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mNGS在成人HAP中的临床应用专家共识发布

2023-6-15 16:31| 编辑: 归去来兮| 查看: 1572| 评论: 0|来源: 微远基因

摘要: 共识指出患者在流感病毒、冠状病毒等RNA病毒流行期间建议首选DNA和RNA同测。


导读


为促进和规范mNGS在医院HAP诊疗中的合理应用,促进病原体的诊断、正确判读检测结果,中国医学救援协会重症医学分会组织部分重症医学、呼吸病学、检验医学、急诊医学等相关领域的专家共同研讨制定,在《中国急救复苏与灾害医学杂志》发表《宏基因组学测序技术在成人医院获得性肺炎中的临床应用专家共识》。共识指出患者在流感病毒、冠状病毒等RNA病毒流行期间建议首选DNA和RNA同测。文末附原文获取方式,欢迎查看~


检测流程


共识1

建议HAP患者开展mNGS检测时,最好采集支气管肺泡灌洗液或者气道抽吸物。


共识2

建议HAP患者如存在免疫功能低下、基础疾病严重或病情危重时,且在经济允许的情况下,进行微生物培养送检的同时开展mNGS检测。


共识3

在流感病毒、冠状病毒等RNA病毒流行期间,建议HAP患者开展宏基因组检测时,首选DNA和RNA检测项目。


共识4

建议HAP患者开展mNGS检测时,要求相关实验室测序数据量至少保证10M以上。


共识5

建议HAP患者开展mNGS检测时,临床检测报告中要体现内参和对照品的检测合格性。


共识6

建议HAP患者开展mNGS检测时,检测结果要结合基础疾病史、临床其他检测结果综合考虑。


mNGS 报告解读


共识7

建议HAP患者开展mNGS检测时,如检测到多种细菌时,需要考虑混合感染,同时结合临床表现综合考虑主要感染源。


共识8

建议HAP患者开展mNGS检测时,如检测到毒力基因,需要重点考虑高毒力肺炎克雷伯菌,如检测到耐药基因,避免使用耐药基因对应的抗生素,但可以通过药敏试验对耐药基因进行验证。


共识9

建议HAP患者开展mNGS检测时,如患者为严重的粒细胞减少或严重的细胞免疫缺陷继发HAP时,除重点关注一般细菌外,真菌、病毒和胞内菌等机会性感染也需重点关注。


共识10

建议HAP患者开展mNGS检测时,如检测到嗜肺军团菌,需要考虑是否存在院内供水污染等情况。


共识11

建议HAP患者开展mNGS检测时,如检测到支原体和衣原体,需要考虑是否存在院内污染。


共识12

建议HAP患者开展mNGS检测时,如检测到常见的口腔定植菌,需要考虑是否存在机械通气和误吸等情况。


共识13

建议HAP患者开展mNGS检测时,如患者有持续性严重的免疫缺陷症如艾滋病、中性粒细胞减少症等,检测到真菌且针对用药无效时,需要结合流行病学情况等考虑真菌耐药的可能。


共识14

建议HAP患者开展mNGS检测时,如检测到常见的呼吸道相关病毒时,结合该病毒流行病学情况,同时关注患者是否存在流行病学接触史,参考血清IgM抗体和IgG抗体的情况综合考虑。


共识15

建议HAP患者开展mNGS时,如果检测结果为阴性,可以针对临床可疑的微生物进行PCR验证,同时阴性结果对于排除感染具有较好的阴性预测意义,但需要结合其他检测结果综合考虑。


以上内容来源:

罗亮,陈仲清,陈尔真等.宏基因组学测序技术在成人医院获得性肺炎中的临床应用专家共识[J].中国急救复苏与灾害医学杂志,2023,18(05):561-568.

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