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这一次,Illumina没有缺席!

2025-1-14 16:23| 编辑: 归去来兮| 查看: 163| 评论: 0|来源: 我是建设者

摘要: Illumina 在 2025 年开局很忙碌。

Illumina 2025 年开局很忙碌。

UKB建立蛋白组学大人群队列试点,拥抱NVIDIA GPU,加入打造世界上最大的基因数据库

Illumina宣布与 deCODE GeneticsStandard BioToolsTecanGSK、强生和诺华合作开展一项试点蛋白质组学计划,以分析 50,000 个英国生物库样本。

deCODE Genetics 将使用 Illumina Protein Prep 解决方案和 NovaSeq  X Plus 系统处理样本,并使用 DRAGEN 蛋白质定量流程进行分析。首批 3万个样本由 IlluminadeCODE Genetics Standard BioTools共同投资资助,并由 Tecan 提供自动化合作伙伴支持。UKB将在完成并经过质量控制后立即向科研界提供这首批 3万个样本生成的数据,预计在 2025 年下半年。

对于从另外 2万个样本中生成的数据,按照UKB的标准做法,行业联盟成员将拥有一段独家访问权。行业参与者包括 deCODE Genetics 和制药合作伙伴 GSK、强生和诺华。在此之后,UKB将向更广泛的科研界提供这些数据。Illumina 预计会有更多公司加入该联盟。

Illumina NVIDIA 建立合作,将 Illumina 的测序技术和 Illumina Connected Software NVIDIA 工具结合起来,开发生物基础模型。

Illumina已经提供了由 DRAGEN 提供支持的多组学产品、基因组学 AI 工具和 Illumina Connected Analytics 平台简化了基因组数据的生成和分析。现在,除了自身的努力之外,Illumina 还将寻求利用 NVIDIA Biology Foundation Model 研究团队和合作伙伴开发的模型来扩展其客户产品。客户还可以利用这些模型和他们自己的专有数据集来提高感兴趣的生物学相关任务的性能,例如细胞状态或基因转录预测。

在合作的第一阶段,Illumina NVIDIA 将致力于在 NVIDIA GPU 上启用 DRAGEN 算法。将 Illumina DRAGEN 引入 NVIDIA 加速计算将扩大 Illumina 多组学分析的可及性。两家公司还将努力将 NVIDIA 的图像处理和单细胞三级分析工具整合到 Illumina Connected Software 多组学模块中。

Illumina Regeneron共同投资了电子健康记录数据公司 Truveta,以创建世界上最大、最多样化的基因信息数据库。Illumina Regeneron 以及 Northwell Health Trinity Health 17 家医疗系统共计向 Truveta 优先股投资了 3.2 亿美元。Regeneron 承诺投资 1.195 亿美元,而 Illumina 则在 Truveta C 轮融资中投资 2000 万美元;合并后的金融持股意味着私人控股的 Truveta 估值超过 10 亿美元。

新的 Truveta 基因组计划旨在生成数千万名获得同意且匿名的志愿者的基因数据,确保全面涵盖各个血统、种族、性别和其他影响健康的社会因素。再生元遗传学中心将对首批一千万名志愿者的外显子组进行测序。

英国生物库拥有 50 万名参与者的基因和健康信息,是目前世界上最大的基因数据库。美国NIH全民研究计划” (AOR) 旨在提供至少一百万名研究参与者的数据。截至 2023 8 月,NIH 已创建了近 25万个全基因组序列。如果成功实施,Truveta将打造最大的基因数据库。

参考:
https://investor.illumina.com/news/press-release-details/2025/Illumina-and-NVIDIA-collaborate-to-decode-biology-and-propel-precision-health/default.aspx
https://investor.illumina.com/news/press-release-details/2025/Illumina-launches-pilot-proteomics-program-with-UK-Biobank-and-biopharma-collaborators-to-analyze-50000-samples/default.aspx
https://www.truveta.com/blog/news/saving-lives-with-genetic-data/

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