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[分享] 最近刚刚开始代谢组学的研究,请教尿液,血液样品的收集需要注意些什么?有什么单位可以代做样品,价格如何?

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发表于 2024-10-26 13:40 | 显示全部楼层 |阅读模式

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大家好,最近刚刚开始代谢组学的研究,请教各位尿液,血液样品的收集需要注意些什么?有什么单位可以代做样品,价格如何?

原文地址:https://www.zhihu.com/question/371894407
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发表于 2024-10-26 13:41 | 显示全部楼层
(1) 尿液样品采集需要马上进行萃灭:快速使组织或细胞内的酶失活,防止代谢物的变化。液氮速冻是常用的萃灭方式。尿液采集后需立即放入-80℃或液氮保存。在NMR分析中,建议用0.2um滤膜过滤除菌。GC-MS分析中,由于尿素高温分解产生的氨气可能对检测其他物质造成干扰,因此分析前应加入尿素酶除去尿素。样本量要求200µL/例。LC-MS分析对样品则要求较少,仅需要弃去沉淀冻存即可。
(2)血液样品:包括血浆和血清,血清中代谢物的含量略高于血浆,血清和血浆均可用于代谢组学研究,但是取样尽量一致,要么都用血清,要么都用血浆。
血浆样品:应使用肝素钠抗凝管(EDTA等其余抗凝剂会对质谱信号有影响)采集全血,并尽快进行血浆分离:3000 rpm室温离心10 min,待血细胞完全沉降到管底后,取上层,0.2 mL/管分装至1.5 mL离心管中。-80°C冻存,干冰寄送。样本量要求100-200µL/例。
血清样品:血液收集在离心管中37°C(或室温)静置30 min或1 h进行凝固分层;3000 rpm室温离心10 min,待血细胞完全沉降到管底后,取上清转至干净的离心管中; 再12000 rpm 4°C离心10 min,取上清分装到1.5 mL离心管中,每管0.2 mL,-80 °C冻存,干冰寄送。样本量要求100-200µL/例。
现在市面上提供代谢组学的公司基本上都是基于LC-MS, GC-MS, NMR这三种技术展开。NMR技术的优点是样品可回收利用,但对复杂样品:例如血液样品的代谢组学分析,稍显力不从心,基于NMR的代谢组学数据库还没有大型的可参考标准物质谱图,这就使得解析谱图异常困难,遇到多物质的谱图重叠等问题很难解决。GC-MS由于需要样品衍生化,会有一部分物质丢失,并且由于精密度等原因,所测得的物质较少,并不能完整的反应该时刻的代谢轮廓特征。由于高分辨质谱的发展,配备有高分辨检测器的LC-MS例如LC-TOF-MS越来越成为了代谢组学样品分析的有利武器。并且随着MASSBANK, METLIN,HMDB等数据库的完善,使得LC-MS的数据的物质鉴定效率大大提升。不光如此,在样品的前处理中,使用LC-MS技术所需的处理步骤最为简单,可以很大程度上减少代谢物的流失。因此高分辨LC-MS技术已成为代谢组学中的主流手段被广泛使用。
目前国内做代谢组学的单位有很多,价格不一。如果是华北地区,可以考虑百泰派克,这家公司的价格很合理技术也挺好。
注意事项:建议尽量多的收集样本并分装冻存,100-200µL/管较为合适,且避免反复冻融。
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