鱼龙混杂的基因检测中聊聊FISH-给基因检测非专业人士的建议

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FISH 独特的地位和优势
FISH（荧光标记原位杂交） 作为一种已在临床广泛开展的基因检测技术， 有其独特的地位和优
势。在细胞、组织仍存在的背景之下， FISH 明确、可靠的标记出了显微镜下肉眼可见的检测 DNA
大片段的数量、位置改变，优点包括：
 方法直接，可靠
 可以评估肿瘤的异质性
 特别能在基因扩增、基因融合的检测中发挥独特的优势，
实例 1： 比如 Her2 基因扩增的检测， FISH 可以正确选择癌巢区域，逐个计数 Her2 基因
扩增区域与相邻非扩增区域不同颜色杂交信号的比值，克服了其它 DNA 提取方法只能算
出基因扩增区域与非扩增区域平均值，从而受到肿瘤异质性影响的缺陷。
实例 2： 使用 RQ-PCR 和 NGS 检测 ALK 基因重排时，常常需要考虑到基因重排的断裂点，
并根据断裂点位置设计引物或捕获目标 DNA， 但是实际上基因融合的断裂点常常在一个相当大的范
围内变化；而 FISH 的探针设计把整个断裂点发生的范围都放在红绿信号之间的未覆盖区域，发生
在此区域任何一处的断裂重排都将导致红绿信号分离，所以可以有效地检测出更多的重排阳性结果， 图示如下：



二、给基因检测非专业人士的建议
1、 选择能够直接指导肿瘤用药的基因检测， 比如乳腺癌、 胃癌、 食道癌病人最重要的是完成 HER2
基因检测，而不是选择能成十成百的大数量的基因检测。 HER2 基因检测能将这些肿瘤的用药分成
两大类， 而最可靠直观的 HER2 基因检测是选用 FISH 的方法。但是非小细胞肺癌的病人宜先检测有
无 EGFR 序列异常， 再选择 FISH 方法逐项检测有无 ALK 的基因重排， 查到一项阳性， 则可选用相应
的靶向治疗，再复查结果。
2、病患确诊肿瘤后，开始治疗之前，必须要不失时机地对经手术、穿刺采集的肿瘤标本、进
行基因检测、对肿瘤进行分子分型，以便指导治疗。
3、不要轻言放弃，发现相关用药靶点突变时尽量把握更多的治疗机会，如未发现常见用药相
关的基因突变， 继续查验自己的肿瘤组织标本是否有罕见的用药相关基因变异， 这类罕见基因变异
可能有疗效甚明显的新药比如选择进行我们推出的 NTRK 基因重排检测。
4、根据基因变异种类，选用合适的检测方法。基因序列的改变，小片段的插入、缺失等首选
的测序即二代测序。大片段的扩增，基因重排，基因融合的检测则首选 FISH。

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