基因报告中结论为未涉及已知染色体微重复综合症和已知OMIM致病基因？是不是不属于染色体异常可以怀孕？

青草

基因报告中结论为未涉及已知染色体微重复综合症和已知OMIM致病基因？是不是不属于染色体异常可以怀孕？
原文地址：https://www.zhihu.com/question/418386512

大力水手

鉴于问主的描述十分有限，下面尝试着按我的理解来回答一下。首先，我们需要厘清这个问题的基础需要弄清几点：
1 测试者是成年人还是胚胎/流产胎儿；测试直接目的是什么？
2 这个测试是用的什么方法；有什么局限性？
3 测试报告该如何解读？
4 如何根据这个测试报告准备造人计划？
第一，一般来说外表健康的育龄男女不会主动想到去做有关备孕的基因测试（“遗传物测试”更准确，为便于理解起见称“基因测试”）。除非女方高龄备孕、有过一次以上流产史、或男方/女方有习惯性流产家族史。触发测试的原因可能是多次备孕无果/流产，或者已有一个患遗传病的孩子，医生建议测备孕父母或流产胎儿。
如果测的是流产胎儿，阴性结果不能说明任何问题，因为导致流产甚至习惯性流产的原因太多了；阳性结果（染色体异常）则表示找到流产原因，并且父母双方有可能（并非100%）是异常染色体携带者。
如果测的是已出生的患儿（可能性很小，因为描述像是筛查(screening)而非诊断(diagnostic)测试)，那这个报告几乎没用，家长还需要在寻找答案的路上摸索。
如果测的是IVF试管儿取样，这个报告意义要大得多。大概率这个胚胎可以成功怀孕生产（不排除患单基因遗传病可能）。
如果测的是备孕父母，情况要复杂些，请往下看分析。
第二， 基因（遗传物）测试有多种方法，各有优越性和不足，采用哪种方法由测试目的决定的。根据问题表述“染色体微重复综合症”、“已知OMIM致病基因”初步判断是采用microarray test。这种测试能很好地检测染色体数目异常、微缺失、微重复。定量功能强大，缺点也很明显，就是不能定位。遗传物质（染色体）不是保证正确的量就足够了，染色体易位、翻转等等作妖的染色体异常对生殖健康影响巨大，需要用吉姆萨染色、荧光原位杂交或者全基因组测序等方式才能检测到。鉴于国内由于成本走低、日渐流行全外显子组（WES）和全基因组测序（WGS），这个测试也可能是NGS测序结果。这样既可以测微重复/微缺失，还可以测单碱基，移码等小尺度突变，所以能声称“未涉及已知OMIM致病基因”。全基因测序还有个好处就是，只要算法够强大，染色体易位、翻转这样的大尺度事件也可以被捕捉到。但是测序报告会强调“未发现致病突变和可疑突变”， 所以我倾向于相信这还是microarray测试。
换言之，由于技术原因，这种测试判断生殖功能异常的能力有限。
第三如何解读。跟首答的遗传咨询师说的一样，这份报告的用语不够规范。与其说是阴性结果，不如说是无法定性（inconclusive）。原因如前所述，是由技术本身工作原理决定的。另外，医学遗传学还在不断发展，新的遗传病、新的致病基因时至今日还层出不穷，即使是OMIM这样最权威的数据库也不能及时收录所有新发现的基因/遗传位点和疾病。
只能说，很大概率上，被试者遗传物质是正常的。
最后，如何指导备孕。
假设这是测的备孕父母，双方都得到这样的看似“阴性”结果，它对于回答是否可以怀孕不具有特别的指导价值。不孕不育的影响因素太多，即使把能做的基因测试都做了个遍，也仅有30%左右几率找到原因。比如技术水平所限，低水平生殖细胞系的嵌合突变可能根本测不到。现在人工辅助生殖技术已经比较发达，心理能够接受的话去做试管+植入前基因筛查，那时候胎儿能有这样“阴性的”检测结果，那么恭喜你，离成功造人又近了一步。

队长是我

我觉得一般报告不会这么写：未涉及已知染色体微重复综合症和已知OMIM致病基因，这样的表述有点奇怪。
一般对于阴性报告描述会是：本检测在XX检测范围内未见异常。
因为描述成“未涉及已知染色体微重复综合症”和“未涉及已知OMIM致病基因”这两个不属于结论，只是证据。报告如果是阳性的话对于微缺失微重复这种疾病的变异形式会按照致病性、可能致病性、意义未明、可能良性、良性这样的描述，这种是属于报告的结论，我们需要根据报告结论提示的变异来判断是否有患病的可能性。因为未涉及已知染色体微缺失微重复综合征这是非常常见的情况，人类总共已知的染色体微缺失微重复综合征也就60多种，不是已知疾病不能完全否定变异致病性！包括OMIM基因也同样，只是一种证据。
您最后一句“是不是不属于染色体异常可以怀孕？”来推测您是成年人，成年人是很少有这种染色体微缺失微重复异常的，多数都是孩子或胎儿有异常，父母来验证。自身由于这种微缺失微重复影响怀孕的是在少数。

长长的路

这个报告结果是未涉及已知的染色体重复症和致病基因，基本上没问题（但不能排除存在未登录在数据库的其他变异可能）
实在不放心的话，可以做三代试管筛查胚胎的基因/染色体后再移入母体，之后可以做羊水穿刺检测胎儿的基因，确保万无一失

感恩由您

不是已知OMIM致病基因可以放很大的心，一般不会导致太严重的遗传问题。染色体微重复看重复量，100kbp一下，非主要基因与致病基因基本可以放心。但是不代表不存在风险，依然需要你自己做决定。

卡卡

只是未列在数据库里，以前没有同样的病症被提交而已。
不代表不致病。说不清楚。
所有人都会让你自己决定要不要怀孕。