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生物实验,尤其是步骤比较多、耗时比较长的生化实验,一定要做质控。WB步骤中,有几个点是可以做质控的。不然,等到最后显影之后才发现问题,为时已晚。
- 蛋白定量:这是一个容易被忽视的点。我们实验室有一句话,叫做“shit in, shit out”。蛋白样品制备后,如果定量不准确,肯定会影响WB结果。如果蛋白定量过程中发现样品浓度相差极大,也可能预示着蛋白样品的质量有问题。
- 胶的质量:跑完胶之后,可以用SYPRO Tangerine Protein Gel Stain染一下胶。这种染色不固定蛋白,不会影响后续转膜。这里会碰到的问题主要就是通常的跑胶问题,诸如拖尾、笑脸、粗带等等,都可以通过改进制样方法(煮蛋白加DTT、离心样品等)、选择合适的胶(降低胶浓度、增大浓缩胶长度等)或跑胶条件(低电压、低温跑胶等)解决。
- 膜的质量:转完膜之后,可以用Ponceau S染一下膜。这种染色可以完全被blocking buffer洗脱,不会影响后续的probing。这里主要是看有没有转膜不均匀、有气泡等问题。改进方法包括选择不同的膜(PVDF或Nitrocellulose)、改进transfer buffer(有的样品需要在transfer buffer里加SDS)以及低电压过夜转膜等等方法。
- 抗体probing:这里其实比较routine,不太会出错(要错也是选错了抗体)。如果前面几步都没有问题,但是最后显影的时候比较“脏”,可能是blocking buffer不行。可能是牛奶没混匀,也可能需要换含BSA的blocking buffer。
你的WB问题可能是多方面的。首先,转膜肯定是不均匀且有气泡的,尤其是第二张图。你需要充分浸润胶、膜、滤纸,并保证它们之间没有气泡。其次,几乎所有的条带都是“哑铃状”的,这说明跑胶温度过高。而且,如果这两张图都是30kD以下的图,那么条带如此扭曲,说明你的上样样品里可能有蛋白交联形成的颗粒。另外,如果你不是在probe蛋白标签的话,你的这个抗体给出太多条带了。你需要考虑换一个一抗。
以上。 |
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