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[分享] 核酸提取过程中组织样本取样及预处理应如何进行?

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发表于 2024-11-11 08:26 | 显示全部楼层 |阅读模式

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在进行组织样本DNA提取之前,取样是一个非常关键的步骤,它直接影响到后续DNA提取的质量和成功率。不同类型的样本(如动物组织、植物组织、微生物等)取样的方法略有差异,但基本的原则和注意事项是相似的。
一、取样过程

  • 准备工具和设备
    无菌手术刀或剪刀、镊子、一次性手套、1.5 mL无菌无酶离心管、研钵、液氮、无菌纱布或棉签(如果需要擦拭表面)。
  • 个人防护
    穿戴适当的个人防护装备,如实验室外套、手套、口罩和护目镜,以防止生物危害和化学物质的接触。
  • 样本选择与采集
动物组织:选择健康、无病变的部位,使用无菌器械迅速切取一定量的组织,立即放入无菌采样管中。对于需要长期保存的样本,可以将其放入含有液氮或干冰的容器中速冻,以保持样本的新鲜度。
植物组织:选取生长良好的部分,如嫩叶、根尖等,用无菌工具切割,同样迅速放入采样管中。植物样本也推荐使用液氮或干冰速冻。
微生物:从培养基中取样时,应确保使用无菌技术,避免杂菌污染。对于液体培养物,可以直接取一定体积的培养液;对于固体培养基上的菌落,可以使用无菌棉签轻轻刮取后放入采样管;对于真菌,可从菌丝或者菌褶剪取部分组织进行提取。
二、预处理
将样本放入研钵中,加入缓冲液使用研磨棒研磨成匀浆。或将样本放入1.5 mL无菌无酶离心管,加入少量缓冲液,使用手持研磨器进行充分研磨,具体研磨时间需要根据研磨器转速及样本类型进行确定。另外,在研磨过程中可加入PK,这有助于细胞充分分散,以便后续核酸提取步骤中组织细胞能被充分裂解,提高核酸提取效率。
三、注意事项:
无菌操作:在整个取样过程中,要保持工具和环境的无菌状态,避免样本被污染。提取过程中所用到的塑料耗材应选用无菌无酶的材料,如经过焦碳酸二乙酯(DEPC)处理。玻璃器皿(如匀浆器)等要彻底清洗,并尽可能采用200℃以上烤箱烘烤2 h。
合适的样本量:确保采集的样本量足够进行核酸提取和后续分析,请严格按照试剂盒说明书进行取样。
迅速处理:取样及预处理后应尽快进行提取,以减少核酸降解。
安全第一:在处理具有潜在危险性的样本时,如感染性病原体,必须遵循实验室安全规程,使用适当的生物安全柜和防护装备。
正确、规范的取样过程是确保DNA提取质量的基础,对后续的分子生物学实验至关重要。

原文地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/1024612253
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