肠道微生物研究常见样本——粪便取样标准

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近期肠道微生物研究成果频登顶刊，为大家展现肠道菌群的研究价值和意义。随着科技的发展，肠道菌群的研究也越来越“卷”。M20 Genomics推出高通量肠道菌群单细菌转录组产品——VITA GutMicrobiome后，提供了比宏基因组、宏转录组更精细化研究肠道微生物的工具。
而要顺利、高效地开展一场实验，除了研究工具外，样本取样、保存、运输都至关重要。今天，我们来看肠道微生物研究的常用样本——粪便的取样流程和保存要求：
01取样包耗材



02取样步骤

（1）取出采样包中的2个冰袋，放入冰箱冷冻层进行预冷；
（2）将标签纸贴在粪便采集管及自封袋上；


温馨建议：用透明胶带在粪便采集管标签上缠绕至少一圈，并在管盖上标识名称，更加保险。
（3）尽量在粪便采集前将尿液排尽，再将手洗干净；
（4）将粪便采集纸套入马桶座圈，使粪便采集纸中间区域下垂；


（5）排便后将手洗干净，戴好一次性手套，拧开带勺粪便采集管，用勺子截取粪便中段内部一勺（约黄豆大小）；


（6）将勺子垂直放入粪便采集管，拧紧盖子；


（7）将粪便采集纸从两侧撕断后弃入水中，采集纸可降解，冲水即可；


（8）将采集管放入自封袋内，与预冷的冰袋一起放入保温袋中；


（9）于24小时内将样本寄送回实验室进行处理；


（10）样本到达实验室，按以下步骤进行粪便样本处理；

• 取约1g粪便样本，加入5mL 4% Fixation Fluid（固定液），颠倒或吹打混匀，请勿涡旋。
  
• 将混合物放入4℃冰箱中的旋转混合仪中过夜固定（至少 8 h），不超过24小时。
  
• 固定后的液体过40μm细胞筛去除较大杂质后离心（3910g，4℃，5min）去除固定液，加入1mL含1µL RNase inhibitor 的PBS，离心（3910g，4℃，5min）清洗样本两次。
  
• 之后重悬细菌在 1mL的PBS中，加入5µL RNase inhibitor，将离心管密封。
  

（11）即刻开展单细菌转录组实验。
注意：若不能立刻开展实验，可于-80℃冰箱中储存；如需运输，请使用干冰寄送。

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