生物信息学基础知识（二）

风云

序列比对
一、序列比对及计分矩阵
1、全局比对
针对全长序列进行比对
2、局部比对
得到序列比对中得分最高的片段
<hr/>常用比对软件
bwa
blast系列
hisat2
bowtie2
minimap2
diamond
<hr/>系统发生树构建
一、基于SNP
1、距离矩阵法
（1）UPGMA法
（2）邻接法
（3）最小进化法
2、最大似然法
3、最大简约法
4、贝叶斯法
二、基于字符串
1、基因组组分矢量法
<hr/>常见组学
基因组
转录组
表观组
蛋白质组
代谢组
单细胞组
免疫组
微生物组

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