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    【专家论坛】病原宏基因组高通量测序性能确认方案

    2022-9-23 17:14| 编辑: 归去来兮| 查看: 9522| 评论: 0|来源: 中华检验医学杂志

    摘要: 目前，绝大部分的宏基因组学研究都集中在临床价值评价



    文章来源：中华检验医学杂志,  2022,45(9) : 899-905

    作者：张栋 张京家 杜娟 尚雪松 陈雨 吴洁 伊洁 杨卓 徐英春 杨启文




    摘要

    宏基因组学利用新一代高通量测序技术，以特定环境下病原体基因组为研究对象，在分析病原体多样性、种群结构、进化关系的基础上，进一步探究病原体的群体功能活性、相互作用及其与环境之间的关系，发掘潜在的生物学意义。目前，绝大部分的宏基因组学研究都集中在临床价值评价，宏基因组检测临床应用前分析性能确认的研究相对空白，北京协和医院检验科研究团队结合多年病原宏基因组检测的经验和国内外相关研究成果，就病原宏基因组项目医院本地化开展前的性能确认工作，从临床预期用途、方法学建立、性能确认、标准操作作业书4个方面提出了具体的实施方案，具体包含：标本类型和病原体范围、生物信息流程建立、生物信息分析参考盘制备和评估、湿实验流程的建立、背景核酸数据模型的建立、参考盘制备和全流程的性能确认等。




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