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随着DAN测序技术的不断发展,如今的基因检测早已摆脱了以往单点的测序方式,实现了大片段、高通量测序技术(next-generation sequencing,NGS,或称“下一代测序”技术)
首先,我们来了解一下什么是全外显子组测序。顾名思义,全外显子组测序是检测了所有基因的外显子部分的序列。那么什么是外显子呢?
人有23对(46条)染色体,一半来自父亲,一半来自母亲。而基因就是这些染色体上的一段序列。简单来说,基因由外显子和内含子组成。外显子部分的序列主要参与蛋白质的编码,而蛋白质是执行生理功能的重要大分子。因此外显子序列的突变被认为参与疾病的可能性大而具有重要意义。
外显子和内含子是由A、T、C、G 4种碱基组成的DNA序列。基因测序就是检测这些碱基的序列。全外显子组测序就是选择性地捕获并检测了外显子部分的序列。测序获得的原始的碱基序列并不能直接与疾病挂钩。原始数据需要通过后期一系列的生物信息学的分析、比对、注释,才能成为一份“全外”报告。整个过程需要耗费较长的时间。
全外显子组会检测人类的25000多个基因。在和标准基因组序列比对后,我们会发现每个人都携带了成千上万的变异。但并不是只要有变异就是有害的,也不是所有的变异都和疾病有关。而这里的检测结果是遗传分析人员在经过后期大量的筛选分析以后,挑选出来的和检测者的临床表现较为相关的几个基因。需要强调的是,列在这里的基因也不一定就是致病基因。判定一个变异的致病性需要临床医生结合患者的表现具体分析。采集家属的血样进行检测,作为分析的对照也很重要。
全外显子基因检测,所针对的外显子区域包括了目前已知的绝大多数可诱发疾病的致病,从而在做到低成本检测的同时完成高深度测序,同时实现价格及性能上的双优势。除此以外,全外显子基因检测还多用于家系检测当中,相较于单人检测,家系检测可以提高25%检出率的同时,大幅降低检测费用。
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