在SNV/Indel和大片段CNV分析能力成熟化的当下,遗传病NGS检测产品如何体现出竞争力呢?笔者认为以下几个方面是重要的方向: 1. 拿证(这是句废话):大家都想拿,但很难,或许只能从特定基因/病种或用途入手。 2.丰富必要的检测内容,降低漏检风险: (1)对于拷贝数变异占比较高的基因,覆盖更多内含子区域可以提升外显子水平CNV的检出能力; (2)对于已报道的深度内含子或调控区致病变异,纳入检测; (3)线粒体基因组变异,很多公司已经纳入全外检测,但仍有一些公司没有纳入。 3.特殊变异类型的分析/提示能力:不需要100%准确,但需要较高的灵敏度,结合临床表型以提示进一步验证的必要性。 (1)重复单元较小且重复数较少的动态突变,是完全可以纳入常规分析的,对于鉴别诊断困难的疾病是必要的,如脊髓小脑性共济失调; (2)同源基因或真假基因相关变异的分析能力,如SMN1,CYP21A2。 4.数据解读的专业性和报告的可读性/可咨询性:目前来看,多数公司的变异解读非常潦草。基因检测报告过于简单,缺乏重点,拿着报告是没法咨询的。 5.自动化的必要性/弊端:自动化解读对于提高效率还是蛮重要的,可以让分析能力不足的医疗机构也能进行解读,但是遗传病的复杂性决定了自动解读出错的概率是很高的,缺乏真正懂解读的人,自动化解读报告的错误会造成严重后果。 |