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离子交换层析实验指南
离子交换层析(Ion Exchange Chromatography, IEX)是一种基于蛋白等电点(pI)和缓冲液 pH 之间的电荷差异,利用离子交换介质对带正电(阳离子交换)或负电(阴离子交换)的蛋白进行分离的方法。该方法可用于蛋白纯化、去除杂质、浓缩目标蛋白等。
1. 实验原理
离子交换层析依赖于蛋白的净电荷与固定相的相互作用:
- 阳离子交换层析(Cation Exchange, CEX):固定相带负电,结合带正电的蛋白(pH < pI)。常用填料:CM-Cellulose, SP-Sepharose。
- 阴离子交换层析(Anion Exchange, AEX):固定相带正电,结合带负电的蛋白(pH > pI)。常用填料:DEAE-Cellulose, Q-Sepharose。
在不同盐浓度(如 NaCl 梯度)或 pH 梯度的作用下,结合的蛋白被依次洗脱,实现分离。
<hr/>2. 实验材料与设备
(1) 试剂与填料
- 离子交换填料(如 Q Sepharose Fast Flow, SP Sepharose Fast Flow)。
- 缓冲液(一般选择 pKa 接近目标蛋白 pI 的缓冲体系)。常用缓冲液:
- Tris-HCl(pH 7.0-8.5)
- HEPES(pH 6.8-8.2)
- MES(pH 5.5-6.7)
- 洗脱盐溶液:通常为 0-1 M NaCl 梯度洗脱,或 KCl、(NH₄)₂SO₄。
(2) 设备
- 层析柱(如 HiTrap Q FF 5 mL, HiTrap SP FF 5 mL)。
- 层析系统(Hass25 AKTA、FPLC等)。(图例使用辉因科技全具备自主知识产权国产蛋白纯化系统Hy-Hass25)
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辉因科技蛋白纯化系统Hy-Hass25
<hr/>3. 实验步骤
Step 1. 预处理
- 细胞裂解、离心(10,000 x g, 10 min),取上清。
- 0.22 μm 过滤,去除颗粒和杂质。
- 调节缓冲液 pH 以确保目标蛋白带相应电荷(pH < pI 选 CEX,pH > pI 选 AEX)。
- 调节离子强度,低盐(<50 mM NaCl)可增强蛋白吸附。
<li data-pid="T7kmIV5Q">柱子平衡:
- 用 5 倍柱体积(CV)的平衡缓冲液清洗柱子,流速 1-2 mL/min。
- 监测 280 nm 吸光度,确保基线稳定。
<hr/>Step 2. 蛋白结合
- 以 1 mL/min 低流速 加载蛋白(最大不超过柱体积的 10%)。
- 监测 280 nm,确保蛋白吸附完全(流出液 A280 降低)。
<li data-pid="VkoHng50">洗涤杂质:
- 继续用平衡缓冲液清洗柱子,直到流出液 A280 降至基线(去除未结合蛋白)。
<hr/>Step 3. 洗脱蛋白
- 使用 0-1 M NaCl 线性梯度(通常 10-20 CV)。
- 逐步增加盐浓度,使不同结合力的蛋白依次洗脱。
- 监测 280 nm,记录蛋白洗脱峰。
<li data-pid="AcmDX8Ae">等度洗脱(可选):
- 直接用 0.5-1 M NaCl 缓冲液一步洗脱目标蛋白(适用于已知洗脱条件的蛋白)。
<hr/>Step 4. 分段收集与后处理
- 根据 UV 吸收峰,分段收集蛋白组分。
- 用 SDS-PAGE 确定目标蛋白所在的洗脱组分。
<li data-pid="bpsV4A_N">缓冲液置换:
- 透析或超滤换至目标缓冲液(如 PBS、Tris-HCl)。
- 浓缩蛋白(如使用 10 kDa 超滤离心管)。
<hr/>4. 优化策略
(1) 提高分辨率
- 降低流速(0.5-1 mL/min),减少峰扩散。
- 优化梯度洗脱(线性梯度 vs. 分步梯度)。
(2) 提高结合效率
- 选择合适的 pH,使蛋白带足够电荷。
- 低离子强度(<50 mM NaCl)有助于蛋白结合。
(3) 目标蛋白洗脱优化
- 低 pH 或高 pH 改变蛋白电荷状态,帮助洗脱。
- 除了 NaCl,也可尝试 KCl 或 (NH₄)₂SO₄。
<hr/>5. 结果分析
- SDS-PAGE:检测目标蛋白的纯度。
- UV 280 nm 吸收峰:确认目标蛋白的洗脱位置。
- 蛋白浓度测定(Bradford/BCA 法):计算蛋白回收率。
<hr/>6. 常见问题及解决方案
问题 | 可能原因 | 解决方案 | 目标蛋白未结合柱子 | pH 不合适,蛋白未带电 | 调整 pH 使蛋白带电 | 目标蛋白流失在洗脱前 | 样品盐浓度过高 | 降低 NaCl 浓度 <50 mM | 目标蛋白洗脱不完全 | 盐浓度不够 | 提高 NaCl 梯度(0-1 M) | 目标蛋白变性 | pH 过低或过高 | 选择温和 pH(pH 6-8) | <hr/>7. 典型实验参数
参数 | 设定值 | 柱体积 | 5 mL (HiTrap Q/SP) | 流速 | 1 mL/min | 平衡缓冲液 | 20 mM Tris-HCl (pH 7.4), 50 mM NaCl | 洗脱方式 | 0-1 M NaCl 梯度洗脱 (20 CV) | 收集方式 | 1 mL 分段收集 | 仪器 | 尽量选择优质稳定的仪器,这样可以去除设备因素 | 总结
离子交换层析是一种高效的蛋白纯化方法,通过调节 pH 和盐梯度,可获得高纯度目标蛋白。合理选择 缓冲体系、填料和梯度洗脱方式,可显著提高分辨率和回收率。
如果你有特定蛋白或设备的需求,可进一步优化实验条件!
原文地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/22274328170 |
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