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[分享] 生物信息学到底是怎样的学科呢?,毕业之后可以干什么?

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发表于 2025-1-28 19:08 | 显示全部楼层 |阅读模式

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是一名高中生,第一次听说生物信息学是在生物课本上,出于对生物的热爱我搜了搜这个专业,我挺想学习这个专业的,因为我也很喜欢计算机,我在高中也搞过信竞(虽然最后就拿了个省二,但我也并不后悔学竞赛的这段经历。)
在我搜了很多材料的境况下,我觉得我还是不太清楚这门学科究竟在干什么,毕业之后就能干什么呢?能解答一下吗?
在我这里本科能报生信的大学也不多,如果了解华中农业大学的生信或者南京医科大学的生信的能否说一下对于这个专业都在学习什么呢?以及这两所大学的生信专业怎么样呢?
谢谢回答。

原文地址:https://www.zhihu.com/question/529489312
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发表于 2025-1-28 19:09 | 显示全部楼层
我只是一个生信大三的学生。观点可能不是十分正确。
生信的范围很广。alphafold预测蛋白质结构理论上是生信。但是这是属于少数人的生信。目前利用二代测序数据,单细胞测序数据进行一些研究是大多数人的生信。所以说生信有好多个领域,每个领域有好多个层次。但是不管哪个领域,如果想要去到高层次的话,数学、生物、计算机、统计学的理论知识和能力都是非常重要的。比如生信做软件开发和各种R包,python包开发的,可能会有很多计算机专业背景的人过来。比如做系统生物学的(严格意义上不算生信,这个学科是对各种生物过程进行数学建模。但是这两个学科有相似性,就一起说了),因为需要比较强的数学功底,顶尖的人也有很多数学物理背景出身的。
举一些例子吧。比如说计算机方面:如何考虑两条基因序列的相似性?如何利用计算机去解决?可能一想很简单,但是如果考虑序列的长度呢?就是可能两条序列长度不同,但其实中间只是有些片段不一样,同时还有密码子的简并性,这些都可能导致最后形成的蛋白质区别不大,那么从生物学上他们是相似的。怎么用程序去解决这类问题?
因为还有很多问题涉及到比较深的高数线代概率论与数理统计知识(对我来讲比较深,我这方面比较菜,哈哈),可能看回答的高中生居多,就不赘述了。不过可以留一个小问题:一组癌症病人和一组正常人的x基因的表达量(可以理解为mRNA量)差别很大,请问差别多大才能认为基因x的表达量可能影响了癌症的发生。
但是也有很多临床,基础医学,分子生物学等专业的同学也会利用开发好的生物信息学工具,完成自己的任务。他们不需要百分之百理解生信背后的原理。这些可能很多是干湿结合,就是既做生物学实验,也做生信分析。主要工作就是跑跑流程或者进行一些个性化的定制的生信,这种也需要一定的数学和计算机的理解,但是没有那么高。
生信本科毕业后可以干的不多,销售居多(感觉,不一定对)硕士生一般可以进入一些生物或者医药公司。博士可以考虑公司,高校,研究所、医院。转专业的话,比较多的人应该是转码。
关于生信考公,听说过某位师兄考公时报生物学方向的公务员,审查是过了的。但是这个不一定。有考公意愿的同学建议咨询清楚。
最后欢迎大家的批评与讨论。
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发表于 2025-1-28 19:10 | 显示全部楼层
谢邀
先说一下自己背景,本科+研究生,基础数学+物理的,毕业方向是微分方程的长时间稳定性理论。说人话就是研究方程性质的。
毕业机缘巧合入行医疗,开始在科研公司呆过,接触了宏组学(就是一堆物质混在一起研究RNA、DNA、微生物的序列信息);后来开始就是DNA的肿瘤临床工作,所以一般临床上的MRI、病理SVS、IHC都接触过,后续的测序数据、应用也都做过。现在因为工作原因,接触了蛋白质组学、代谢组学的MS分析的流程。
虽然上面很多工作不算传统的生信范围之内,但像北大、山大的生信科都学习过。基本别人说的方法或者给老师医生设计一个文章方法还是没问题的。
所以,我的背景肯定不如科班出生的人好,所以建议也就参考一下。
在你读大学之后,可能会发现各门课程差异越来越大。但核心的问题都是两个:

  • 理解问题。包括拆解问题的能力、搜索文献理解问题等;
  • 解决问题的技能。包括你能使用现成工具,自己写工具或者找别人要工具的能力;
理解问题决定了在这个方向的下限、而解决问题的能力决定你在这个方向的多上限。
回到生物信息的学习。
当入行的时候最大的问题就是听不懂别人要的东西是什么,概念有什么区别。所以犯过很多错误,虽然不是故意的,但有些知识你知道哪里不会就知道去哪补充后者百度谷歌,但如果你都不知道那里有问题,那搜什么呢?
所以如果作生信需要懂得生物学家的语言、他们的数据形式、原理,怎么提取特征、数值化;
但如果你不懂后面计算,你拿到这些数据怎么描述给计算机那些作为输入,哪些作为无用信息。
所以,如果你懂得计算机和生物医学问题,那么你就可以一面和PI互相沟通,一面又可以把工作进行拆分,找个最合适的人完成这个工作。


最后,回到你提出的问题。
毕业后工作内容,其实这个问题决定你之前学习的能力范围,未来,越来越少的需求是跑流程的人,更多的是需要创新出好的方法,能够解决问题的人。如同上面的金字塔,最底层数据提供者、中层是知识提供者、最上层是方法解决者。
这些方向都是需要人的,但是你毕业在哪个层级工作决定你之前的知识积累。
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发表于 2025-1-28 19:10 | 显示全部楼层
有比较好的数理功底,对数理类计算机类和生物信息学感兴趣,建议本科报考至少中上游985对应比较强势的计算机,自动化,甚至数学应用数学专业,期间辅修甚至自学生物化学,分子生物学,遗传学,细胞生物学,生物信息学算法等课即可。。。这个专业其实不只是在生科院,像有些学校的数学系,自动化系,统计系,,都会从这个专业和方向招研究生,,,这个专业也是得读到博,但从这些专业入门会有更高的上限,更好的退路
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发表于 2025-1-28 19:11 | 显示全部楼层
仅说生信,南医和华农,南医生信基本没听过,华农生信本科教育还是挺强的。当然去一线肯定机会更多,选择也更多。生信是个小专业,全国高校全部的生信专业的打分和排名应该是可以查的到的,报考前可以查下。
未来发展而言,生信这个专业转码,出国都是相对容易的,普通人家孩子大多转行在互联网大厂国企,科研好的基本就国内外读博走学术道路。
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发表于 2025-1-28 19:11 | 显示全部楼层
本人本科生物信息专业毕业于天津医科大学,目前马上从清华大学博士毕业。2013年入学的时候曾经有和题主一样的问题疑问。生物信息到底是什么样的学科,相信题主已经网搜了很多内容了,基本和网上信息差不多,是一门实打实的交叉学科,这里就概念不再讨论了。华农的生信在全国来说还是相对比较强的,在清华能遇到很多来自华农的本科生。从课程而言,其实主要取决于本科生信教育的定位是什么:
如果定位偏向于信息(纯计算),那么学的课程主要偏向计算机和数学,如模式识别,数理统计,概率论,数据结构,计算机语言(python和R),Linux系统,机器学习等。这类生信学校如哈尔滨医科大学,上海交通大学等。本科毕业的学生生信实力偏强,毕业生硕博研究也大多偏向于算法和工具开发,机器学习方向。
如果偏向生物,如本校,学习的课程就分为两个部分。生物学,包括分子生物,细胞生物,生物化学,基因组学,遗传学,我是医科院校毕业的,所以还会学点组织胚胎,药理学,免疫学和解剖学。本科实验课程设计也主要是偏实验方向,比如DNA/RNA提取,PCR,western blot,细胞培养等。信息学,与之前偏计算的差不多,包括数理统计与概率论,计算机基础,生物信息学,模式识别,计算机药物辅助设计,linux基础,计算机语言(当初学的Perl)等等。
所以,生物信息学实际上是一门交叉学科,可以基于算法开发基于基因组,转录组,蛋白组,代谢组等的分析方法,也可以作用传统机器学习或者深度学习算法从上述生物组学数据进行数据挖掘或者基于统计学对生物信息进行统计比较服务于生物学问题。单纯从本科教育而言,学的东西很广很多,但自己能达到什么样的水平完全取决于自己底下付出多少努力。
生物信息本科毕业能干嘛?其实也取决于个人水平,单纯本科而言做专业对口工作的话基本去生物信息公司或者科研服务公司或机构工作,主要工作内容无外乎生物数据的挖掘,解析,遗传咨询等等。非专业对口工作的话就无限可能了,有转行做计算机行业的,有做销售的,有考公的,这就不提了。所以生物专业,不管是生物技术生物信息生物医学工程,就业单位还是相对比较窄的。
所以绝大多数生物信息的本科生,在本科毕业就回会选择读研,可以是硕士或者博士。实际上很多硕士毕业的生物信息同学工作几年以后也重新回归继续读博,因为本科和硕士其实差的也不是很多,就业单位也只是相对工资高一点,就业范围也并没有扩大。但是博士毕业后,你的选择范围会更大,除了一些生物信息公司和科研服务公司,你还可以选择去药企,医院,高校,科研院所,凡是做科研的地方,基本上都需要生物信息工作者。那本科生也可以呀,不,本科生就不适合去医院,高校,医院,科研机构或者药企,因为基本不会给本科生有这样的岗位或者位置,这种研发机构的研发岗基本都要求博士学位。
具体录举个例子说明生物信息本科生能干嘛,比如说你对象怀孕了,想知道你宝宝的健康状况已经以后可能患有某种遗传疾病的风险。那么你可以去医院抽点羊水,从里面提取羊水里面的DNA或者RNA,送给公司比如华大基因诺禾致源等测序公司,进行深度DNA基因组测序和RNA转录组测序,麻烦测序数据以后就是你作为生物信息科学工作者的工作了。你可以根据基因组测序信息,与人类参考基因组信息进行比较,看看胎儿基因组序列信息里面存在哪些可能的基因变异或者突变,携带多少遗传突变位点,哪些遗传突变位点与某种疾病相关,根据已有突变模型,来预测宝宝是否有患遗传病风险,风险多大等等,通过转录组信息或许可以筛查出宝宝基因组信息里面那些基因表达较高或减低,作为某种健康状况的遗传筛查标记等等。这个生物组学数据的分析和解析过程,生物信息本科生就能做。这就是无创产检检测了,市场也比较成熟了。
以上就是生物信息专业和就业相关内容了,希望对你有帮助。
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