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16日,记者从上海交通大学海南研究院获悉,日前,我国首台全自动核酸蛋白共提取平台在三亚崖州湾科技城投入启用。这是由上海交通大学海南研究院深部生命国际研究中心三亚崖州湾研究基地原创实验技术、华大集团定制开发的。与人工操作相比,该平台的样本处理通量和效率提升10倍以上,实验成本指数级降低。
据了解,全自动核酸蛋白共提取平台是通过全自动机器人整合不同功能仪器,采用工位流水线设计理念,用于各类生物样本的蛋白、核酸自动化高通量共提取,实现从一份样本中同时提取出核酸和蛋白并完成肽段制备,并记录过程中产生的实验数据,高效智能地对接下游的核酸建库、测序、质谱检测等实验流程,提高效率、缩短科研的周期、加快各类资源开发进度。
我国首台全自动核酸蛋白共提取平台。记者 利声富 摄
“该平台适用于深海微生物样本等低生物量的珍贵样本提取,可有助于提高实验效率、缩短数据产生周期,便于及时反馈科研结果并加快各类生物资源开发进度。”上海交通大学海南研究院、深部生命国际研究中心科研人员章陶亮透露,目前,传统人工手工操作核酸蛋白共提取实验,一份样本从提取到拿到核酸和蛋白(不包括DNA建库和制备肽段)需要一天半时间,其中包括过夜孵育时间。对于纯菌样本,一个人一次可完成12-24个样本,对于沉积物样本,一个人一次可以完成8个样本,限速步骤为离心机的孔位数。自动化核酸蛋白共提取,对于纯菌样本,可同时进行2个96孔板的交替提取,在相同时间段内一次就能够完成192个样本的提取,产线产能理论效率比手工提高8倍。
上海交通大学深部生命国际研究中心主任、海南研究院肖湘教授介绍,深部生命国际研究中心崖州湾研究基地,聚焦海南独特的深海特色,以深海装备和技术体系为高起点,充分发挥海南已有的深海布局优势,围绕深海微生物资源采集、培养、挖掘、开发等关键技术环节,积极布局发展配套设备和标准化、规范化、自动化的共性技术体系,建设自动化样本库与菌株库、高通量核酸蛋白共提取系统、高通量厌氧微生物分离培养系统等全国产化技术与硬件设备,在海南率先实现深海微生物资源获取和开发的数字化与智能化。其中,全自动核酸蛋白共提取平台等系列自动化科研平台的建设,将推动深海微生物菌种获取速度提升10倍、产生数据的效率提升百倍,标准化、高效化、智能化的平台建设将有力推动海南深海微生物资源产业化发展进程。
据了解,深部生命国际研究中心崖州湾研究基地建设包含菌株、酶和化合物“三位一体”的深海微生物资源开发流程,以缓解当前陆地生物资源枯竭、合成生物学“卡脖子”技术等生物产业关键瓶颈。并抓住当前人工智能、大数据等发展机遇,实现深海微生物资源的数字化与智能化,构建人造超级细胞和生态系统,打通深海微生物资源发掘“产学研”全流程,助力海南深海微生物资源产业化发展。
原文地址:https://www.zhihu.com/question/12481231486 |
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