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[分享] 现在基因测序这么发达了,还有必要学习测序的方法和理论知识吗?为什么?

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发表于 2025-3-10 20:39 | 显示全部楼层 |阅读模式
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发表于 2025-3-10 20:40 | 显示全部楼层
数学已经发展几千年了,还有必要学数学的基础知识吗?若果只是感兴趣,可以不,如果是你的职业或学业就需要。术业有专攻,就看你攻不攻。
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发表于 2025-3-10 20:41 | 显示全部楼层
有必要,深浅取决于工作方向和兴趣。
完全不感兴趣,工作也不相关的就算了,能知道亲子鉴定是啥就行了。
感兴趣,工作不相关的可以关注下无创检测原理,GWAS和面向用户的基因检测产品逻辑关系之类的。
工作相关,比如做转录表达机制研究的起码懂得测序结果怎么算基因表达量,可能的误差,PCR-DUP原理。做群体遗传的就得了解测序原理,分辨测序错误和个体变异。做组装的就得了解二代测序和三代测序优略。总之,只要工作相关就要尽可能多了解,别太迷信测序公司给的分析结果。
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发表于 2025-3-10 20:41 | 显示全部楼层
在读研期间,我思考这个问题不止一次,最后在买了一次教训之后,终于认定了还是该学的,而且要学好。
先说买了个什么教训吧,因为导师并不怎么管实验室,一些实验方案都需要自己设计。我当时想看处理因素对PAS选择的影响,当时可供选择的技术并不多,包括Tail-seq等;但因为自己贪图数据量,最后花了1.5倍的价格,测了全转录组(rRNA-depleted),分析的时候才发现远没有专用技术获取的PAS信息详细,而且因为引入了很多其他种类的变异检测,结果反而难以描述(做研究有时候需要从多数据层面看待,但阐释一个问题不能一味求全)。
其实就是自己没有认真去调查和理解不同的建库测序技术,也没有很好的将技术和自己的目的联系起来。
后面重新拿起了本科《生物信息学》课本,同时找公司业务员要了几本技术宣传册,下载了从Sanger到Nanopore的论文,花了很久“恶补了基础知识”。现在我不能说懂很多,但对不同的科研目的提出合理的测序安排,可能比大部分公司的业务人员要强很多。
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发表于 2025-3-10 20:41 | 显示全部楼层
我觉得很有必要,一般我们可以向测序公司表达我们的需求,得到我们想要的数据。如果我们想要挖掘更多的数据的话,还是需要我们自己了解测序以及数据处理相关原理,这个很重要。一个来自有过测序经历的人的经验。个人看法,仅供参考。
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发表于 2025-3-10 20:42 | 显示全部楼层
不积跬步,无以至千里,不积小流,无以成江河。
在发达的领域也需要往前演化,这一切都建立在扎实理论基础上。
比如手机其实发达到一个让几年前的笔记本都汗颜的程度,但是大家仍然要升级芯片制造技术,将它做的更好。因为只有这样才符合时代发展。
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