重磅！华大基因提供本地化病原微生物测序一站式解决方案

2022-11-9 10:06| 编辑: 归去来兮| 查看: 2969| 评论: 0|来源: 华大医学

摘要: 基于在病原宏基因组高通量测序检测领域十年产品技术研发和五年临床转化经验

引言

病原宏基因组测序技术 (mNGS) 与传统病原检测技术相比，不依赖于假设，无需培养，可以无偏性的检测已知/未知病原体、混合感染以及新发病原等，具有良好的应用前景。由于mNGS检测对环境、设备和人员技术能力要求高，目前以能够完成高度复杂检验的专业机构开展检测服务为主。随着mNGS测序工具、自动化核酸提取建库仪、智能化生物信息学分析软件等技术的发展，同时为了更好结合临床信息及病情监测，已有一些医院尝试在本单位实验室内开展执行mNGS检测和结果报告全过程，即“病原体mNGS医院实验室本地化”^[1]。目前我国多地相关支持实验室自建检测方法 (LDT) 试点工作及国家卫健委贴息贷款项目的重大利好政策，极大地促进着精准医疗检测服务的发展。华大基因也一直致力于为各级医疗机构提供精准医学实验室综合解决方案。

基于在病原宏基因组高通量测序检测领域十年产品技术研发和五年临床转化经验，依托自主测序平台、核心数据库及算法，华大基因于2020年就推出了PMseq^®病原微生物测序专家系统，构建了从提取、建库、测序到分析的病原微生物测序本地化一站式整体解决方案。真正做到病原宏基因组测序检测实验室本地化，助力临床疑难危重感染性疾病的快速早期诊断，帮助临床对感染性疾病进行针对性治疗，最大程度降低患者死亡率，协助医生合理用药，助力感染性疾病的精准治愈。

PMseq^®病原测序专家系统采用联合探针锚定聚合测序法，对病原微生物进行宏基因组测序。采用自动化提取建库仪MGISP-100提取临床疑似感染标本中全部核酸并构建测序文库。成功构建的测序文库在高通量测序平台MGISEQ-2000/MGISEQ-200上进行上机测序，获得序列信息。通过本地PMseq Datician病原专家分析系统进行比对和智能化算法分析，无偏性的检测17,500种病原体及代表性耐药和毒力基因检测。显著提高病原诊断阳性率，指导临床靶向使用抗生素，协助感染的精准诊疗。

PMseq^®病原微生物测序专家系统

基因测序仪

MGISEQ系列国产自主基因测序仪，采用先进的联合探针锚定聚合技术 (cPAS) 和改进的DNA纳米球 (DNBs) 核心测序技术，将DNA分子锚与荧光探针在DNA纳米球上进行聚合，利用高分辨率成像系统对光信号进行采集，并通过对光信号的数字化处理，最终获得待测样本的碱基序列信息。

MGISEQ-2000和MGISEQ-200两款型号规格，可灵活满足临床不同需求。MGISEQ-200和MGISEQ-2000也已于2021年12月15日和12月20日分别获批变更预期用途，成为国内首批获准在临床上用于对来源于人体样本的DNA和RNA进行测序的产品。

2020年《中国宏基因组二代测序检测感染病原体的临床应用专家共识》指出：mNGS单样本测序数据量建议不低于20M^[2]。2022年《呼吸道传染病标本采集及检测专家共识》指出：对呼吸道样本的宏基因组测序，测序数据量要大于40M reads/样本，使用足够全的参考数据库，以防止假阴性^[3]。MGISEQ-2000和MGISEQ-200两款测序仪的有效测序序列分别可达1600-1800M和500M，一次支持16-48和4-12个样本检测，现PMseq本地化平台单样本检测数据量可达40-100M，更高数据量带来更高的检测敏感性，真正保障mNGS检测无偏性。

MGISP-100自动化样本制备系统

MGISP-100自动化样本制备系统是一款获NMPA批准的专注于高通量测序领域的自动化工作站。采用自动化的流程设计，对样本进行批量处理，省去人工实验的繁琐重复操作过程，提高文库制备的稳定性，降低总成本，全面提升实验室整体工作效率。

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