鸟枪法测序为什么要叫鸟枪法？

John

鸟枪法测序为什么要叫鸟枪法？
原文地址：https://www.zhihu.com/question/436613721

检验医师

鸟枪一般是指滑膛的霰弹猎枪。早期的猎枪一般都是简单的把火药和铁砂之类混装，点火后火药与碎铁砂（也即霰弹）一起喷出。现代步枪都是线膛单弹头，打击点是精准的；而霰弹枪打出去会是一片，杀伤范围大但是打击点具有随机性。
所谓鸟枪法测序，就是一种形象的说法，好比你拿一把霰弹枪去“打”基因组DNA，那么喷出去的霰弹会随机的攻击DNA的不同地方，从而导致基因组DNA断裂成一堆碎片。当然现实中肯定不是用真用鸟枪，一般是采用加细玻璃珠超声震碎DNA。
之所以要把基因组DNA打碎成小片段，还是因为测序仪的读长限制，二代测序的读长一般是100-300bp，即使是双末端测序加起来也不会超过600bp；三代尽管读长大大增加，但是相对于基因组来说还是太短了，所以只能打断然后测序。目前基因组宏基因组测序都会有“打断”这一步。