本研究纳入了2019年8月至2022年7月期间在三重大学医院妇产科(the Department of Obstetrics and Gynecology, Mie University Hospital)接受治疗的19例卵巢癌患者。首先,研究者在手术前从怀疑患有卵巢癌的患者处收集宫颈和子宫内膜液基细胞学标本。对于液基细胞学处理,根据制造商的方案,使用酒精含量为40.5%的CelVerse TM(Sysmex公司)作为细胞保存液,并在巴氏染色后使用光学显微镜进行细胞学诊断。从液基细胞学标本以及手术切除用于基因分析的癌组织切片中提取基因组DNA。将液基细胞学标本在 4°C 下冷藏保存,并根据制造商的说明,从液基细胞学标本中提取基因组 DNA。研究者通过检查在癌组织切片中检测到的致病性基因突变是否也能在宫颈和子宫内膜液基细胞学标本中检测到,来评估对液基细胞学标本进行基因分析在卵巢癌诊断中的作用。
NGS检测Panel覆盖了来自50个癌症相关基因的约2,800个突变热点区域。据报道,卵巢癌涉及《癌症体细胞突变目录》中常见癌症的体细胞突变,包括TP53、PIK3CA、KRAS、CTNNB1以及SWI/SNF相关、基质关联、肌动蛋白依赖的染色质调节因子A亚家族成员4(SMARCA4),本研究部分涵盖了这些基因。DNA测序的平均覆盖深度>1500倍。体细胞突变根据以下标准被归类为卵巢癌突变:i)肿瘤组织中体细胞突变的变异等位基因频率>5%,ii)液基细胞学标本中体细胞突变的变异等位基因频率>0.1%,以及iii)根据ClinVar数据库将突变登记为“致病性/可能致病性变异”。 研究结果
本研究表明,对宫颈和子宫内膜LBC样本进行的NGS分析显示,在42%的卵巢癌病例中检测到的基因突变与FFPE组织中的基因突变相似,其中包括宫颈和子宫内膜细胞学检查结果为阴性的病例以及早期病例。因此,对子宫内膜LBC样本进行的NGS分析可能是一种用于卵巢癌的有效筛查方法。
值得注意的是,已经开展了多项研究,使用来自宫颈和子宫内膜的LBC样本、子宫灌洗液、尿液和血液来进行卵巢癌的早期诊断。最近,NGS技术取得了显著进展,使得全面检测肿瘤组织DNA中的基因突变成为可能。FFPE组织通常用于NGS分析;然而,这些标本的质量在长期保存过程中会下降。因此,对于NGS分析而言,使用具有优异基因保存特性的酒精基细胞学标本更为合适。包括本研究在内的多项研究均报道,对子宫内膜癌患者的LBC标本进行NGS分析是有用的。作为一项初步实验,将卵巢癌细胞系(SKOV、OVTOKO)在作为细胞保存液的CelVerse TM中进行培养,并在4°C下冷藏保存,然后使用TaqMan®检测法计算长检测/短检测(L/S)比率。即使在保存约2年后,L/S比率仍高于0.2,这表明这些样本可以使用Ion AmpliSeq癌症热点检测Panel v2进行分析。
在日本,卵巢癌中胚系变异的比例约为18%,主要涉及的基因包括BRCA1、BRCA2、错配修复基因[MLH1、MLH2、MLH6和减数分裂后分离增加基因2]、RAD51旁系同源物D以及ATM基因。相比之下,据报道,TP53、PIC3CA、KRAS、ARID1A、CTNNB1、SMARCA4、BRCA1、BRCA2和ATR是卵巢癌中的驱动基因。
在本研究的19名患者中,有1名被诊断患有遗传性乳腺癌和卵巢癌(HBOC)。本研究中对基因组DNA的NGS分析未包括BRCA基因,而BRCA基因是与卵巢癌相关的最常见的胚系变异基因。因此,研究者仅检测了体细胞基因变异,而未检测胚系变异。关于体细胞基因变异,仅提取了TP53、PIC3CA、KRAS和CTNNB1基因,未检测到其他基因变异。在体细胞基因变异中,在所有HGSC病例中均检测到了TP53基因变异。由于HGSC起源于输卵管,据推测,由于输卵管中的浆液性癌病变,在子宫内膜中会检测到卵巢癌细胞。子宫灌洗导管已被用于检测可能从HGSC脱落的细胞中的肿瘤特异性TP53突变。在本研究中,HGSC的检出率为54.5%,高于其他组织学类型的检出率。由于HGSC患者的单因素分析显示STIC的存在与肿瘤组织切片和LBC标本的一致性相关,因此TP53也有望在早期病例中检测到,例如STIC病例。在两名被诊断患有低化疗敏感性CCC患者的LBC标本中检测到了基因突变。在手术前识别卵巢癌的组织学类型有助于确定治疗策略。
此外,本研究纳入了早期卵巢癌患者。局限性阶段的卵巢癌患者的5年生存率为93.2%,预后良好,开发一种用于卵巢癌早期诊断的方法将有助于改善预后。在本研究的6名早期患者中,5名患者的卵巢肿瘤大小为7-35厘米,而1名患者在临床随访期间被诊断为卵巢大小正常。超声检查和磁共振成像可用于诊断卵巢癌。然而,有2名无症状的晚期癌症患者是由其他科室诊断出来的。因此,需要建立用于早期检测卵巢癌的监测方法,尤其是对于如高级别浆液性癌这样的无症状病例。在本研究中,尽管宫颈和子宫内膜细胞学检查结果为阴性,但仍在3例病例中检测到了早期癌症。最近有报道称,血清微小核糖核酸(microRNA)分析可作为卵巢癌的一种早期诊断方法。这种方法对于二次筛查具有足够的准确性,但成本较高。因此,本研究提出的方法可能对高效的初步筛查有用。
本研究存在一些局限性。首先,这是一项回顾性研究,样本量较小。其次,仅纳入了被诊断患有卵巢癌的患者。因此,研究者评估了两例良性LBC患者,并没有在他们的宫颈和子宫内膜LBC标本中检测到任何基因突变。因此,在未来的研究中应评估无症状的卵巢癌患者。研究者认为本研究对于被认为发病率较高的遗传性乳腺癌和卵巢癌病例将是有用的,并且目前正在研究将本研究提出的方法应用于尚未接受降低风险的输卵管卵巢切除术的遗传性乳腺癌和卵巢癌患者。第三,宫颈和子宫内膜LBC分析检测卵巢癌的灵敏度为42%,较低。由于未纳入卵巢癌中的一些体细胞基因变异,研究者打算创建自己的基因检测Panel以提高检测率。此外,在从宫颈取样时,仅检测到1例(5%),即病例2,并且在该病例中,在子宫内膜中也检测到了突变。尽管仅进行子宫内膜细胞学检查可能足以进行检测,但通常仅进行宫颈细胞学检查来进行癌症筛查。目前,本研究结果表明,宫颈细胞学检查作为卵巢癌的筛查技术是不够的,但整合如DNA甲基化和循环肿瘤DNA等生物信息学方法可能会提高检测率。本研究作为该分析的基础数据可能具有重要意义。 总之,使用对宫颈和子宫内膜LBC标本进行的NGS分析检测卵巢癌的检出率为42%。研究结果还表明,卵巢癌有可能在早期被检测到。本研究的发现可作为一种无创筛查方法,用于检测与卵巢癌相关的体细胞突变并对卵巢癌进行分类。
参考文献:
Kubo-Kaneda M, Kondo E, Nimura R, et al. Analysis of endometrial liquid‑based cytology samples to detect somatic mutations and classify ovarian cancer. Oncol Lett. 2025;29(3):119. Published 2025 Jan 7. doi:10.3892/ol.2025.14866