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实验原理
CTAB是一种非离子去污剂可与DNA形成复合物,此复合物在高浓度氯化钠溶液(20.7mM)下可溶,并稳定存在,但在低浓度下(0.1—0.5mM)沉淀,而大部分蛋白质、多糖仍溶于溶液中,经离心弃上清后,CTAB核酸复合物,用75%乙醇浸泡脱掉CTAB。
实验步骤:
注:夏天取新鲜叶片时应带冰盒,将取下叶片立刻放冰上,防止过度失水,另外取材尽量取用嫩组织。
1)取约1cm2的新鲜的幼嫩叶片于研钵,向研钵中加入600µl预热的 2%的CTAB分离缓冲液和12ul的β—巯基乙醇(2%),研磨成浆,倒入1.5ml的离心管中。
1.此步主要是充分破坏细胞壁,使CTAB充分接触细胞膜。
2.此方法为小量法,样品的量要必须符合要求。
3.裂解时间尽量要短。
4.CTAB溶液在低于15℃ 时会形成沉淀析出,因此,在将其加入冰冷的植物材料之前必须预热,且离心时温度不要低于15℃。
5.转移时可用剪去尖端的枪头吸取。
(2)将离心管置于65℃水浴30min,其间每隔10min轻轻摇晃离心管,使其充分混匀
使CTAB充分破坏细胞膜,与DNA结合形成复合物溶于高盐溶液。
(3)加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),颠倒摇晃5min。
(4)12000r/min离心10min,收集上清
降至室温后,再加酚/氯仿/异戊醇。4℃离心更容易去蛋白,故凡是抽提蛋白的,都可运用此条件。此后不再赘述。另外收集上清时应调小枪头(50ul即可),缓慢吸取。此后不再赘述。
(5)加等体积酚/氯仿(1:1),混匀,12000r·min-1离心10min,取上清。
(6)加等体积氯仿/异戊醇(24:1),混匀,12000r·min-1离心10min,取上清
此步氯仿是为了除去上步残余的酚。
(7)向上清中加入两倍体积预先冰冻的无水乙醇或一倍体积的异丙醇,置于-20℃冰冻30min。
降低CTAB的浓度,使DNA析出到难溶的乙醇中。加入醇类使其终浓度为70%左右沉淀效果最好。若杂质含量较多,可采用室温沉淀。异丙醇沉淀较完全,但难洗涤,适合小量提取DNA沉淀。另外沉淀时间不是很严格,DNA可以在其中长期保存,但若想减少杂质含量尽量不要过长。
(8)12000r/min离心10min,弃上清,加入75%的乙醇,悬浮沉淀,常温下静置5min,弃上清。
离心之前将液体吸出,可以减少杂质的含量。但吸的时候一定注视枪头尖部,不要把DNA吸走了。另外离心获得的沉淀呈现透明状,似果冻,若有粉末状物质则可能蛋白质未抽提干净。
(9)室温干燥,溶于20µl 无菌水中,然后加入1/10体积的RNAase(1mg/ml)37℃处理40min后-20℃保存备用
晾干之前,可短暂离心,将管壁乙醇聚集底部,后用移液枪吸去,能够最大限度的减少乙醇的存在,加速晾干。晾干的标准是无酒精味即可,不可晾的时间过长。
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