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[讨论] 目前个人基因测序的成本大约是多少?

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发表于 2024-11-11 09:05 | 显示全部楼层 |阅读模式

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请教一下目前个人基因测序的成本大约是多少,有以下几点小问题,请各位答题者适当参考,谢谢!
    测序类型可分为两类;即全基因测序和 genotyping
    中国和美国这两类服务价格分别如何?如果想进行测序,主要是在医院还是公司进行?可否把仪器成本,耗材成本,和人力成本核算一下?几年前即有人提到希望降低成本至1000美元,从现在趋势看,大约多久有望达到?

原文地址:https://www.zhihu.com/question/27736012
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发表于 2024-11-11 09:06 | 显示全部楼层
看测多少吧,部分区域还是全外显子,或者全基因组,仅几十个基因的目标区域测序而言,试剂成本不上到两千的都不一定靠得住。
话说其实都是在给illumina打工啊!上游试剂和仪器太贵了……
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发表于 2024-11-11 09:06 | 显示全部楼层
算上测序仪和试剂,单独的测序成本大概在1000美元左右,而对外的售价是在1500-1800美元。
美国有个公司 veritas genetics,今年九月刚推出了一个亏本的个人基因组测序产品,测序加分析再加咨询全套才999美元。可以说是业内最低。但只提供给参与它PGP项目(哈佛大学的个人基因组计划)志愿者,志愿者得允许对外公开个人的基因信息和健康信息。拟招募10万人,现已有1.6万人参与。
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发表于 2024-11-11 09:06 | 显示全部楼层
谢邀,目前国内关于二代方面测序主要分为两大类,
1.全基因组测序(个人认为暂时还用于研究的较多,需要强大的数据分析能力及数据库)
2.捕获测序(国内公司较多)
主要说说第二个吧!
捕获测序,是通过基因捕获技术,抓去目标基因片段,并通过高通量测序仪进行测序,通过生物信息进行数据分析,从而找到致病基因,对临床医生诊断进行指导!
捕获测序有几大好处:
1.成本低(可以做到千元左右,更适用于临床医学)
2.数据量小,更易于分析!
3.更具有针对性(耳聋病人只需要检测耳聋相关基因就可以了,更易于临床医生对疾病进行判断)
至于测序成本,对于测序来说,成本高的不是测序成本,而是测序完成后的数据分析!
全基因组测序+简单分析国内可以做到一万多些!
捕获测序,国内各个公司检验所,收费各有不同,收费3000-10000不等!
下个问题!
目前国内基因检测还主要在公司或第三方检测机构中进行。医院目前只能做一些单基因疾病检测!
随着国家对二代测序政策的放开,越来越多的医院开始建设二代测序实验室,但是前期肯定还是和公司合作建设!
最后一个!
国内无论公司还是医院,除个别几家外,都没有自己的捕获技术,全是买的国外的捕获技术,或定制的!可能国内的基因检测更贵些!
目前国内遍布基因检测公司或检验所,有点像当年的团购,在未来几年将是行业洗牌时间。
第一次回答,啰嗦了好多,见谅!
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发表于 2024-11-11 09:07 | 显示全部楼层
现阶段,基因测序基本都是在专门的公司、机构进行的,因为这项业务的规模效应很明显,各个医院和体检中心分别开展不划算且结果相对不那么准确。各个医院和体检中心一般会有与之合作的专门从事基因测序服务的公司。

基因测序的成本取决于你希望得到的测序数据的总量。
基因检测实际上有三种思路。
第一种是只关心基因组上的某些区域(已知这些区域的序列与疾病强相关、且只关心这种疾病的发病风险),这时候用的方法多半是经目标区域富集之后测序。这种方法需要的测序量很小,平均到每个样品成本在数百人民币的级别。
第二种是关心基因组上的多个位点/区域(已知这些位点/区域的序列与疾病相关、关心多种疾病的发病风险),这时候常用的方法是基因芯片检测。这种方法需要的测序量与想检测的位点个数直接相关。平均到每个样品成本在几百到千元人民币的级别。
第三种就是全基因组测序了。能获得更完整的基因组序列信息,提高对疾病风险估计的准确性,同时如果以后研究有了新进展的话可以不用再行测序即可获得更新的结果报告(涵盖更多疾病类型或结果准确性提升)。这种方法的成本可低至两三千美金,但较低的测序量会影响结果的准确性。

不同公司根据规模和业务类型的不同会选择不同公司的不同测序平台,因此成本构成并不完全相同。总体来看,测序用试剂耗材占成本的主要部分,设备折旧和计算资源其次。
具体核算显然涉及商业机密,抱歉不能回答。

利益相关:是。
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发表于 2024-11-11 09:07 | 显示全部楼层
之前听novogene的朋友说过一次,他们对外的个人基因全序列测序大概是4~5w。公司内部人员测序是7k~8k。服务还包括数据对比,疾病预测分析。
对于部分测序的,我没问。。。
成本的话,可以猜测一下
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