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[分享] 拿捏多酚多糖样本核酸提取,小白也能秒变实验大神

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发表于 2025-2-18 13:14 | 显示全部楼层 |阅读模式

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一、试剂盒法
1、原理:利用硅胶膜、磁珠等对核酸的特异性吸附,结合缓冲液体系,实现核酸的分离纯化。
2、步骤:按试剂盒说明书操作,通常是样本裂解后与结合液混合,转移到吸附柱或加入磁珠,经洗涤、洗脱等步骤获得核酸。




3、各个组分的原理及作用
裂解液
    原理:
(1)含SDS等表面活性剂,分子一端亲水、一端疏水。细胞的膜由磷脂双分子层构成,有疏水内核和亲水表面。SDS疏水端插入细胞膜磷脂双分子层,破坏膜结构,亲水端与水作用,使膜瓦解,释放细胞内物质。
(2)可能含蛋白酶K,作用于蛋白质肽键,通过水解切断肽链。细胞内核酸与蛋白质结合成复合物,蛋白酶K将蛋白质分解,使核酸释放。
    作用:
    使细胞破碎,释放核酸、蛋白质、多糖等细胞内物质,为后续核酸提取分离创造条件。


蛋白酶K
    原理:
    是一种丝氨酸蛋白酶,能特异性地切割蛋白质中的肽键,对多种天然蛋白质都有水解作用。
    作用:
    在裂解细胞的过程中,降解与核酸紧密结合的组蛋白、核蛋白等蛋白质,使核酸充分释放,同时也可防止蛋白质对后续核酸提取步骤的干扰。


洗涤液
    原理:
    通常由乙醇、异丙醇等有机溶剂和一定浓度的盐组成,乙醇、异丙醇等有机溶剂能使蛋白质变性沉淀,破坏蛋白质的空间结构,使其从核酸上脱离。同时,这些有机溶剂还能溶解脂质等杂质,起到去除杂质的作用。盐在洗涤液中可提供一定的离子强度,维持核酸与吸附介质之间的静电相互作用等,防止核酸因静电斥力等原因从吸附介质上脱落,保证核酸仍吸附在介质上,而杂质被去除。
    作用:
    去除与核酸共吸附的杂质,提高核酸的纯度。


洗脱液
    原理:
    一般为TE缓冲液或去离子水,TE缓冲液中的Tris是一种两性物质,在不同pH值环境下可通过质子化和去质子化来调节溶液的pH值,使溶液保持在一个稳定的pH范围,为核酸提供稳定的化学环境。EDTA能与二价金属离子如镁离子、钙离子等形成稳定的络合物,而核酸酶的活性通常依赖于这些金属离子,EDTA螯合金属离子后,可抑制核酸酶的活性,防止核酸被降解;去离子水其离子强度极低,当用去离子水作为洗脱液时,破坏了核酸与吸附介质之间的离子平衡,使核酸从吸附介质上解吸附,进入水溶液中。
    作用:
    将吸附在硅胶膜或磁珠上的核酸洗脱下来,得到纯净的核酸溶液,便于后续实验使用。


磁珠
    原理:
    磁珠表面的硅羟基在结合液存在的条件下,硅羟基上的氧原子可与核酸磷酸基团上的氢原子形成氢键,同时硅羟基带负电,核酸的磷酸基团也带负电,但在高盐环境下,阳离子的存在屏蔽了部分电荷,使两者之间的静电斥力减小,静电引力增强,从而实现磁珠与核酸的特异性吸附。
    作用:
    作为核酸的吸附载体,利用磁珠的超顺磁性,在外加磁场作用下可快速实现核酸与溶液中其他杂质的分离,操作简便、快速,适合自动化操作。


硅胶膜
    原理:
    在高盐低pH值条件下,硅胶膜表面的硅羟基质子化程度增加,带更多正电荷,与带负电荷的核酸磷酸基团之间的静电相互作用增强,同时氢键作用也增强,使核酸牢固地结合在硅胶膜上。而在低盐高pH值条件下,硅羟基去质子化,带负电荷增多,与核酸之间的静电斥力增大,结合力减弱,核酸从硅胶膜上被洗脱下来。
    作用:
    在核酸提取过程中作为固相载体,特异性吸附核酸,通过离心等操作实现核酸与其他杂质的分离,经过洗涤、洗脱等步骤可获得纯净的核酸。


4、步骤:按试剂盒说明书操作,通常是样本裂解后与结合液混合,转移到吸附柱或加入磁珠,经洗涤、洗脱等步骤获得核酸。
5、注意事项:要严格按说明书控制各步骤的时间和试剂用量,选择适合多酚多糖样本的试剂盒。
二、CTAB法
1、原理:CTAB是一种阳离子去污剂,可与核酸形成复合物,在高盐溶液中溶解,而多糖等杂质在低盐浓度下沉淀。
2、步骤:将样本研磨后加入CTAB提取缓冲液,65℃水浴使细胞裂解,加氯仿-异戊醇抽提,离心取上清,加异丙醇或乙醇沉淀核酸,70%乙醇洗涤后晾干,用TE缓冲液或水溶解核酸。
3、注意事项:CTAB浓度、提取时间和温度等会影响提取效果,多糖含量高时可增加氯仿-异戊醇抽提次数。


三、SDS法
1、原理:SDS是阴离子去污剂,能裂解细胞、使蛋白质变性,释放核酸,通过后续沉淀等步骤分离核酸。
2、步骤:样本加SDS裂解液裂解,加蛋白酶K消化蛋白质,加酚-氯仿-异戊醇抽提,离心取上清,用乙醇或异丙醇沉淀核酸,洗涤干燥后溶解。
3、注意事项:蛋白酶K的用量和消化时间要适当,防止核酸降解。酚具有腐蚀性,操作要戴手套和护目镜。


四、产品介绍







原文地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/24288791334
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