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说实话,这对于没系统学习过遗传学、分子生物学的人还是太难了,不过我尽量简要说几点:
1.你需要的真的是“测序”吗?
人与人的基因组存在各种差异,而随着基因组研究的进展,其中很大一部分差异已经被检测到并记录在了公开的数据库中。如果某个基因的各种基因型(各种可能的序列)都是已知的,而你只是要检测你的研究对象属于其中哪种基因型,那么备选的检测方法有很多种,其中很多是不需要测序的。
为了不依赖测序而检测基因型,你需要预先知道你要检测的是哪个基因上的哪种基因型差异:是只有一个碱基不同(SNV),还是在重复序列上多或少重复了几次(CNV),还是整个长片段重复/缺失(SV)。不同的差异有不同的检测手段(基于PCR,基于酶切,基于核酸分子杂交)。顺便,目前市场上的民用基因检测(比如23andme的)也大都不是基于测序的方案。
2.为了达到你的检测目的,有现成的实验方案甚至试剂盒吗?可以把实验部分外包吗?如果你只需要数据,测序公司的外包业务已经很成熟了。如果你的重点在于自己DIY实验的话,请继续往下看。
3.测序技术
测序技术可以大致分为一代、二代和三代测序。一代测序用于单个中等长度片段(几百个碱基对),二代测序用于大规模并行短片段测序,比如全基因组测序,三代测序用于对长度和速度都有要求的特殊场合。不过,就算是一代测序技术,需要的仪器(毛细管电泳)也不是能轻易DIY的,二代测序仪器更是一般研究机构都不会有,只能找测序公司。
总之,如果题主是认真想做这个项目并且有资金来源的话,最需要做的是查清楚文献,明确研究对象是哪个基因的何种差异,之后再考虑实验方案。 |
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