目前生物信息学及系统生物学有哪些大牛？

奋斗的小鸟

我比较关注亚洲这边的，比如香港还有新加坡，美国的其实也可以，但小的比较怕死，怕到了美国会吃自由国度的机枪子弹。

Ps：个人认为做结构的哪些一般是不算搞生物信息学的……

原文地址：https://www.zhihu.com/question/270105803

同花顺

其实，很多生信技术的源头都在美国，但参与研发的少不了华人学者。以我比较熟悉的单细胞分析领域来说：
1. 时下的单细胞测序分析技术常用的Monocle2/3的开发者，来自于华盛顿大学的Cole Trapnell实验室，但一作是Xiaojie Qiu，以他为一作的单细胞组学分析开山之作之一的文章发表在Nature Methods上，目前被引用数量超过2200次。 Xiaojie Qiu目前也拿到斯坦福大学遗传和计算机科学学院的助理教授职位。



2. 另外一款常用的单细胞分析包来自于纽约大学的Satijia实验室，其开发者也少不了华人身影，Yuhan Hao目前是Neptune Bio公司的首席数据科学家。


3. 不过，在我看来正处在前沿科学和算法研发领域、来自于MIT的Xiao Wang(助理教授)更出众一些。她的团队目前已经在顶刊发表数篇未来几年可能会大火的新的测序和分析方案Publication — Wang Lab。比如Single-cell Translatomics。由她领导的团队也完成了小鼠脑中枢分子图谱的全息构建。同时，她本人也是十分女神，一路从北大本科到MIT教授，有兴趣可以去她实验室主页看看。



4. 另外，来自纽约大学的Shao-shan Carol Huang （助理教授），开发AI算法，研究基因调节网络，也是DAP-seq全基因组转录子调控解决方案的开发人员之一。



另外，我觉得生信和纯计算机科学之间的不同就是，生信是一整套关于生物学问题的解决方案，包括实验本身和数据分析。

检验医师

生物信息领域的大佬，李恒博士，二代测序数据分析时，经常会用到sam格式、samtools、bwa等，都与这位大佬密不可分。
以下来自李恒博士的主页：Heng Li's Homepage
My name is Heng Li, an assistant professor of Biostatistics and Computational Biology at Dana-Farber and Harvard Medical School. I study advanced computational methods and mathematical models to help researchers to understand biology better. I have worked on genomics, population genetics, phylogenetics and network dynamics. I led the design of the SAM format, created SAMtools/htslib and developedBWA and minimap2 among others. I also routinely collaborate with other biologists and computer scientists, and have been involved in multiple international projects such as the 1000 Genomes Project.
I graduated from Nanjing University in China with a B.Sc. in physics. Under the supervision of Wei-Mou Zheng, I obtained my Ph.D. in theoretical biophysics from the Institute of Theoretical Physics, Chinese Academy of Science, in 2006, when I worked at BGI in the same period. I was a Postdoc of Richard Durbin before I became a research scientist at the Broad Institute in 2009.
At the time I am writing this page my wife, my daughter and I are living around Boston, United States. Our motherland is China, forever.
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欢迎 @pythonic生物人

卡卡

首先声明，这里只是我个人熟悉的大多数课题组，每次出去开会了还是会遇到一大批优秀的人，领域里真是有太多太多做的出色人了，个人无法一一深入了解，也无法一一列举，请包涵！
我说几个数量&计算遗传学领域的吧。
1.人类遗传学
Peter visscher,澳大利亚昆士兰大学，人类遗传学复杂数量遗传机制大佬，
Peter visscher曾经的博士后杨剑教授，今天已经是国内的大千人，他们师徒有很多这个领域的开山之作
这各领域还有很多人，Jonathan priciard 和 jonathan flint两个该领域的开山鼻祖之一，斯坦福大学， 著名的polygenic adaptation，omini genetic model都是此人提出。
还有 Mathrew stephen ， Bogdan passaniuc 等 CNS无数的年轻大佬, 华人有 Zhiwu zhang , xiang zhou, xia shen等 CNS偶尔来一篇，这些人主要是统计遗传学，解决数量性状遗传机制研究中的一些统计方法，这几个人博士博后PI方向不变，工作异常系统。
2.人类进化
Svante Pääbo 古人类遗传学，奠基人之一，很多古DNA领域的方法，文章发现都是此人的创举。
该领域还有Mattias jakobsson，CNS如履平地。
3.医学
Kerstin Lindblad-Toh，从人类基因组计划就开始，到200 manmal project，45岁不到瑞典科学院院士，人类基因组和疾病领域大佬。
此处略去 英国welcome trust sanger institute 还有 broad institute的一票大佬。
4.进化数量遗传学
Leif Andersson，中瑞美，三国科学院院士，达尔文雀，马，兔子，鸡，猪，鸟，鱼，飞禽走兽各个都是CNS，更牛的是几乎每一篇CNS都是里程碑。
Trudy mackay 数量遗传学领域，果蝇大佬，美国院士，此处略去一票CNS
Lenoid kruglyak 数量领域酵母大佬，开山鼻祖，把酵母用于数量遗传学模式生物的第一人，很多数量理论的完善都出自此人。
5.农业领域，
曾经英国爱丁堡 Roslin institute是数量遗传学的发源地，但是现在已经全球开花。
玉米大佬 Edward buckler，玉米的奠基人之一 USDA-康奈尔联合教授，做玉米的很多文章都出自这里。
水稻大佬，韩斌，院士，中国水稻数量遗传学领域的很多经典之作出自他的课题组
黄学辉，韩斌老师的学生，已经是上海师范大学的杰青，水稻很多数量遗传学领域的很多经典之作的一作，前几天刚发了NG
麦类作物，主要是大麦 德国国家基因库IPK Nils Stein，很多基因组方面的工作，数量方面正在进行。
小麦方面有很多 可以关注小麦的基因组计划的成员组，代表性的有英国的John inns center的Anthony hall, 小麦数量做的很系统，中生代的有Kansas state 的 jessie Poland，还有国际玉米小麦改良在中心的若干大佬。
蔬菜类国内国际上可以领军的大佬，农科院基因组所的黄三文老师，番茄、黄瓜、土豆上有很多land mark之作。
夏威夷大学和福建农林的明瑞光老师，很多多倍体物种的，比如甘蔗，草莓，还有榕树等等基因组，很多领域内的land mark之作。
进化遗传学，国际领军 大佬 Craig Primmer 芬兰吐尔库大学， 很多经典之作。
进化群体遗传学 Nick Barton，维也纳biocerter 江湖上有他的传说，说他写的文章第一天投稿第二天发表，因为找不到能看懂的reviewer。群体遗传绝对的大佬
进化遗传学国内国际可以领军的大佬，四川大学刘建全老师，把很多经典之作都卸载了青藏高原上。
进化遗传学国内中生代大佬，农科院基因组所的程时峰老师，对于固氮，进化关键节点分支，有很多经典之作。
动物领域国内有中生代的，西北农林大学姜雨老师，四川农大李明洲老师
植物学领域，Deltlef weigel，植物学奠基人，毫不夸张的说拟南芥里任何一篇有国际影响力的文章他都是通讯作者，这个领域里大多数PI ，不是他组里的博士博后，就是他组里的访学。
维也纳biocenter的Magnus Norborg， 一人之力促成了拟南芥的1000 genome，绝对是领域内的国际领军。

太多了，二更都写不动了，改天继续三更
以上大佬学术没的说，但是并不是都推荐做导师哈，慎重选导师，自己栽坑里的和我没关系哈。
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你好，我是山石，山西农业大学（本）、天津大学（硕）、瑞典乌普萨拉大学（博），瑞典农业科学大学（博士后）。
在生命科学领域学习工作了15年，目前为瑞典农业大学生物大数据研究员。从普通二本院校到世界百强大学，一路踉跄走到了求学路的尽头。虽未获得成功，但是心中的小火苗还没有熄灭。此刻，怀着内心中剩下的执着和追求，开启了职场终身学习征程。
我同时是知乎、公众号和bilibili博主：数据科学那些事，日常分享生命科学领域升学、科研和工作必备成长技能与经验，欢迎围观。

感恩由您

都没人提SD的Trey Ideker吗?做出了cytoscope, 最近才发的nature method，用细胞层级结构模仿深度学习来也是相当惊艳。在系统生物学方面有独领风骚的潜质吧。而且颜值简直爆表。科研做得好，长得还特别特别帅，天理呢！！！只不过，有点小ZZ，会上遇到他跟他闲扯，然后发现他竟然都不知道中国有股票市场。看来人家真的是一心一意的做科研吧。当然说这么多，我的主旨思想还是，当然是我的甜美女神Aviv Regev最棒呀。反正我读她文章感觉像谈恋爱一样。那种从心底里被征服的感觉。其实很多人并不能完全用数据把实际的生物意义解释清楚。初看女神文章的时候，会觉得也不就是说说PCA的结果。但是再仔细读读，会发现，人人都用PCA，但是确实都没有女神用得好。女神不仅用自己数据用得转，还能用各种其他的omic data辅助证明。然后还能给你上实验证据。还能说啥，就只有服气。而且女神找的生物学意义都很好。完全不像（简直就是）是灌水或者炫富。

队长是我

搞这个不去欧美在亚洲没啥前途啊。没听说过新加坡的，CUHK的Kevin Yip好像还行（我指的是在他们那个圈子，他只能算还可以，和下面的人没有可比性），他是Mark Gerstein（Yale）的徒弟，Mark我就不用说了，当年和Mike Snyder（Stanford）黄金二人组。北美这边大佬是不少，啥Berger（MIT）啊，Autman（Stanford）啊，Pevzner（UCSD）啊，Troyanskaya（ Princeton）啊，但大佬的意思就是现在老了开始捞了，最适合搬出来镇妖辟邪，顺带缅怀过去。Kellis（MIT）算是兢兢业业力争永恒的大佬，但自从被其同门Pachter（Caltech）怒怼之后，也就再无好感，其师傅Berger一言不语坐山观虎斗，大佬的世界我们吃瓜群众真的不懂。当然怼归怼，这圈子牛文水货见怪不怪了，人家还是top发得飞起不是么，这就是大佬啊。现在真正冉冉升起的未来大佬，可以去看看Aviv Regev（Broad），业内都称之为Eric Lander接班人，年纪轻轻却手握千军万马，微微一笑就能一掷千金，这个圈子拼的是啥，是人是才是资源，但归根结底还是钱。看看Broad和Stanford，再看看CMU，你就知道他们不是在一个圈子的。还是不得不提Eran Segal（Weizmann Institute of Science），Daphne Kollar爱徒，也是唯一成功接过Kollar转型之棒的人，见过Segal你就知道原来做这个还真的可以只靠实力，也只能感叹他师傅在这条路上走的太远了。其他还有很多，绿叶先生（Greenleaf, Stanford），combio dl第一人Frey（UofT），Wing Wong（Stanford）统计派（Jun liu，Shirley Liu，Harvard），GWAS实力派Alke Price（Harvard），当年的辉煌Pritchard（Stanford），Cancer systems bio红旗手Raphael（Princeton）。写到这我只能感叹，大佬太多，找个属于自己的大佬好难。