2021年2月9日,国务院发布最新版《医疗器械监督管理条例》(将于6月1日起施行),其中第 53 条提到“对于符合条件的医疗机构,可根据单位需求自行研发在国内暂无上市产品的体外诊断试剂,在医师指导下使用。”这将促进实验室自建检测方法(LDT)的发展,更好地助力精准医疗。
作为一种新型分子诊断技术,NGS检测不仅难以沿着传统IVD产品的市场准入路径快速获批和应用,而且在院内开展还有诸多硬件和人员方面的条件不成熟。这不仅加大了NGS产业的发展风险和负担,也阻碍了部分患者从中受益。NGS的临床应用离不开LDT。 图1.我国LDT发展现状 在国家政策逐步放开和鼓励有条件的医学检验部门适当发展LDT的背景下,翌圣推出LDT解决方案,一方面为第三方医学检验实验室服务,简化入院流程,节约入院成本,另一方面为有条件的医院中心实验室提供原料和性能验证服务,来满足日益增长的个体化医学和精准医学的临床需求。 图2.翌圣LDT整体解决方案 翌圣生物在NGS LDT入院已积累了丰富的经验,从NGS试剂供应到协同入院服务,我们提供完整解决方案;NGS要想真正地在医院内落地,很大程度上依赖性能优异的建库试剂盒。 图3.NGS建库流程 翌圣DNA建库和RNA建库拥有优越的产品性能,同时匹配华大智造MGISP-960,实现全自动化、标准化、规模化建库,成为LDT入院的好伴侣。 13577针对 300bp 的单一片段样本,使用 UDI 短接头(12405)时,连接效率为 95%,使用单端长接头(13519)时,连接效率为 93%。 图4.不同接头连接效率对比图 13577与竞品试剂在3种样本上建库,13577产量最优。下机数据捕获率、平均捕获深度和I*品牌相当,且与3家竞品试剂相比,13577 Dup值最低。 图5. 不同样本不同品牌文库产量及数据质量图 以100 ng 常规gDNA为模板,使用12195构建文库,片段化条件分别为37℃ 5/10/ 15/20/30 /40min,PCR扩增6个循环,文库峰型完美媲美机械法建库。 图6.不同酶切时间的文库主峰和产量图 以不同投入量的小牛gDNA为模板,使用12195搭配illumina&MGI长接头构建文库,最终文库产量12195优于竞品。 图7.不同样本不同品牌文库产量图 数据质量综合评分 12309ES测序数据对比到中华家系一号的参考数据集,以分值来代表SNR和RC的综合水平。 Great!12309ES的数据质量评分高达9.733 与标准物质参考数据集的基因表达差异倍数的准确性评价结果:12309ES的测序结果与中华家系 1 号全转录组 RNA 标准物质标准参考数据集差异分析,Pearson相关系数>0.94,基因定量水平具有高准确性。 图8.基因表达差异倍数与参考数据集一致性分析结果
✦ 翌圣生物 ✦ 翌圣生物科技(上海)股份有限公司是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事分子、蛋白和细胞三大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。核心产品覆盖qPCR系列、NGS系列、逆转录系列、核酸提取与纯化系列、PCR系列、分子克隆系列、体外转录系列、抗体、蛋白纯化系列、蛋白分析系列、重组蛋白、细胞分析系列、细胞培养系列、细胞转染系列、报告基因检测系列等多个品类,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。 |