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院内NGS如何高效落地?

2024-10-23 16:21| 编辑: 归去来兮| 查看: 577| 评论: 0|来源: 小李叨叨

摘要: 道阻且长,行则将至。

上一篇文章,我们聊了肿瘤基因检测“入院”的“三足鼎立”:打包外送服务、院内NGS落地和院内PCR落地三种模式,引起了许多朋友的关注。文章发出后,后台有许多朋友问打包外送服务没有什么需要注意的地方以及如何高效NGS院内落地等多个问题

鉴于之前写过一篇关于打包外送服务需要注意的文章(戳:NGS外送服务“入院”,我们需要做些什么?),今天,我们就着重从降低成本和提高收益两个方面聊一聊高效NGS院内落地的几个措施,希望可以帮助有需要的朋友。以下内容均为个人观点,如有疑问,欢迎文末添加微信交流。

01 降低成本
提高院内NGS高效运营的第一个方向就是降低成本,根据之前文章所述,目前院内NGS落地所需要的成本主要有人工成本、仪器成本以及芯片成本三个成本。因此,降低上述三个成本是NGS高效运营的关键步骤。
降低人工成本:在NGS院内落地时,人工成本主要由销售人工成本和实验技术人员成本(公司技术人员+医院实验人员)组成,其中销售人工成本则根据各家公司的销售策略及医院的级别等多个因素而定,相对不可控,我们不做过多讨论。今天我们主要讨论降低实验技术人员成本的方案-NGS自动化检测。
NGS自动化检测:相较于PCR操作流程上的简单,NGS在实验操作中有着极其复杂的操作流程,包括提取、建库、杂交捕获、上机、生信分析、数据解读等多个流程。因此,在整个NGS实验中,至少需要6-7实验技术人员(湿实验、干实验、报告出具等),无疑是整个院内落地时人工成本的大头,所以可以通过实现自动化来减少相关实验技术人员的数量,进而降低人工成本。
如目前最为常见的自动化提取仪(纯化)、自动化建库仪(建库&杂交捕获)、生信分析自动化及报告解读一体机等单个模块的自动化;也有部分企业整合了全流程的自动化(如吉因加的“吉智号”)。大大减少了手工操作可能带来的误差、生信分析的差异及报告解读对人工的依赖等等;同时也减少了实验人员的数量,降低了实验技术人员这部分的人工成本。
下文为吉因加吉智号的宣传视频,供大家参考(吉因加的朋友记得打推广费

降低仪器成本:在整个基因检测过程中,需要用到诸多仪器设备,如离心机、PCR仪、测序仪、服务器等。其中测序仪是占整个仪器成本的大头,而随着上游测序仪厂家的不断增加,服务企业也有了更多的选择权。可以通过国产替代或品牌替代的方式降低仪器成本;此外,随着部分企业的转型,市场上会出现部分价格低廉的二手测序仪,也可以作为一个降低仪器成本的选择(其他仪器也可以参考上述方案)。
降低芯片成本:之前我们也讲到,在实验过程中占比最高的成本为芯片成本,因此,降低芯片成本可以大幅度降低院内NGS落地的试剂耗材成本,而芯片成本与开机频率及芯片大小有关,受检测周期及样本量大小影响。在检测周期相对固定的情况下(如10天),开机频率也相对固定(如一周一次);因此降低芯片成本最核心的办法就是提高样本量,降低单G数据的价格(芯片价格与芯片负载量大小成正比,而单G价格与芯片负载量大小成反比),可以采用凑样的方式(如病原、生殖、遗传、科研等样本)提高大芯片的使用率,降低整体芯片的价格。

02 提高收益
如上篇文章讲到,在终端收费价格及试剂盒进院价格相对固定的情况下,提高检测例数是提高收益的关键。而检测例数又受医院样本量和检测渗透率的影响;因此,提高医院样本量和检测渗透率成为了提高收益的关键因素。
区域检测中心:之前我们粗略计算过,在10%的基因检测渗透率下,单个医院年手术量要在1920台方可盈利平衡,进而导至可做院内落地的医院较少,且盈利较低。在现有医院手术量很难快速起量的情况下,建立区域检测中心则能够汇集检测中心区域内相关医院的样本集中在一起检测,进而提高整体的检测例数。
同时实现检验资源共享、检验质量同质化、检验服务标准化、检验结果互认的效果。如宁波市临床病理诊断中心就是由宁波市卫生健康委员会与复旦大学附属肿瘤医院合作建设的全国首家区域性临床病理诊断中心;服务了十七家医院的传统病理项目,而在分子病理高速发展的今天,其更能发挥其区域病理中心的优势。

国家卫健委也曾发布了《紧密型城市医疗集团建设试点工作方案》,提出了区域检测中心的一些试点方案,而对于基因检测公司而言,应积极纳入并辅助区域检测中心的建设中来,提高检测例数,进而提高收益。


提高检测渗透率:当医院样本量相对固定且无法建立区域检测中心时,可以通过提高基因检测渗透率来提高检测例数进而提高NGS院内落地的收益,而检测渗透率又受多个因素影响,如新靶点的不断发现、基因检测的市场教育、居民收入的提高及相关政策(医保)的影响等等。

随着众多靶点的各种药物获批,新靶点的发现越来越缓慢,且经历了十年市场教育后,将NGS纳入医保或可是当今提高检测渗透率的重要方式。相较于大部分省份已经将PCR方法学纳入了医保报销体系,只有少数省份将NGS方法学纳入医保报销体系(福建省个人支付10%,医保报销90%),极大限制了NGS在临床检测的应用。

有了医保的加持,患者在做基因检测时所承受的经济压力就会大大减少,进而能够提高肿瘤基因检测的渗透率,进而造福患者的同时提高院内NGS落地的收益。


03 小结

随着后续样本管控力度,院内NGS落地或可能是整个入院的重点,因此院内NGS高效落地或将成为未来的趋势。基于自动化、仪器耗材的成本降低则需要行业上下游企业的多方合作共同完成;而区域检测中心、医保政策等则需要整个行业在相关部门的指导下共同推进。

道阻且长,行则将至。

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