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[分享] 求问,生物信息学有必要读博士么?

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发表于 2024-11-11 19:25 | 显示全部楼层 |阅读模式
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发表于 2024-11-11 19:26 | 显示全部楼层
hi同学你好,
在中国发展的话,我建议有条件一定要读一个博士,并且尽量通过好的项目训练自己的独立思考能力、科学研究能力、领导力等。这些都是你未来应对激烈竞争的重要壁垒;
在海外的话,如果没有计划未来从事学术研究,不建议读博士,一个硕士学位就能够让你拿到很好的职位和很高的收入,同时还有很多向IT或Data Science转行的机会。博士反而会让你就业的选择面变窄,over-qualification是个问题
祝你好运
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发表于 2024-11-11 19:27 | 显示全部楼层
谢邀~
个人认为,这其实是两个问题。一,是否要读博士。二,是否要读生物信息学博士。考虑这两个问题,我想你才知道自己想要什么。
以我为例,我硕士就是生物信息学,主要研究的是植物。其实,生物信息学在我硕士毕业的时候,真的算是不错的专业了,去公司能找到不错的工作,我身边几个不是生信的,也都去公司了,例如诺禾致源,安诺,华大基因等。说明市场还是认可的。
然后我想说的是,你想不想读博士,这个问题考虑清楚了,才是决定你选择哪个专业的,我个人认为,读博士还是要目标明确些,而且实事求是的讲,真的要有点兴趣,就是你擅长。因为这个时间比较久。当你真的决定读博士,生信算是个不错的选择。
我硕士毕业,最终还是选择读博士,而且继续做生信,因为我硕士没怎么做过湿实验,新实验室导师所以还是让我做生信。所以你要想清楚,自己硕士做什么的,要是有做湿实验的基础,会点生信其实特别好。现在实验室最受欢迎的就是干湿结合。纯粹的生信分析,可能出不了大文章,除非有一些好项目。而且,最关键的是,你读博士的时候,可以给老板商量,自己有想做生信的想法,只要你有想法,有能力,什么专业不重要。举例来说,我博士的专业是生化,因为单位没有生信的老师了,但是做的还是生信,老板会根据你的实际情况来安排课题的。
总的来说,如果,你真的有想法读博士,就坚持做。而且,一定要根据硕士的情况,来选择做课题。读博士,生信,都是不错的选择,加油!
本文欢迎转载,请注明出处。
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发表于 2024-11-11 19:28 | 显示全部楼层
先上结论:生信乃至广义的CS产业,如果你想在技术(非管理)职业线上往高端走,博士生涯中具体项目的训练几乎是必须。建议读一个。
生信主要有两个方向,一个是偏数据分析方向,一般要求:

  • Linux要入门乃至比较熟练
  • 要么熟练使用Python(pandas,numpy,scipy,matplotlib/seaborn),要么熟练使用R
  • 统计学要会比较简单的那部分(正态分布,学生t检验,方差,数学期望等)
第二个是数据挖掘/机器学习方向,除了以上的要求以外,还需要:

  • 理解数据结构与算法核心内容(表,栈,队列,树,图,排序,哈希)
  • 理解凸优化核心内容(凸集,保凸性,常用的优化算法,它们的收敛速度和准确率)
  • 熟练掌握原理并运用传统的机器学习算法,主要是线性模型(线性、逻辑、FM、FFM)、树模型(单棵决策树、GBDT、RF、XGBoost)、距离模型(聚类、KNN)这三类。概率模型(朴素贝叶斯,隐马尔可夫等)和深度模型(各种神经网络)看情况。
  • 概率统计基础必须要很牢固(极大似然估计、协方差、卡方检验、ANOVA等都要会)
  • 熟练掌握数据挖掘基础(数据清洗和特征工程)
  • 会用Sci-kit Learn
额外的加分项:

  • 会C++
  • 会SQL
  • 会用TensorFlow、Pytorch、Caffe等框架之一
  • 如果还会写网络爬虫那就是大加分项,如果会异步爬虫那就更好了
  • 如果还会大数据(Hadoop/Spark,Java/Scala),大牛
  • 如果再会点前端(HTML/CSS/JS),神牛
我本人是做第二个方向,所以谈得多一些。数据挖掘方向,一般会优先招博士,招硕士那也是很优秀的有项目有文章的。数据分析方向,硕士学历够,这方面的博士会强化生物学背景,主要是解读数据的能力,这个不经历一定的科研训练量做不到,所以如果你对生物学问题有兴趣的也可以深挖一下。不管哪个方向,博士都比硕士值钱不少。
生物学基础知识,取决于你做的是何种生信。生化分生一般肯定要学。做计算免疫的必须修一下免疫学,做计算神经的必须修一下神经,做植物基因组的,最好修一下分子植物学。开卷每每有益,有时间的话多修一点生物学的课不是坏事。
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发表于 2024-11-11 19:28 | 显示全部楼层
谢谢卡子哥邀请。 @契卡
我是觉得,我当初没有想过这个问题,因为当时我本科毕业以后就直博了。
不过,现在回想起来,我依然觉得,如果你以后想做公司里一个方向的leader,或者是你想在学术界有更高的追求,那么一定要去读一个博士。
如果仅仅想工作,我还是建议读,但是只有上一条建议的65%,因为这相当于花了3~4年的时间,对这个领域有了更深入的了解与认识。不过,事物还是要辩证的看,多花了3~4年的时间,也就相应的错过了3~4年的机会。到底怎么平衡,还是看你内心的选择。
其实,在你没有成功的时候,没有人会在意你到底在如何成长,只有你成功以后,所有人就会说你你的选择正确,甚至他们会说,当初你放的屁都对你今天的成功有帮助。但其实你当初放屁的时候,可能仅仅是因为多吃了两口萝卜。
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发表于 2024-11-11 19:28 | 显示全部楼层
读!我现在正在找读博的地方。
1。工作上,如果不读博某些地方不会给你入场券,因为几乎所有的生物领域,生物湿实验是主导,生物信息只是辅助的地位。很多领导并不懂生物信息,所以只会靠学位来做第一步的判断。换句话说,如果有博士号称做生物信息,但是技术很差,在找工作的时候,也会比硕士一直做生物信息,做得还不错的人更受肯定,我身边就有这样的人。其次,薪资上,某些地方虽然会招,但是会以非博士为由,给你一个尴尬的薪资,说不定还会有挂着博士头衔,拿着工资比你多的,但是懂得没你多的人,领导你。
2。学术界,必须了。无论基金申请,还有职称申请什么的,博士优势很多。
3。自我提升。我一直觉得,生物信息就是计算机,统计,生物三者结合的交叉学科。学习的时间越多,积淀越厚,理解问题也会很深入,解决问题的方法也会更多,以后发展会更好。
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