与吸光物质的浓度c及吸收层厚度b成正比,而透光度T与c、b成反比。
比色法理论依据:物质的颜色与光存在一定的关系。光是一种电磁波,由不同波长的电磁波按一定比例组成的混合光。我们物理实验都发现,通过棱镜可将不可见的自然光分解成红、橙、黄、绿、青、蓝、紫等各种颜色相连续的可见光谱。
风雨之后,见彩虹也就是这个道理。




当我们把两种光以适当比例混合而产生白光感觉时,则这两种光的颜色互为补色。当白光通过溶液时,如果溶液对各种波长的光都不吸收,溶液就没有颜色。如果溶液吸收了其中一部分波长的光,则溶液就呈现透过溶液后剩余部分光的颜色。例如,我们看到KMnO4溶液在白光下呈紫色,就是因为白光透过溶液时,绿色光大部分被吸收,而紫色光透过溶液。同理,CuSO4溶液能吸收黄色光,所以溶液呈蓝色。有色溶液的颜色是被吸收光颜色的补色。吸收越多,则补色的颜色越深。比较溶液颜色的深度,实质上就是比较溶液对它所吸收光的吸收程度。
比色法是生化检测中很常用的方法,以生成有色化合物的显色反应为基础,通过比较或测量有色物质溶液颜色深度来确定待测组分含量。早在公元初古希腊人就曾用五倍子溶液测定醋中的铁。1795年,俄国人也用五倍子的酒精溶液测定矿泉水中的铁。
下面就让我们结合一篇文献来了解下比色法在水源性病菌的检测过程。
二、论文分析:
科研人员发表文章《A microdevice for rapid, monoplex and colorimetric detection of foodborne pathogens using a centrifugal microfluidic platform》,论文摘要如下:




图1,原文摘要

该文献作者提出了一种离心微流控与LAMP技术相结合的微流体设备(至于何谓LAMP技术,不懂小 伙伴可以检索翻看之前的文章介绍)。在此作者设计了一款设备可对多种类型的水源病原体进行快速检测。
作者实现了集成化的目标,在一个芯片上实现液体搬运、试剂定量、扩增与检测的整个过程。在最后的检测环节,作者采用简单的Calcein染料比色法进行检测。此处的Calcein是一种合成的荧光素,发出明亮的荧光而变色。作者在此采用的方法就是以Calcein为染料,通过该染料颜色的变化来观察结果。  
在可见光下,阳性Calcein用黄色至绿色表示,而阴性样品则保留浅橙色。这随着靶基因的扩增而发生,扩增方法则是等温扩增的方法。
芯片设计与制作过程基于此原料,样品原理图如下图2a和2b所示。该芯片直径为165mm,其由6个相同的单元组成,能够同时进行30次的反应。每个单元由以下几部分组成:
(1) 在加样腔装载LAMP试剂和引物;
(2) 混匀;
(3) 用于进行LAMP反应的试剂等分为6份;
(4) 密封定量腔和扩增腔之间的连接通道,防止试剂蒸发;
(5) 进行DNA扩增和检测。
该芯片由三层组成:顶层和底层由PMMA材料机械加工制成,中间层由压敏粘合剂 (PSA) 制成。该芯片的照片如图2c,三层结构如图2d 所示:



图 2

PMMA部件的机械加工采用铣床将微流体结构(加样腔,混合腔,定量腔,密封腔和扩增腔)刻在4mm的PMMA 芯片上(底层)。顶部2mmPMMA层包含用于装载试剂和石蜡的进样孔和通风孔。中间层采用压敏胶。所谓压敏胶,简称PSA,Pressure Sensitive Adhesive, 就是一类压力敏感型粘接用薄膜材料,施工可以用手施压完成,不需要加热、催化剂或者UV紫外光照射等辅助固化,而具有持久的粘接力,内聚力和粘弹性的产品。
实验操作流程:
1、将 LAMP 试剂和引物注入加样腔,将密封试剂连同石蜡一起加载到密封腔中,并将 DNA 样品注入扩增腔。如图3a所示:
2、将LAMP试剂 (引物,缓冲液) 以400RPM的速度转移到方波混合通道中。图3b,3c所示:
3、等混合腔充满后,虹吸阀被激活,LAMP 试剂开始以600RPM的速度流入定量腔,多余的液体流入废液腔。该步骤完成后如图3f所示:
4、LAMP试剂通过连接气动通道以1200 RPM 的速度转移到扩增腔中,如图3g所示:
注意:连接通道意在将液体保留在定量腔中,防止在定量过程中液体流入扩增腔中,从而确保成功进行定量。



图 3、实验流程图

核酸扩增过程会按照等温扩增的条件在63C下进行60分钟(一旦扩增腔被填充,密封过程就开始了),扩增完成后会将温度升至80°C并持续2分钟,从而是使酶失活来终止扩增。整个扩增终止后,关闭设备、冷却芯片。
最终的检测结果通过Calcein染料的颜色变化观察(橙色代表阴性,黄绿色则表示阳性)。 如图3g 所示:
总体而言,除了芯片之外,壳体的外部机械结构采用不透明的黑色PMMA材料制作,整套设备的检测照片如图4所示。




图4、系统整体结构

        系统包括步进电机;微控制器;波长为365nm的紫外线发射器用于激发LAMP产物和Calcein;用于读取扩增腔内光的光电二极管;用于芯片定位的霍尔传感器。该霍尔传感器与磁体腔内的磁体结合在一起,用以对准扩增腔,从而完成精准的检测目标。这些器件的完美搭配,按照实验流程执行后即可完成食源性病毒的快速检测。
参考文献:
1、A microdevice for rapid, monoplex and colorimetric detection of foodborne pathogens using a centrifugal microfluidic platform.
2、百度百科及其相关报道
更多同类文章请见同名公众号:微敏视界
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发表于 2024-9-5 15:17 | 显示全部楼层
可以查一下苏州中芯启恒、上海彭赞生物、北京博奥、华大基因等的招聘岗位信息
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发表于 2024-9-5 15:18 | 显示全部楼层
研发
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发表于 2024-9-5 15:19 | 显示全部楼层
目前没有特别成熟的产业,但可以从事学术工作,或者到创新企业。退一大步,在研究生期间获得的批判性思维和创新性能力,从事其他专业工作也不是什么困难的事。
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