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医体系
2025年03月27日 14:13
北京
PCR技术原理
聚合酶链式反应(PCR)是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA复制,PCR的最大特点是能将微量的DNA大幅增加。
1原理——DNA的半保留复制
DNA 在进行复制的时候链间氢键断裂,双链解旋分开,每条链作为模板在其上合成互补链,经过一系列酶的作用生成两个新的DNA分子。
PCR技术步骤
变性:(90℃-96℃):双链DNA模板在热作用下,氢键断裂,形成单链DNA。
退火:(60℃-65℃):系统温度降低,引物与DNA模板结合,形成局部双链。
延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性最佳)的作用下,以dNTP为原料,从引物的3′端开始以从5′→3′端的方向延伸,合成与模板互补的DNA链。
每一循环经过变性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍。如图所示:现在有些PCR因为扩增区很短,即使Taq酶活性不是最佳也能在很短的时间内复制完成,因此可以改为两步法,即退火和延伸同时在60℃-65℃间进行,以减少一次升降温过程,提高了反应速度。
PCR体系
PCR模板 PCR的模板可以是DNA,也可以是RNA。模板的取材主要依据PCR的扩增对象,可以是病原体标本如病毒、细菌、真菌等。也可以是病理生理标本如细胞、血液、羊水细胞等。法医学标本有血斑、精斑、毛发等。标本处理的基本要求是除去杂质,并部分纯化标本中的核酸。多数样品需要经过SDS和蛋白酶K处理。难以破碎的细菌,可用溶菌酶加EDTA处理。所得制DNA,经酚、氯仿抽提纯化,再用乙醇沉淀后用作PCR反应模板。
PCR引物设计 PCR引物设计PCR反应中有两条引物,即5′端引物和3′引物。设计引物时以一条DNA单链为基准(常以信息链为基准),5′端引物与位于待扩增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物与位于待扩增片段3′端的一小段DNA序列互补。(1)引物设计的基本原则引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C 过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列参照。引物内部不应出现互补序列。两个引物之间不应存在互补序列,尤其是避免3 ′端的互补重叠。引物与非特异扩增区的序列的同源性不要超过70%,引物3′末端连续8个碱基在待扩增区以外不能有完全互补序列,否则易导致非特异性扩增。引物3‘端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,最佳选择是G和C。引物的5′端可以修饰。如附加限制酶位点,引入突变位点,用生物素、荧光物质、地高辛标记,加入其它短序列,包括起始密码子、终止密码子等。(2)引物设计软件Primer Premier5.0 (自动搜索)vOligo6 (引物评价)vVector NTI SuitvDNAsisvOmigavDNAstarvPrimer3 (在线服务)
dNTPs dNTPs(核苷酸)由四个基本核苷酸组成。
缓冲体系 PCR buffer能够为DNA聚合酶活性提供适宜的化学环境。缓冲液pH通常为8.0-9.5,一般使用Tris-HCl来调节。镁离子作为DNA聚合酶活性的辅助因子,有助于聚合期间dNTP的结合。酶活性位点处的镁离子可催化引物的3′-OH与dNTP的磷酸基团间形成磷酸二酯键。此外, Mg2+ 能够稳定磷酸盐骨架上的负电荷,从而促进引物与DNA模板形成复合物。缓冲液的一个常见成分是来自KCl的钾离子,其可促进引物的吸附。也可使用硫酸铵(NH4)2SO4 代替KCl。铵离子(NH4+) 具有去稳定作用,尤其对于错配引物-模板复合物碱基对之间的弱氢键,因此可增强反应特异性。
DNA聚合酶 DNA聚合酶是PCR的重要组成部分,它们能够从单链DNA模板合成新的互补链。所有DNA聚合酶都具有 5′→ 3′ 聚合酶活性,即掺入核苷酸并使引物从按5'至3’方向延伸。 TaqDNA 聚合酶是从一种嗜热细菌中分离出来的,Taq DNA 聚合酶具有极高的热稳定性,或许能够承受 PCR 的热变性步骤。Pfu DNA聚合酶是一种为大家所熟知的超耐热酶,来自于水热环境中的超嗜热古细菌 Pyrococcus furiosus。在95°C下,Pfu聚合酶的稳定性能比 Taq聚合酶高20倍。高保真DNA聚合酶:其校正活性基于其 3′ → 5′核酸外切酶活性,可校正错误插入的核苷酸。DNA聚合酶上的核酸外切酶活性位点与其5′→ 3′聚合酶活性位点是分离的。当错配的核苷酸插入聚合结构域,DNA合成将因不合适的碱基配对动力学而暂停。暂停期间,DNA聚合酶将切除错配的核苷酸并用正确的核苷酸替换。
PCR实验操作
在进行基因克隆或者载体构建的实验中我们使用高保真DNA聚合酶
按照说明书准备高保真酶mix、DNA模板、引物、双蒸水查看引物单信息,核对引物浓度和Tm值
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PCR岗位能力培训
各相关单位及人员:为提升PCR技术应用水平,规范实验操作流程,培养专业技术人才,中国生物工程学会将举办PCR上岗培训。此次培训邀请业内资深专家,系统讲解理论知识、实验操作要点与质量控制等内容。相关事项如下:1. 培训时间:3月26日 - 3月31日2. 培训形式:采用网络直播授课,课程回放保留一年。3. 报名方式:联系官方报名联系人曹老师报名,报名成功后,我们将通过邮件和短信发送培训资料及直播链接。
4. 培训费用:本次培训收取费用2200元/人 ,包含培训资料费、专家授课费、考核及证书费。多人或一人多项报名有优惠。5. 证书颁发:培训结束后统一组织线上考试,成绩合格者将获中国生物工程学会颁发的PCR上岗培训证书,该证书是专业技能的有效证明。PCR技术在生命科学研究、临床诊断、疾病防控等领域至关重要,掌握这一技术是相关从业人员的必备技能。本次培训是提升专业技能的良好契机,欢迎各相关单位及人员踊跃报名参加!
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