chemdraw和mestrenova预测的核磁共振氢谱结果，哪一个预测更准确?

wolf

chemdraw和mestrenova预测的核磁共振氢谱结果，哪一个预测更准确?
原文地址：https://www.zhihu.com/question/331796956

队长是我

相信做有机合成的科研人员来说，对核磁都不会陌生，在有机合成中，化合物的表征是必不可少的，最基本表征手段就是核磁，核磁氢谱的解析体现一个人的基本功，以及知识储备。很多人在解析核磁的时候，往往先会用ChemDraw模拟一下出峰位置，然后再与自己的样品核磁对照，也有的用MestReNova来模拟，但是在没有数据库的前提下，模拟也不尽如意。但是高斯通过理论计算的方法，来模拟NMR,就比较精确，今天就为大家带来怎么用高斯模拟NMR。首先介绍一下大体过程。首先声明本方法比较适用于高斯新手，对于高手，就任意了。首先，因为Gaussview建立模型新手可能不熟悉，所以你可以用chemoffice,辅助建立模型：即在chemdraw里面画好分子式，导入chem3D里面，生成gjf格式文件，然后导出gjf名称记为12.gjf。接下来编辑文本，对于新手来说，一定注意空行。（注意，因为在windows下因为内存有限，所以输入格式都是Linux版本的）
1输入计算基组：输入保存路径，%chk=12.chk
2:计算方法# opt freq B3LYP/6-31G* scrf(SMD,solvent=chloroform)NMR




3:Linux计算
在路径下，打开终端，输入：g16 <12.gjf | tee 12.out 回车即可看到计算过程。
假如你需要在Gaussview下观看结果的话，需要将chk 转换成fch才可以在Windows下打开。
具体操作为：formchk 12.chk 回车即可。

量子化学论坛，Sobereva大神的一个帖子说明，标度法是用来计算化学位移的一种又准又便宜的方法，用这种方法计算化学位移(δ)的方式是
δ=(截距-σiso)/(-斜率)，（一般用氯仿作溶剂。）截距和斜率通过查表即可得到对应基组的值。（要找到最合用的级别，一方面是看RMSD值（相对于实验值的均方根误差），另一方面是看计算用的基组。RMSD又低，基组又小的级别是我们需要的。）




所以我们只需要在计算结果中找到Isotropic（平均值）,代入即可。
看不大懂没关系，看看下面两个视频就会啦！
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核磁模拟谁说了算，高斯告诉你！

同花顺

经验来看，两个软件的氢谱，低到高顺序上大多数没有问题，具体在哪里需要自己解。还有就是复杂结构的软件模拟完全不能看的，比如甾体类化合物。另外就是氘代试剂的问题了，好像也需要去比对。

队长是我

这只是一个通过计算预测的值，两种软件使用不同算法得出不同的结果很正常
不过chemdraw对于结构复杂的化合物预测出的值，有时候是会有些差异的。

继续前进

MestReNova能根据相似结构修正化学位移，如果你买了谱库并精心维护，添加砌块并耐心归属入库谱图，其预测结果最佳。Chemdraw的化学位移是通过特征值＋线性组合出来的，分子结构稍复杂点就歇菜了。
既有化合物的谱图应优先参考文献的表征图谱。真想要高质量的预测光谱，还是选好基组，用计算化学软件Gaussian。

长长的路

个人认为chemdraw mestrenova以及scifinder上的预测看看就好，还是要找标谱/自己做出全套谱解谱
但当然了，即便是文献给的标谱也要有怀疑精神，我最近就被文献里的一个标谱坑了，他给的标谱是错的