猛博士最早入行是在基因组领域。记得98年的时候,一些华人科学家组织了一个关于基因组的论坛。在这次论坛上,猛博士第一次接触到了基因组、生物信息、组合化学、基因芯片等技术。可以说,让我感到非常震撼。这些研究都进入高通量时代了,原来的一些研究方式效率太低了。 机缘巧合之下,考入了中国科学院遗传与发育生物学研究所人类基因组中心读博士。刚好那个时候中国启动参与国际人类基因组计划。我也有幸成为其中的一员,与全球六个国家的科学家一起去解析关乎人类生命的最重要的图谱,并成为这个重大科学工程的一份子。 可以说我们这个团队是国内最早接触基因组科学与技术的。那个时候公众对于基因还所知甚少。学术界对于是否参与国际人类基因组计划还有不同的意见。就是在那样的情况下,创建了华大基因,我是学生,也是华大第一批中层。后续又成立了中国科学院北京基因组研究所。那个时候也还没有NGS,还是一代测序技术包打天下。 通过完成国际人类基因组计划中国卷,水稻基因组、家蚕基因组等基因组项目,华大基因展露头角。此后,测序技术不断升级。二代测序技术当初有几家不同的技术进行竞争,Illumina逐渐表现出竞争优势。在这一过程中,华大基因开始与Illimina合作,迅速建立了足够强大的测序实力。那个时候,测定一个物种,就能发一篇影响影子不错的文章。这样,华大进一步确立了自己的江湖地位。 那个时候有个很尴尬的情况就是测序仪和试剂都是进口的。可以说是“用外国枪打中国鸟”。一位在外企测序仪公司工作的销冠朋友讲现在这个状况,咱们要么是鱼肉,要么是当狗。你们这些用户,就是鱼肉,人家要涨价就涨价。像我们这些在外企打工的或者做代理的都是走狗。话难听,但情况就是这么一个情况! 那个时候国内也有些团队在开发测序仪,我们也在导师的带领下,做了工作。但似乎最终都没有变成成熟的产品。后来华大收购Complete Genomics,将技术引入国内,开始进一步研发国产测序仪。此后,也陆陆续续有不少团队再做测序仪。当下,除华大外,二代、三代的测序仪的国产厂家都还是能找到。至少是改变了测序领域设备、试剂都依靠进口的局面。 一代测序是先获得PCR片段或者克隆,使用Sanger的末端终止法进行测序。二代测序则不需要预先获得片段或克隆,采用并行扩增的方式。Illumina采用的是边合成边测序的方式。三代测序则不需要扩增,可以说是单分子测序。有基于全内反射显微镜(TIRF)的短读长测序;也有像基于零基波导以及纳米孔技术的长读长测序。虽说是不同的三代技术,但都不能完全取代其他技术。 随着技术的测序发展,测序通量增长迅猛,成本急速下降。二十世纪90年代大规模启动人类基因组计划测序的时候,估计测定测定一个人的基因组大约要30亿美金。现在的价格与那时相比说是白菜价都说高了。 正是由于测序技术的飞速发展,生物信息技术以及其他组学技术也受到关注,并获得了高速的发展。在医学领域又催生了精准医学的发展。从人类基因组计划开始,确确实实使生命科学及医学研究发生了天翻地覆的改变。 测序本身也成为一个行业。从上游的测序仪、测序试剂耗材的厂家,到中游提供技术服务的厂商,再加上下游临床检测与诊断的机构。可以说整个行业发展到今天,蔚为壮观! 猛博士原来在这个领域,现在离开了!可以说做了这个行业的逃兵。但是对这个行业还是有很深的感情,也有自己的理解。且听下回看猛博士认为NGS行业未来发展趋势如何。 |