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核酸分离与提纯是分子生物学、生物医学探究及临床检测等范畴中必不可少的基础实验环节。其旨在从样本(例如血液、组织、细胞、病毒等)中分离并提纯出高纯度的DNA或RNA,以便开展后续的PCR扩增、基因测序、分子杂交、芯片检测等多种实验。
实验操作原理01 裂解过程:样本首先通过物理和化学手段进行裂解,物理手段可能包含研磨、超声波破碎等,使细胞壁破裂,释放出细胞内的核酸。
化学试剂如十二烷基硫酸钠、苯酚/氯仿、异戊醇等用于瓦解细胞构造,溶解蛋白,并辅助分离核酸与蛋白、脂质等其他杂质。
02 去蛋白过程:加入蛋白酶K以消解蛋白,降低蛋白对核酸的污染。
运用苯酚/氯仿萃取或离心柱技术,依据相分离原理,将核酸转移至水相,而蛋白、多糖及其他有机物则主要存在于有机相。
03 沉淀与清洗过程:通常利用乙醇或异丙醇在适宜条件下使核酸沉淀。
沉淀后用高浓度乙醇进行多次清洗,以去除盐分及其他残留的小分子化合物。
04 干燥与溶解过程:将核酸沉淀充分干燥后,用无RNA酶/DNA酶的水或缓冲剂溶解。
对于RNA提取,还需添加RNA酶抑制剂以防止RNA酶降解RNA。
05 提纯过程:可采用离心柱技术结合硅胶膜吸附或磁珠技术,通过特定洗脱条件选择性地捕捉并洗脱核酸。
如需进一步提纯,可通过柱色谱、PAGE电泳切胶回收等方法提高纯度。
实验要点提示一、操作细节1)保证所有材料和仪器均为无菌且无核酸酶活性。2)所有操作需在冰浴中进行以延缓核酸降解。3)裂解液与样本充分混匀以确保完全裂解。4)萃取过程需严格控制时长、温度和离心力。5)RNA提纯时需注意防止DNA污染,可加入DNA酶处理。
二、注意事项1)根据样本类别调整裂解方法和裂解液配方。2)苯酚/氯仿萃取时需注意其毒性和挥发性,操作应在通风橱内执行。3)避免核酸反复冻融,以防其降解。4)核酸浓度和纯度测定:采用紫外分光光度计测定OD260/OD280比值评估纯度,OD260/OD230则可评估样本中有机污染物残留状况。5)存储核酸时应置于-20℃至-80℃低温冰箱,并尽快使用以保持最佳状态。 |
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