近十余年来,针对融合基因的靶向治疗进展迅速,为特定融合基因阳性患者带来显著临床获益。然而,基因融合形成机制多样,检测方法众多,不同方法各有优缺点,在临床分子检测中相对复杂。本文从融合基因检测的临床意义、适用人群、常见融合基因的共性和特性、常用检测方法优缺点和检测策略优化等多个角度出发,基于国内外临床检测实践,达成非小细胞肺癌融合基因检测的中国专家共识,以规范融合基因的分子检测,精准筛选适合特定靶向治疗的患者人群。
融合基因是指两个不同基因的部分或全部序列相连形成的新的混合基因,其编码产生的融合蛋白能够介导肿瘤的发生发展。在非小细胞肺癌(NSCLC)中,基因融合作为一类重要的分子变异,是靶向治疗的理想靶点,因此,精准检测 NSCLC中的基因融合以筛选可从相应靶向治疗中获益的患者至关重要。但由于基因融合的形成机制多样,检测平台众多,其临床检测相对复杂,不同基因在检测上存在共性和特性,现有相关指南和共识或仅针对单个基因的检测,或针对整个 NSCLC 驱动基因变异谱的检测,缺乏针对融合基因、涵盖其共性和特性的检测临床实践共识意见,故不足以为融合基因的临床分子检测提供全面的指导和建议。因此,由具有丰富理论和检测实践经验的临床与病理专家共同发起并制定本共识,旨在为 NSCLC 融合基因的精准检测提供指导和帮助。基于靶向药物的可及性,共识将融合基因分为必检基因与扩展基因两类。
必检基因包括间变性淋巴瘤激酶(ALK)、c‑ros 原癌基因 1(ROS1)、转染重排原癌基因(RET)和神经营养因子受体酪氨酸激酶(NTRK)。
扩展基因主要包括神经调节蛋白(NRG)、成纤维细胞生长因子受体(FGFR)、间质表皮转化因子(MET)、表皮生长因子受体(EGFR)、人类表皮生长因子受体 2(HER2)和鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌同源体B1(BRAF)等(表1)。 各融合基因在NSCLC中的发生频率差异较大。需要特别说明的是,作为 NSCLC 驱动基因变异谱的一部分,尽管融合基因检测方法有其特性,但在临床实践中,检测策略的优化需综合考虑其他驱动基因的检测。
推荐意见1: 推荐病理学诊断为肺腺癌(包括含腺癌成分)的晚期初治 NSCLC 患者及靶向药物治疗后耐药的 NSCLC 患者进行融合基因检测(强烈推荐);建议经活检组织病理学诊断为非腺癌的晚期 NSCLC 患者及术后明确为浸润性腺癌的Ⅱ~ Ⅲ期NSCLC患者进行融合基因检测(推荐)。
推荐意见2:推荐首选肿瘤组织学标本进行融合基因检测,无法获取足够肿瘤组织学标本时,可选择细胞学标本。在检测融合基因前,由专业的病理医师对组织或细胞学标本进行肿瘤细胞含量评估(强烈推荐);无法获取足够肿瘤组织学或细胞学标本时,建议选择液体活检作为补充检测手段(推荐)。
推荐意见3:应根据送检标本类型、肿瘤细胞含量、标本质量、所检融合基因特点、平台可及性、检测周期及费用等因素,合理选择检测平台及方式,必要时可多平台互补和验证(强烈推荐)。
目前常用的融合基因检测方法包括荧光原位杂交(FISH)、免疫组织化学(IHC)、即时荧光定量聚合酶链反应(qRT‑PCR)和二代测序等。
推荐意见4:DNA 层面检出的罕见融合伴侣、外显子断点融合及基因间融合应在RNA或蛋白水平进一步验证(强烈推荐)。
推荐意见5:DNA水平检测驱动基因为阴性的NSCLC患者建议在RNA或蛋白水平进一步检测基因融合,尤其是年轻、女性、不吸烟、TMB低的黏液/实性肺腺癌患者(推荐)。
推荐意见6:对于必检融合基因,推荐使用二代测序或 qRT‑PCR 进行检测(强烈推荐),建议使用FISH进行检测(推荐)。
推荐意见7:推荐使用 IHC 检测 ALK 融合(强烈推荐),建议 IHC 仅用于 ROS1 和 NTRK 融合初筛,阳性结果需其他平台验证(推荐);不建议 IHC用于RET融合检测(推荐)。
推荐意见8:建议使用二代测序检测扩展融合基因(推荐)。
晚期初治非小细胞肺癌融合基因检测临床推荐路径
推荐意见9:基于靶点基因变异全面检测的必要性及平台的适用性,晚期初治 NSCLC 患者应通过二代测序或 qRT‑PCR 进行包括融合基因在内的多基因检测(强烈推荐)。
推荐意见10:靶向治疗耐药后再次活检的患者建议使用二代测序同时检测多种基因变异(推荐)
推荐意见 11:术后诊断为浸润性腺癌的Ⅱ~ Ⅲ期 NSCLC 患者建议通过 IHC 检测 ALK 融合,或通过 qRT‑PCR 或二代测序进行多基因检测(推荐)。 推荐意见12:如果不同检测平台的检测结果不一致,推荐用第3种平台进行验证(强烈推荐)。 推荐分级:共识共总结了12条检测相关意见要点,参考推荐等级的评估、制订和评价(GRADE)方法,分为“强烈推荐”“推荐” 和“无共识”3 个等级。其中专家组投“非常同意”的票数超过2/3的意见为“强烈推荐”,专家组投“非常同意”+“基本同意”的票数超过 2/3的意见为“推荐”,否则不达成共识。
整理自:《非小细胞肺癌融合基因检测临床实践中国专家共识(2023版)》
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