2023年预发表的《Evaluating the capabilities of the Astral mass analyzer for single-cell proteomics》[1]文章,评估了基于质谱的蛋白质组学进行单细胞分析的情况,结合蛋白质组来准确表征细胞表型。该研究使用数据独立采集(DIA)评估了Thermo Scientific Orbitrap Astral 质谱仪的性能,并证明了其在特定模型中研究细胞周期动力学和癌细胞异质性的能力。利用Astral分析仪使鉴定出的蛋白质总数翻倍,高稳定性使其中大多数蛋白质的CV值低于20%。仪器的高灵敏度在对少量的样本进行分析时,可以鉴定到更多的转录因子。
图 Orbitrap Astral鉴定的蛋白数量多,是Orbitrap Eclipse的一倍
图 Orbitrap Astral 蛋白组覆盖率高:是 Orbitrap Eclipse的两倍
图 Orbitrap Astral 高精度和高深度:解锁了低丰度的关键蛋白,如转录因子
经典案例二
2023年发表于《Journal of Proteome Research》期刊的《Evaluating the Performance of the Astral Mass Analyzer for Quantitative Proteomics Using Data-Independent Acquisition》[2]研究,评估了Astral 质谱分析仪的定量性能,与最先进的质谱仪相比,该分析仪每单位时间可以量化更多的肽,从而在宽动态范围内展示了高质量的定量测量。研究人员还使用新开发的细胞外囊泡富集方案来实现血浆蛋白组的深度覆盖。
参考文献
[1] Evaluating the capabilities of the Astral mass analyzer for single-cell proteomics. bioRxiv ,2023.[2]Evaluating the Performance of the Astral Mass Analyzer for Quantitative Proteomics Using Data-Independent Acquisition. Journal of Proteome Research ,2023.