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[分享] 能不能从一个人的正常粪便中提取这个人的DNA?

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发表于 2024-11-11 08:52 | 显示全部楼层 |阅读模式
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发表于 2024-11-11 08:52 | 显示全部楼层
可以!本人从事相关工作,人类肠道每天都数以万计的细胞自然脱落进入肠道,这些细胞部分会降解,部分随粪便排出体外。商品化的已经有很多粪便DNA提取的试剂盒,可以从中提取DNA用于肠道疾病的检测,因为疾病类检测都是非正常基因,数量微少,所以要提取人正常DNA就相当容易了,只要几克粪便就可完成。有痔疮等内出血就更容易了,会增加粪便中人基因组的量。至于楼上等说道的其他DNA的干扰等情况,目前的技术完全可以剔除掉,得到完整的人类基因组信息。
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发表于 2024-11-11 08:52 | 显示全部楼层
我们先来看一条新闻:


飞翔入手,英文叫Flying Get,是指一样东西在预定的日期之前被提前获得,比如我们在某张CD开卖之前可能已经听过里面的歌了。
某程度上来说是一件开心的事情呢。
但是,本着认真求实的科学态度,问题就来了:大便DNA鉴定是不是黑科技呢?
理论上是可行的。
首先科普一下,我们的DNA就像一本巨大的笔记,里面记录了我们的遗传信息。其中有一些页面,是我们大家都拥有的,而有一些页面,则是每个人特有的,人和人之间都不一样。通过检测这些特有的页面,我们就可以知道这些DNA是不是属于某个人的。
我们的大便,里面的确是含有一些我们胃肠道的脱落细胞还有核酸等遗传物质的,通过现在的检测手段(PCR、NGS等),即使含量很低也能检测得到,只要我们同时检测这栋楼的其他住户的DNA资料,将两者进行比对,就可以找出凶手了。
然而这只是理想的情况。实际上,DNA在常温放置下可能会降解,那就检测不到了。还有,检测这么多人DNA的成本非常高。当然,更重要的是,你的邻居也许并不会鸟你。


(天空飘来五个字:你是egg pain吗?)
然而,作为一个如此有深度的订阅号,我们是不会将目光仅仅停留在这个问题上面的。
结直肠癌是发病率最高的几种癌症之一。目前,我们想要通过体检发现结直肠癌,主要是通过检测大便潜血(结直肠癌病人可能会出现肠道出血,残留在大便中),还有肠镜检查。
但是这两个检查手段都各有缺陷,大便潜血的敏感性比较低(大约20-30%的病人会漏诊掉),而肠镜是有创检查,应用范围和频率都有限。
那有没有一种敏感性更加高的有创检查方式呢?
前面说过,大便里含有遗传物质。美国FDA于2014年8月12日批准一种粪便检查的体外检测仪,叫“大肠卫士”(Cologuard),可以分析粪便样品的突变DNA的类型和总量,从而得知你是否有结直肠癌。
据文献报道,大肠卫士的敏感性比大便潜血提高了10-20%左右,对结直肠癌的敏感性达到92%,作为无创检测手段来说已经非常了不起。
顺带一提,大肠卫士一次的检测费用是599美刀。


按你胃(Anyway),一坨粑粑能扯出这么多,我只能再次感叹于现代科学的进步。
好了,我要回去吃饭了,下次见!



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发表于 2024-11-11 08:53 | 显示全部楼层
能分离出细胞就ok了吧
今年Nature method的文章,从尿液(大概差不多?)里提取细胞,做ipsc
中科院一教授做的。。。
http://www.nature.com/nmeth/journal/v10/n1/full/nmeth.2283.html#affil-auth也就是说不考虑伦理的话造一个人出来也是可能的。。。
至于我为什么会知道这么奇怪的东西呢
因为我老板认识中科院那哥们儿,老板觉得这个技术碉堡了,我们实验室也要做,我们分别表示呵呵呵

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发表于 2024-11-11 08:54 | 显示全部楼层
这取决于你的提取目的
如果仅是鉴定该人的身份,这是可以的,因为这种鉴定仅需要痕量的DNA足以。
事实上,许多公司有粪便中提取人类DNA的试剂盒,你可以轻易的通过google甚至baidu查到。
由于粪便宏基因组大部分来自与原核生物,所以试剂盒针对原核与真核生物基因组的巨大差异可以轻易的去除原核DNA。
再通过基因芯片或PCR扩增等技术,你可以得到其中人类卫星DNA的序列。用于与嫌疑人的DNA对比。
在法医学高度发达的国家,哪怕你生吃了一个人的肉(注意是生吃),如果条件允许,也可以从粪便中间找到被害者的DNA哟,这可不是电影情节仅有的。。。。
现在粪便DNA也可以用于检查患者基因突变。
如果你想从粪便中提取该样本的全基因组,那就不好说了,应该就行不通了。
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发表于 2024-11-11 08:55 | 显示全部楼层
很难提取这个人的DNA,但可能可以鉴定这个人的DNA.
之所以很难提取,是因为粪便中含有食物中未消化的DNA片段,肠道微生物的DNA,和主人消化道中脱落细胞中的DNA, 这些DNA本质上是一样的, 没法把这人的DNA从其他DNA中分离出来.
但我想提问者的本意应该是能否从粪便DNA中鉴定出它的主人.
鉴定DNA是可行的, 人类DNA中有些部分是高度可变的区域,每个人都不一样. 只需要使用一种特异性基因扩增方法, PCR(聚合酶链式反应),将这种高度可变区扩增出来, 鉴定这一段的序列,再和一个数据库或者某个人的DNA作比较,就可以知道这个粪便和主人的对应关系了. 也就是说, 不需要提取出全部的DNA, 只需要鉴定出有这段DNA就可以了.
事实上, 法医鉴定时都是通过这种方法.
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