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[分享] 研究生想转生物信息方向的,请各位大神指教?

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发表于 2025-1-5 16:10 | 显示全部楼层 |阅读模式

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本人现在大三,211院校,本科生物工程,研究生想转到生物信息方向,想问下生信在国内各个院校的排名如何?如果要出国,是否国外的前景比国内好?硕士读出后,就业方向有哪些?目前生信的就业情况如何?
本科已有线代和概统的知识,计算机方面只学了VB(学校规定的)。如果要转生信的话,计算机这方面还需要自学哪些内容?perl C C++ java python matlab 这些都要学么?掌握程度如何?
求大神们指点指点!
原文地址:https://www.zhihu.com/question/39540394
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发表于 2025-1-5 16:11 | 显示全部楼层
前两天回答了一个本科计算机,研究生想转生信的。
之前还回答过一个干IT干了好几年,现在想转生信的。
大家思路都很活跃啊。
不过也从侧面表明了生信的风现在吹得比较猛。

课程方面其他几位大大都回答得差不多了。
我来说说生信的就业前景。

答主是做云计算的,众所众知(并不)我们这个行业属于特殊行业。
特殊在哪里呢?
别的行业都是被吹上天的,我们云计算本来就在天上(大雾)。

生信的风也吹了好久了,一会儿风大,一会儿风小,一会儿似乎又停了。
而今年爆了个新冠疫情,生信的风又呼呼地吹来了。

举个例子。
我们都知道药物研发费时费力,关键还特别费钱,动辄就是几十年几十亿美刀下去,然后啥动静都没有。
现在上层发话了,老子有钱,研发费用加一个……啊不……加一串零,麻溜滚去干活。
此话一出,简直所向披靡。

拿药物研发中重要的一个步骤,也是生信存在感很强的一步——虚拟筛选来说。
目前可用于药物发现的有机分子已经超过了10的60次方,而通常我们做虚筛通常采样的分子数量级只在百万到千万分子之间。
为啥?
穷呗。

我们不过是从沙漠里捡了一粒沙子来做实验。
运气不好这粒沙子可能还被骆驼粑粑污染了。
但是以前没有钱也没有选择,只能望着茫茫沙漠流泪。
但刚才我说啥来着?
老子有钱!!!

2020年3月,哈佛大学医学院(HMS)的科研人员在《Nature》发表了一篇论文,描述了一个开源药物发现平台VirtualFlow,该平台可以通过云端整合海量的CPU对超大规模化合物库进行基于结构的虚拟筛选,从而提高药物发现效率。
HMS称,根据选定的条件,使用一个CPU筛选化合物,每个配体的平均对接时间为15秒,筛完10亿分子大约需要475年,而他们利用这个VF平台调用了160000个CPU,对接10亿分子仅耗时约15小时,10000个CPU则需要两周。


而且该平台是可以线性扩展的,也就是说处理器数量增加多少倍,筛选能力也会随之增加多少倍。
意思就是老子有钱这句话对这个平台有加成作用。
你敢把研发费用加个零,我就敢把研发时间减个零。

关于这个平台的详情可戳:
速石科技 fastone:15小时虚拟筛选10亿分子,《Nature》+HMS验证云端新药研发未来所以,作为云计算行业从业人士,我们是真的觉得云计算的未来充满光明。
哎哎???不好意思串台了,重来——

我们是真的觉得生物信息的未来充满光明!!!

加油!我们在天上等着你!!!


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发表于 2025-1-5 16:12 | 显示全部楼层
澳洲Bioinformatics Master student 一枚。本科在厦大读的,没接触过生信。
硕士开始接触,爱上coding无法自拔。
放弃windows,用mac或者linux。
先学bash里各种命令,然后python和R。我目前就感觉还行,国外symposium很多,也有机会见到你研究时候用的软件或者package的作者,有时候还是很兴奋的。国内生信发展也很不错啊,华大就很强,国内实验室又有钱又强给我感觉就是。
我觉得你要转成bioinformatics前要先确定自己想做这方面。因为这是“dry lab”,我们就每天对着电脑,以及要跟不懂电脑的老师解释你的data分析结果为什么会这么烂:)
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发表于 2025-1-5 16:13 | 显示全部楼层
因为马上要去公司上班,所以就匿了,生信的需求的确很大,但是公司分部主要在北上广深,所以选地方远比选学校来得重要,国外发展比国内要好很多,另外1W+指的是牛逼的人,那些人基本可以去其他IT公司工作,所以光指望生信应届出来就能1w+也是不现实的(也可能是我比较水),不过就就业情况来看比其他生物专业要好一些。python perl R这些要掌握,基本生物信息学分析过程就能搞定了(各种软件包啊。。。),再往上自己写一些算法,需要比较好的性能,会用到C或者C++.
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发表于 2025-1-5 16:13 | 显示全部楼层
问题好多。转生信入门不难的。
院校排名北大,交大生物信息都很强的,华大基因也很强。
国外前景也很不错,我目前也正在准备出国语言考试o(╯□╰)o。
生信就业情况不错,生物信息工程师月薪1w+,北京上海等地。
学什么肯定跟你以后想从事的方向有关,不需要都学,学精比学得多要好。
python,R,C或者java这三个挺重要的,而且这方面的人才市场需求也挺大的。
目前大四,正在摸索中。现在回答的也不是很详细
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