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[分享] 基因过表达构建攻略(二)

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发表于 2024-11-3 18:22 | 显示全部楼层 |阅读模式

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构建好目的质粒后,为确保质粒足量无内毒素

宜用获得的目的质粒进行转化摇菌质粒提取(采用无内毒素的中提或者大提试剂盒)。

这里简要说明下原因:从控制实验成本角度来说,在送出测序前的质粒提取(攻略一中提及)采用的是快速质粒小提试剂盒,该试剂盒价格低廉,但是对内毒素的去除效果及质粒提取的量是无法满足后续实验(包装慢病毒)需求的。所以需要用去内毒素的中提或者大提试剂盒对目的质粒再次提取。如果实验室经费特别充裕,或是出于节省时间考虑,在构建之初就用去内毒素的试剂盒提取足量质粒,则无需二次提取了。

转化前的准备:

制备选择性固态平板:称量2克Tryptone;1克Yeast extract;2克Nacl;2克琼脂糖,转移到500ml三角瓶,向瓶内倒入200ml双蒸水,用无菌透气封口膜及橡皮筋扎好瓶口。放入实验室高压锅内,121度高压半小时后取出(做好防护不要被烫伤),待温度降至60度左右(以不太烫手作为粗略标准)加入200μl 氨苄(浓度100mg/ml)。值得注意的是不是所有的选择性平板都是加入氨苄,具体选择哪种抗生素应该以质粒的抗性为准!!!)

将添加了氨苄的培养基倒入10cm的培养皿(平板),每个培养皿倒入10ml左右,冷却凝固后待用。

LB培养基配制:通常和选择性固态平板同时配制。称量1.5克Tryptone;0.75克Yeast extract;1.5克Nacl,转移到250ml三角瓶,向瓶内倒入150ml双蒸水,用无菌透气封口膜及橡皮筋扎好瓶口。放入实验室高压锅内,121度高压半小时后取出(做好防护不要被烫伤),备用。

转化(沿用攻略一):以stable3感受态细胞为例,从-80冰箱取一支stable3感受态细胞,置于冰上解冻,数分钟后加入2微升质粒,轻柔混匀,冰上放置30分钟,42度水浴90秒(或者45秒),该步骤称为热激,冰上放置2分钟,加入500微升SOC(购买的stable3感受态细胞会附带SOC)或者LB培养基。放入摇床,设置37度200rpm转速复苏一小时。

将复苏好的感受态细胞以300G转速离心5分钟,弃上清,留下50至100微升液体,吹匀后将菌液加入带相应抗性(根据质粒抗性而定)的选择性固体培养基(常用的是氨苄),用接种环划线,静置数分钟,倒置平板放入37度培养箱,12-16小时后取出已经长出细菌的选择培养基平板。

在备用的LB培养基加入150μl氨苄(浓度100mg/ml),用灭菌枪头挑取一个单菌落,连枪头一起加入含LB培养基的三角瓶中,重新用无菌透气封口膜和橡皮筋扎好瓶口。37度摇床200rpm转速摇菌,12-16小时后取出。

质粒提取:参加相应试剂盒说明书,国内天根试剂盒用得挺多,这里贴一个说明书吧

http://tiangen.com/asset/imsupload/up0328126001604555759.pdf

质粒提取后,用Nanodrop测浓度

包装病毒

293T细胞培养:293T细胞是人肾上皮细胞系接受人工改造后得到的,它含有SV40复制起始点与启动子区(SV40有着增强基因转录的作用),表达SV40大T抗原。目前很多质粒都有SV40复制起始点,也就意味着可以在293T细胞中表达外源基因。293T细胞培养很简单,DMEM培养基加10%胎牛血清加1%的双抗,注意刚引进实验室的细胞均应进行支原体检测,防止应支原体污染导致293T细胞转染效率低。

转染
注意:每个实验室使用的包装方法和细节可能有所不同,以下方法仅供参考

转染前一天对293T细胞进行传代,确保第二天293T细胞密度能达到80%-90%。以10cm 培养皿为例,在转染前两小时吸出旧培养基,更换为10ml DMEM加10%胎牛血清无双抗培养基,应从侧壁缓慢加入,避免细胞脱落(了解到部分实验室不换液,或者换含双抗培养基,故该步骤酌情处理)。

转染试剂可使用Lipofectamine 2000或者PEI(线性聚乙烯亚胺)

(1)首先按照
5.6微克 psPAX2
2.4微克 pMD2.G
8微克 of lenti plasmid(目的质粒
加入OptiMEM培养基(OptiMEM挺贵的,如果预算有限,也可以用普通DMEM培养基代替),使得总体积为1200μl。

(2)然后另备一管,加入40μg Lipofectamine 2000或者40μl PEI(10mg/ml)到1160μl OptiMEM培养基,室温孵育5min。

(1)(2)混合后室温孵育20-30min,缓慢将混合物加入293T细胞。放入37度培养箱。16小时后吸出培养基,加入10ml病毒收获液(DMEM + 10% FBS + 1% Pen/Strep + 1.1g BSA/100mL,BSA可酌情选择添加),37度培养箱培养24小时后收获上清液(该上清即为病毒液),将上清液加入50ml离心管,4度保存。再次向293T细胞中加入10ml病毒收获液,24小时后收获,加入第一次上清液收集管,1200rpm离心5min,使用0.45μm过滤器过滤(该步骤主要目的是去除混入的293T细胞),滤过液即为包装好的慢病毒

感染细胞:获得包装好的慢病毒后,可根据需要检测滴度MOI,这里贴一个检测方法,可以参考。

http://fulengen.com/wp-content/uploads/2016/03/User-manual-of-lentiviral-particles.pdf

这里主要谈一下实验步骤

第一天:接种细胞(如肺癌,卵巢癌细胞)至6孔板,保证第二天细胞密度能达到50%左右

第二天:根据病毒滴度及MOI确定好病毒原液稀释倍数(该步骤为了避免病毒浓度过高对细胞造成损伤,过低感染效果不好,因而需找到合适的稀释比例),弃去6孔板旧培养基,加入2ml含病毒培养基,加入10ug polybrene,提高感染效率。8小时后更换新的完全培养基(因细胞不同,可适当调整时间)

一般来说,感染后48h,基因就可以检测到表达。如果带有GFP(绿色荧光蛋白),RFP(红色荧光蛋白)的话,可以通过荧光显微镜观察。

接下来,我们就要筛选出稳定表达的细胞,如果带有抗性基因,如Puromycin(嘌呤霉素),我们可以用Puromycin对细胞进行筛选(浓度1~10 μg/ml,根据细胞而定),杀死无抗性的细胞,从而获得稳定表达细胞。

如果仅含GFP或者RFP,不带抗性基因,则可用流式分选,获得目的细胞。

最后,我们需要检测目的基因是否过表达,可用qPCR或者WB检测,如果符合预期,就及时冻存细胞,这样过表达细胞就构建好了。

本文仅供参考,如有缺漏及错误,欢迎批评指正

原文地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/355136715
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