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肠道菌群16S和宏基因组测序存在的问题(相对丰度)(续)

2023-4-25 10:29| 编辑: 归去来兮| 查看: 3479| 评论: 0|来源: 人体微生物组与健康 | 作者:肠菌康

摘要: 需要考虑每个人的肠道微生物载量,用绝对丰度进行比较。

上篇文章《肠道菌群16S和宏基因组测序存在的问题(相对丰度)》,已经写了相对丰度存在的问题,后台有一些朋友留言咨询,为了讲的更清楚,今天再举一个常见的例子:

地区1:共有1000万人口,存在白种人、黄种人和黑种人,分别占比40%,30%,30%。

地区2:共有400万人工,存在白种人和黑种人,各站50%。

如果只看相对丰度的话,那么白种人在地区1的比例小于其在地区2的比例(40%<50%)。

如果看人数的话,地区1有白种人400万,地区2则有白种人200万,地区1的白种人数>地区1的白种人数。

从上面的例子可以就可以看出相对丰度的问题了,比较同一个地区不同人种的多少是没有问题的,但是换到不同地区比较则存在问题了,因为不同地区的人口基数存在差别,只比较相对丰度可能就是错误的结论了。

回到肠道菌群来说,也是如此,对某个人的肠道菌群的组成进行研究,用相对丰度还是可以的,一旦涉及不同的人(或者不同的分组)进行比较,只用相对丰度可能就不够了,需要考虑每个人的肠道微生物载量,用绝对丰度进行比较。

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