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[分享] 科学家怎么做基因组测序

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发表于 2025-5-26 15:54 | 显示全部楼层 |阅读模式

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中国发表基因组测序的文章,二十多年来泛滥成灾。

大多数是为了发文章,不为了科学,而“做的”。

大多数,是乏味的测序,而不结合科学问题,没有真正的科学讨论、科学意义。

典型的是测序公司的初级技术人员就可以包揽的工作,实际上就有违反基本科学常规的公司,让完全不做技术的企业其他人员,成为论文的第一作者,并以此拿哥本哈根大学的博士学位,作为公司对员工的奖励。这不是天方夜谭,而是华大基因内部员工,多个员工,告诉我的。谁要验证,可以去看看有没有不做技术、没有去哥本哈根上学的人,居然有论文发表、居然是哥本哈根大学的博士。

(任何哥本哈根大学的真博士,不要因此再抗议我,而应该抗议涂黑你们学位的公司和作贱你们学位的哥本哈根大学有关教授和领导)。

而在这样的背景中,我读文章,发现有完全与此不同的优秀科学家。

我一直保持阅读纸质版科学期刊的习惯。这样,有时电子版没有读的文章,纸质版再给一次机会,可能阅读更仔细。

今天,我读到2024年9月的Nature Genetics。上面有朱玉贤教授领导的课题组发表的文章,棉花基因组以及通过基因组分析发现一个序列。他们研究了其功能,提出一个前人没想到的调控胚胎发育的分子机理。

这样的文章,就是一直关心功能、其测序不是为了一篇文章,而是为了更多、更深理解生物学机理。

这篇文章,虽然有基因组测序、虽然需要用到公司的服务,可是作者中完全没有公司的人。原因是公司只做技术服务,而科学分析、科学思考、科学研究都是朱老师和他的团队做的,每一章图表也是朱老师课题组做的。所以,公司不仅没有出现在作者行列,连致谢都没有,因为他们不过是提供付费服务,正如我们每一个实验科学的课题组也购买过其他试剂或服务一样,完全不用列公司的人。

这就是真科学家为了真科学问题做的真需要测序辅助的真研究。科学家和科学团队贡献是科学的主导,辅助测序犹如购买试剂。

于此相反的是一些伪科学家/不想好好做科学的科学家为了发文章得个人利益做的非研究性质的测序。测序是主导,科学是为了发文章戴上的伪装。

如果有人还不清楚哪些文章是科学、哪些文章是技工,看看文章作者中企业的员工占多少。凡是名列第一的作者(包括并列第一)是公司的、凡是通讯作者(包括并列通讯作者)是公司的,一般来说、一般绝大多数这类的就是骗钱、偏名的劣质科学(不排除企业的是优质技工、但大学和科研院所的人做这种文章的作者就是劣质科学)。

2025年1月15日 2:58-3:21 pm


(对不清楚的可能误会我表扬北大老师的人需要说明:朱老师帮助武大建立了高等研究院,我们已多年没见)





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原文地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/22252731657
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