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[分享] 生物信息学出国推荐,尤其是欧洲的学校?

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发表于 2024-9-27 08:55 | 显示全部楼层 |阅读模式
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发表于 2024-9-27 08:56 | 显示全部楼层
EMBL已经被介绍得很详细了,那我作为在读生来介绍一下Wellcome Sanger Institute的博士项目。
「英国本方向最好的 PhD 项目没有之一,offer 接收率也是最高。选拔培养的学生选组后的产出和地位都和博后无大差异,基本都有机会承接重大课题,毕业后挑选全世界任何想去的实验室。」
Wellcome Sanger Institute桑格研究所,起初建立是为了完成人类基因组计划测序的使命,随后转向生物信息和基因组学研究,以双诺贝尔奖得主Frederick Sanger 命名。
「如果你的研究领域是Bioinformatics & Genomics,那 Sanger 的意义和底蕴无需赘述。这里是基因组学的诞生地,正如LMB之于分子生物学,能让你收获最高水平最纯粹的科研体验。
作为英国最富裕的私人慈善机构 Wellcome Trust 旗下唯一全资支持的研究所,其独特的五年 funding 模式保证近6亿英镑科研经费供30余课题组专注挑战的规模大风险高的 blue sky科研问题,不会让学者因预算局限自己好奇心和问好问题的能力(科研版 ”不要因为贫穷限制了你的想象力”),这也反映在发表文章的质量和影响力(而非数量)」
剑桥大学发学位。Sanger给国际生全奖,生活费绰绰有余,博一博二£22000,博三博四£24000免税,远超剑桥最高标准,比牛津罗德学者/剑桥盖茨学者每年还多几千磅。每年配赠£1500差旅费,但超额只要导师同意出钱就OK,我花的也远远不止这个数。录取时不看国籍,每年大概90%的新生都是国际生,之前还出现过12位新生12个国籍的情况。
不需要套磁,录取之后第一年在三个实验室轮转,之后双向选择确定导师。每年收12位学生,30+ faculty group可供选择,事实上一般只有学生挑老师的份,基本没有去不了的lab(如果某老师太受欢迎可以co-supervision)。申请时间线和美国同步,多亏如此我得以在申美国的时候顺手投中。
博士生招进来之后会被大家当团宠,委以重任,结合大家的国籍来看,是有真正的diversity&inclusion在的。
科研上非常专注,要么不做,要做的就做到世界最好。五大项目包括很热门的单细胞测序,Sanger有Human Cell Atlas的共同发起人莎姐。在癌症基因组/体细胞突变领域也是先锋+引领潮流。就读体验巨好:你对癌症基因组感兴趣?这里是癌症基因组学研究的起源地,你导师就是开山祖师爷。想做Mutational Signature?这个领域的大部分重要paper都是你师兄师姐和你身边的好朋友发表的。剩下三大项目是Human Genetics, Parasites and Microbes, Tree of Life(对全英所有物种进行全基因组测序,探究其他物种取得特殊性状比如不得癌症的奥秘)。
基础设施和pipeline很完善。有专门的湿实验工作人员和测序工作人员,科学家可以从琐碎杂事中抽身出来,专注于思考科学问题。
「授人以鱼不如授人以渔,Sanger 用业界最高标准和规范管理生物伦理,实验室生物安全,开发数据分享,潜移默化地影响未来科学领导者该如何运营最好的实验室和研究所,这或许比培养刷文章和做实验机器更有意义。」
离剑桥市中心比较远所以早晚班车接送,因此大家一般情况都不加班,朝九晚五。虽然不卷,但因为老师们胸中有丘壑,课题设计得好,博士四年一作发大子刊很正常,发CNS主刊也不是特别不同寻常。
无论是学生还是其他工作人员都给报销签证和IHS。配macbook pro或者同价位的windows,要是还缺啥基本也统统可以报销。
就是免除了一切后顾之忧,可以纯粹地做科研。
最后放几张校园景色:










和学长联合写的稿,「」里是学长的补充内容。
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发表于 2024-9-27 08:56 | 显示全部楼层


我就举几个例子

献给所有生命科学本硕博!

有时候选择比努力重要,信息不对称就是世界上多数人事倍功半的元凶。希望想来欧洲从事生命科学研究的学弟学妹看完我的回答对欧洲研究所有更立体的感知。国内生化环材有多难我也有所耳闻,如果这个回答成功给想做生物包括生物信息学的学弟学妹开辟一条新道路,至少知道这样操作是简单可行的,不卷不内耗不焦虑不自我怀疑,我就很满足了。
我了解的就详细写,写在最后面的其实我也没去过或者没有真的很了解,我只是希望大家知道这个所/大学,避免错过宝藏机构。排行榜是教育商业化的产物,指标很迷;科研烧纳税人的钱,不会为了排行花钱搞数据,比如中科院就不可能参与小可爱世界大学排名。博士在很多国家属于工作,本硕阶段还可以抱着划水的心态以学校为荣,但博士往上已经属于学校以我为荣的阶段了。
不要把同学当对手,多和朋友们交流申请,学弟学妹冲!
此处本来写了五千字的欧洲硕博申请经验和建议,大概是这个极为小众的问题下该回答能在网上获得一定流量被你看到的原因之一。但其实与问题无关,已拆分写成独立文章:
欧洲生信博士申请经验总结本回答被转移的部分:

  • 作者背景
  • 转码建议
  • 硕士奖学金
  • 读博路线
  • 申请流程与时间
  • 关于申请美国
  • 开发 vs 应用
  • 关于导师套瓷
  • 关于大学排名
  • 更多帖子分享
接下来提到的所有研究所和大学都是说英文的。
<hr/>欧洲分子生物学实验室 (EMBL)

通过生物信息学关键词看到这个答案的,应该都认识 EMBL,去年一个高中生告诉我中国的生物课本原来也有提及,十分荣幸。我的很多同事都属于一人开创一个领域,爷爷级的就不说了,爸爸级的比如 Jan Ellenberg 就是那种整个领域都跟他 co-author 过因为没他不行的科学家。但是别人的成就和我们其实没什么关系,EMBL 的几个亮点:博士项目工资丰厚,比英国 Wellcome Trust 都高;婚姻/育儿/失业补贴和医保齐全;面试和十几个PI全面深度面谈,包吃住机票免费旅游;申请录取率2.7%,力压 Oxbridge & HYPSM;平均4年毕业很短,可延到5年不耽误以后申PI.



EMBL-EIPP 国际博士项目基本数据

目录把 EMBL 放在国家外是因为它作为欧洲跨政府组织不属于任何国家,员工作为跨政府公务员持特殊通行证。正是因为欧洲纳税人出钱,所以非成员国的 PhD 人数有限制,规定每年最多25%左右,大概有10-15个。成员国有二十几国,能凑够数据中的50国籍,每年录取的非成员国博士国籍变化很大,但近三年每年都有中国籍博士。



EMBL 五国六所

EMBL 和相当多的本土、欧洲、全球的机构和公司有合作关系 Partnerships,包括我认为很酷的与斯坦福形成的 Life Science Alliance:



EMBL 与斯坦福 (Stanford) 的合作关系

此处删除原答案中1500字关于 EMBL Heidelberg 和 EMBL-EBI 的科研和生活体验因为确实与本回答无关,在本答案除了给压力别无他用。以后可以在「在 EMBL 读博是种什么样的体验?」、「在EMBL读博是怎么样一种体验?」、「在EMBL读博士是体验??」等终极问题下粘贴本段。
<hr/>英格兰

现在开始分国家讲大学/机构。在英国待了多年后有两个感受:1. 我居然这么有钱;2. 我居然这么穷。英国是非常没有性价比的,因为一半的英国博士都自费。理工的博士稍微好一点,有项目就有钱,但全奖难说。其实导师不给钱也没什么必要去,一是基本的工资和学费都不开够,别还指望他既有能力又有带你的心。拿CSC的生活费补充也是一条路,或者直接全奖拿帝国理工总统奖学金之类的。不过感觉难度太大/划不来的朋友没有关系的,往下翻瑞士的几个包括ETH或者奥地利或者日本OIST不香吗?不需要将就没有全奖的PhD。需要留意的是如果你要做湿试验学费应该要再加5k镑。作者不是很支持花钱读博,除非是真的非要这个导师 这个课题 这个大学。钱总是要花的,如果非要这个导师 这个课题 这个大学,花钱买到了开心就可以大花特花。读博本来在各种维度都是奢侈品,生而为人本身就是值得奢侈的。
英国读博奖学金概览


  • 最好的博士项目钱都是差不多的,一年到手£22k左右,包括 EMBL、Crick 还有 Wellcome Trust 的各种 program、帝国理工的总统奖学金等,其中 EMBL、Crick、总统奖学金 都是报了学费的超级全奖。拿这些奖学金很难而且经常知道的太晚材料会错过ddl,我有两个朋友就是先当一年助理研究员RA缓着。比如有个认识的人master是年级第一,所以教授告诉他今年虽然错过了明年一定就强推你所以他就可以甘愿当一年RA,但如果自己没底教授也不给个保证的话自行斟酌。
  • 普通一点的项目,基本都是 EPSRC/BBSRC/MRC 等这些 UKRI 相关的项目,一般学费会 Cover 英国/欧洲人标准的,至少给£4.5k的学费和到手£16.5k的奖学金。
  • 英国有规定说伦敦外每年奖学金最少要£14k,伦敦£17k。但是个人理解是招中国学生的往往是不差钱的项目。而且真差钱的组怎么做生物科研,烧的全是钱。
接下来的介绍中没有英国医学研究委员会 MRC,因为 MRC 太大太多我也不是很了解。作者本人给 MRC London Institute of Medical Sciences 做过几个月科研但是由于疫情远程真的没法了解。个人体验不佳所以没有申请过,但总的来说应该是挺好的。
Francis Crick Institute | 和 EMBL 互通有无的招生流程




The Francis Crick Institute 交通非常方便

UCL/KCL/Imperial/CRUK/MRC/Wellcome 一起愉快合作的机构。工资福利不用怀疑 税后一年£22,000,送 UCL/KCL/Imperial 博士文凭。它们有个特别秀的操作:众所周知生物实验室离不开显微镜,而显微镜必须离开震动,而 Crick 在 KX 火车站附近 (King's Cross, 对没错就是哈利波特第二集开场,本地六条地铁线,国内直达全国,国外直通巴黎,流量巨大),结果它整了个泳池装显微镜避震。我们所对地面震动的处理比较粗暴,就是,德国想装风力发电大风车的时候,直接跟政府说这几座山必须保持安静。
Crick 有一个 PI 在剑桥/UCL/OIST每年来回跑,我还是在帝国认识他的,每天面带笑容,这可能就是 Crick 魅力的冰山一角。牛剑的人可喜欢往 Crick 跑了,仿佛没在 Crick 待过就不潮。我在帝国的时候大家还去了两趟seminar。生物方向的 industrial career fair 也会在这里开,可以说是非常核心的科研中心。



Crick 本质

包括 EMBL/Crick/Sanger 等在内的研究所招人的时候会要你填写是否申请了另外的机构,用于防止浪费资源浪费 offer。其实牛津剑桥本科录取也是一个套路,很好,不浪费科研人员宝贵的时间。但是很好玩的是 UCL 所有邮箱把 Crick 的邮件统一放到垃圾箱哈哈哈哈哈,从未 fix



The Francis Crick Institute 内部很新

Sanger Institute 和 Babraham Institute | 挂名剑桥的不止 EBI

都是送剑桥大学文凭的,但是 Sanger 一年只招12人,Babraham 只要2个,太小了吧。我个人觉得如果没有喜欢的组就没什么搞头,因为方向太细了没有什么容错的空间。我举个例子,比如我的同学在海德堡 EMBL 的导师走了去 ERC 当 head,她直接在巴塞罗那的 EMBL 找到了一个很相关的导师继续读博,试想在 Babraham 一个导师离职了……还有很多别的方面的问题,所以大家申请的时候一定要问清楚导师近几年的规划,但是能进 Sanger/Bab 还是很很很幸运的一件事!(当然是凭实力但有实力的人总比位置多所以运气也是很重要的)总之 EMBL-EBI/Sanger/Babraham 等都是挂牌剑桥的,所以剑桥本身的生信我不太了解,不单独多说剑桥的其他项目了,毕竟能不自费进剑桥的话进上面所有所都是有很大机会的,福利和格局都不会比剑桥本身小。其实 Sanger 就在 EMBL 隔壁,一直是合作机构,最新的合同从2018年签到2028年。研究所/大学之间的合作真的太多了,所以大家不仅要看机构本身 还要看其合作关系。
伦敦大学学院 (UCL) | 仅次哈佛的欧洲生命科学+神经科学之王



UCL 生物信息学没有 structured 项目哈,和 DeepMind 一起做 AlphaFold 的大佬们竟然没有开生信博士 program。但是跟着特别厉害的几个大佬直接干也是一样的,就是没有项目就少一点同学和乐趣而已,比如 Professor David Jones 和 Professor Ziheng Yang 等,当然生物/神经科学的合作和大佬就更多了。而且 UCL 机器学习特别厉害老师也多,加上和 DeepMind 密切合作,完全可以来读个机器学习的硕士博士和 AlphaFold 沾沾边。世界上第一个统计系就在 UCL,同时也是第一个接入互联网前身的非美国站点,这里的生物信息学硬核程度可以说你本人来了就是短板。
UCL 附近住的是蛮贵的,建议和朋友在学校附近租house/flat (这样才能每天早上去 Student Centre 占位子啊!)。新的 Student Centre 是真的高端,大家可以了解一下,保证看了就想来自习。总之搞生物进 UCL 不会让你失望的,毕竟 Crick 本人,也是在 UCL 出的名,剑桥的 MRC-LMB 都建在 Francis Crick 路上(笑。
除了 Crick 和 下面要说的 LIDo,我推荐几个 UCL 相关的博士项目,还有很多大家要自己找找:



最近拿了建筑奖的学生中心 那毕竟UCL建筑系也是举世闻名

喜欢大城市的朋友在伦敦的生活一定不会让你失望的。但英国高校博士奖学金比较低。UCL 的奖学金很有意思,基本都说如果是中国人请带CSC进来,虽然我打心底认为在UCL搞生物是一种享受和荣誉,但他这个招人态度是有点恶劣。想挂UCL的人如果心大可以直接申Crick,保底可以申其他的所合作的项目,大家可以顺着这些思路找PhD:确定大学;找大学旗下院系;找大学院系合作机构;找大学合作医院等。比如UCL:
四大生物院系:
各大科研中心:
自营/合作医院:



UCL Hospital

知道有这些相关的可以申请的地方之后就一个一个搜看看他们招不招新 PhD 等等。集成式的 PhD 版淘宝也有,但是肯定不如自己这么找的宝藏,毕竟网上摆出来的单独PhD一般都是挑剩下的。
帝国理工学院 (Imperial) | 共收到38个博士邀请的11个学生

很多人私信我这个所以我写了《帝国理工生物信息学硕士》介绍 MSc Bioinformatics & Theoretical Systems Biology,祝想去帝国玩一年的学弟学妹拿到 offer
答主当年还没入门生信的时候,就是因为想留在伦敦和大佬们继续愉快地生活才选择了帝国理工,重点是只有帝国理工有生信硕士项目,牛剑UCL都不专门开这个(computational biology 和 bioinfromatics 较真起来区别还是很大的,一个是biology一个是信息学)。憨憨的大佬 Professor Michael Sternberg 开办的 Wellcome Trust 4年 PhD 项目,我很荣幸是最后一届招 PhD 的时候进去的,看到了最后的辉煌,以后硕士项目还会继续。博士没了,所以和 UCL 没有区别了,没有program的钱。其实这两年生物/医学都冠名AI的program了,本质还是很多生信的。别看这个录取要求好像 2:1 不是很难的样子,我们当时没有人 2:1 进去的,都是一等学位毕业,我倒数第一。同学们毕业了想读博士的都找到了喜欢的,不想继续的也有直接 Tier 1 Visa (special talent) 直接留英,或者继续当医生等。在读期间收到过至少38封邮件直接往我们的硕士项目招博士,包括剑桥大学某组直接发邮件说从我们项目里的招一个,可见声誉之好(不过最后好像没人去??)
帝国 CISBIO 这个项目的奖学金是蛮好的,和 Crick 差不多:Year 1: £22,278;Year 2: £24,093;Year 3: £26,057;Year 4: £26,839;但是在伦敦所以真的不够花。设备的话会送你1500镑的电脑较为平庸。但是以后想来的朋友建议申请总统奖学金,工资高还有旅游的钱。我的语气很轻松并不是因为拿奖学金很容易,而是拿不到可以不来 : ) 南肯读博四五年还是有点无聊的,戴安娜最喜欢的意大利菜一个学期吃了十几次我都吐了,学校门口就是德国菜,来了德国发现那也敢叫德国菜。可能也是我在伦敦待了五年的缘故,与其又贵又无聊可以去其他城市便宜着无聊,无聊地山清水秀。很怀念和同学一起品酒吃生蚝开派对蹦迪的日子虽然我根本不喜欢蹦迪,不过他们不知道知乎是什么。最可惜的是帝国理工的毕业典礼没有举办因为,疫情 : )



别人的毕业典礼

补充一下帝国的生信除了已经不搞博士的 CISBIO,还有很多很多院系做生信,包括 MRC London Institute of Medical Sciences,总的来说 MRC 的项目都是挺好的。这几天有帝国直系学妹联系上我,这个项目有几个变化:1. 大家不想读博,这可能是因为一旦没有博士 funding 了来读 MSc 的人一开始就不是冲着读博来的,而且没有一年五个高新全奖博士做榜样大家不会觉得读博比工作好;2. 人多了,我这届16个,下一届23个,看来 Michael 也不是非要小班教学。
伦敦国王学院 (KCL) | 伦敦高校生信引用第一的大佬在这

我明白有的人对KCL的印象不太好,基本也是道听途说或者说生源一般。那你看苹果手机那么贵,谷歌的程序员就比苹果的差?学生是用户,是韭菜,只看录取难度的人还真把自己当大学教授了?在 KCL 的 Professor Tim Hubbard 手下做事和前面提到的大佬们有什么区别?进 Crick 可以挂 KCL 的名,还有下面会说到的 LIDo。
剑桥大学 (Cambridge) | MRC-LMB 才是真剑桥自己的

那么多挂名剑桥的其实自己的声誉在业界已超过剑桥,但唯有 MRC-LMB 死死绑定剑桥,连域名都是剑桥大学下的 MRC Laboratory of Molecular Biology(反观美国名字很像的 MBL 隶属于芝加哥大学却不太想和芝大扯上关系,笑),它的博士项目 LMB International PhD Programme 每年录取 20-30 个博士研究生。
牛津大学 (Oxford) | 项目很多 申请机会很多

牛津项目很多,搜一下好多个 Centre for Doctoral Training (CDT)。作为一个城市比剑桥更城市,但肯定不比伦敦繁华好玩,真想去的话可以一个项目没申请上就接着申下一个。我的同班同学就这么申请进了第二次申的项目,所以不要气馁。还有一个华大基因工作了几年的校友听了我的推荐进了 Big Data Institute,之所以我很推荐这个因为该机构主要做 public health,组很多、钱到位,比较好申请、也比较好申请到钱。请朋友们不要一听到好申请就对我的言论提出质疑,毕竟世间万物都是小马过河、而你的质疑一定是对的(笑)。申到了就是赚到,好不好申都申一下好吧。还有一个牛津大学和牛津布鲁克斯大学合作的生物博士项目挺好的。布鲁克斯的文凭如果有的读者有怀疑的话,我反正是见过 Brooks 数学硕士毕业在英国某银行找到后台工作留英的,也有大把 G5 毕业啃老的。
LIDo 项目 | 位于伦敦的英国最大生物博士项目

LIDo - London Interdisciplinary Biosciences Consortium 是 BBSRC 旗下最多钱的项目,合作关系如图。每个领域的大佬都能找到,正统偏门的研究样样都有。真的超级好玩,当时有二十多个教授联系我 sell 自己的项目,有好几个都非常神奇有趣,但是他们开的工资实在没有竞争力毕竟科研不是什么方向都很有钱的,所以是作者拒掉的最心痛的 Offer。还有一个好处是第一年可以任选两个机构做项目,再定 PhD 项目。不多说了,这张图 懂的都懂。在帝国读生信博士项目的同学里有一个意大利妹子,见人就推荐这个,我也是因为她墙裂推荐才申的。



LIDo 的参与机构

但是我要给大家排个坑,就是申请的时候不要怕被拒,你就一口咬定要奖学金否则不活了。这么多机构、这么多教授还有合作的公司,一个愿意给钱的都没有还待在这里干嘛,侮辱性极强。还有虽然古生物、兽医相关的课题很好玩,但是大家还是对新鲜事物抱谨慎态度(不要投资不懂的行业),面试的时候正好可以聊聊毕业出路。
苏格兰

其实我不太清楚苏格兰会不会和英格兰在博士教育和招聘上有很大区别,但是根据我对苏格兰本科及以下教育的理解,盲猜会有些许区别。苏格兰这个国家,严格地来讲,和英格兰很不同,就连文化都不像一个联合王国该有的样子。其实苏格兰的大学历史悠久血统高贵,只是名气不行,毕竟成王败寇,一个国家对于其教育系统和大学声誉都是有很大影响的。根据这个逻辑我认为中国的大学声誉在我有生之年就要整体把英美挤下去。
爱丁堡大学 (Edinburgh) | 苏格兰国 TOP1

这个城市我真的太喜欢了。有意思的是爱丁堡等苏格兰大学参与英国政府评审的时候都是合起来提交数据的这也是我不太确定苏格兰博士和我想象中的会不会不太一样。爱丁堡属于好大学里开设 MSc Bioinformatics 并且机器学习很厉害的,但是我有点搞不清楚为什么英国的大学发 SIGBIO/ISMB/RECOMB 都蛮少的所以对这个系不是很了解的时候也不知道该怎么证明它挺好的,就看它开设了这个专业+城市不错是不是过于不负责任。如果想在苏格兰找个程序员工作来爱丁堡是真的来对了,当年 open day 听说亚马逊苏格兰总部 80% 的人都是爱丁堡的。
邓迪大学 (Dundee) | 生物拔尖的单属性大学

如果你在网上看到有人说 University of Dundee 很不错,虽然听起来像是在骗人但不是的哈。这个大学 可是有 Wellcome Trust 开的博士项目 Year 1: £19,919;Year 2: £21,542;Year 3: £23,298;Year 4: £23,997,诚意满满。项目叫 Wellcome 4-Year PhD Programme in Integrated Molecular, Cellular and Translational Biology。不过其实 Wellcome 的项目都会说
Who can't apply
You can't apply to carry out activities that involve the transfer of grant funds into mainland China.
我一直没查过是什么意思。不过 Dundee 的确说了中国学生要 CSC。但有 Wellcome 的认可就说明这个项目的确很不错。而且 Dundee 还有 MRC Protein Phosphorylation and Ubiquitylation Unit (PPU),Sir Philip Cohen FRS FRSE FMedSci 坐镇。年轻的还有比如 Prof. Geoff Barton 等很多大佬,是帝国生信项目主任的弟子,去年还一起 virtually 喝过咖啡嘿嘿。这个大学真的不出名,在苏格兰,又不是古典大学,却还用着古典大学的内核,全靠生物学和建筑学等几个科目撑着。可以说这里的生物和生信真的都很不错。维基百科表示它近年来其分子生物学、生物化学和遗传学系不断发展,成为英国最有影响力的相应大学系,因为其药物发现和发展获得女王周年奖。个人认为还有个重点是这个大学不仅学术不错,生活上作为校园也是屡次赢得苏格兰第一。



Dundee Campus

<hr/>EMBL和英国更完 以下各国也只需要英文

读到这里不点个赞你的良心不会痛吗,为了写这个两万字答案已经花了无数个夜晚。
我也不可能懂整个欧洲吧,但是有特色的待久了总会听过,但是我避免灌水拒绝强答,只讲我知道的,可能会漏很多很多。
<hr/>奥地利(英语)

只需要讲英文
维也纳生物中心 Vienna Biocenter | 教育+科研+公司一体

先讲我墙裂推荐的一个项目。大的生物中心欧洲总共就那么几个,德国EMBL/西班牙PRBB (EMBL也在这)/瑞士Biozentrum/维也纳Biocenter等,有的人想要生活愉快就必须要有志同道合的朋友,所以我推荐一定要去大的,国际学生多的,不然本地语言学不会会抑郁。德语区而且大家英文很好,有同事在 Vienna Biocenter 待过,评价 OK。



德语区最古老的维也纳大学合作



维也纳大学

重点来了,这个地方敢叫生物中心那肯定不只是做科研的,这地方有38个生物科技公司,外带两个企业孵化器!!维也纳大学德语区最古老,神圣罗马帝国时期建立,EMBL挂名的海德堡大学是她建立之后的德国最古老。



教育、科研、公司 三位一体

读书的时候在这里建立人脉不香吗?
瑞士(英语)

感谢评论区指出瑞士的 Postdoc.Mobility 全瑞士的博士都可以申,网上有中国人申请到的例子,所以有必要提一句。网上有人说 ETH 欧陆第一,我不懂,为什么文科艺术0分的大学能参赛,如果非要喊,就喊理工第一吧。个人和 EPFL 以及 TUM 合作紧密一些,但学姐学长 ETH 的多一点,不知道袒护谁了。你们开心就好。
苏黎世联邦理工 ETH & 苏黎世大学 UZH

进了 ETH 读博士不仅有钱,还很有钱。读个博士比在英法德当 lecturer 都赚得多。正常的工资起薪就是33w RMB,读着读着就变成35w。税只有5%啊 :)瑞士消费高,但对标上海什么工作给35w?ETHZ 和 UZH 放在一起是因为 ETH 是理工大学,生命科学都是瑞士的真大学在做,所以比如生物信息学和神经科学就是两个机构合作的。



ETH 博士工资 最高可以拿到 57w RMB一年

洛桑联邦理工 EPFL | 放假可以实习/去 ETH 上课

EPFL 的数学女博士后拿了2021奥运冠军 : )
EPFL 的学生由于是法语区跟从法国学制,可以暑假去 ETH 上课,但 ETH 是德国的学制,排不出时间去 EPFL。每个夏天看不上 ETH 可以去实习,实习太重要了,可惜 EMBL 公司制度我就没机会了。这里是 ETH 官网原文



EPFL学生可以去ETH上课

巴塞尔生物中心 Biozentrum|Basel 才是瑞士文化中心




Biozentrum

巴塞才是瑞士的文化中心!而且就生命科学来讲都是苏黎世大学、巴塞大学这种全科大学才搞,不要迷信理工大学,虽然他们搞起生物来真的挺厉害的但是论体量和历史真的就是个理工学院。
别看 Biozentrum 外观比不上其他所的设计,内部神了,看图:



Biozentrum 新楼内部美翻

<hr/>德国(英语)

德国的大学做科研全是跟着所合作的。一个是因为德国的所又多又大,另一个是因为排除大学差异,避免英美式不道德的精英教育。这里不评价德国做的好不好,情况就是这么个情况。所以德国除了两个EMBL还有啥?马普所。但你以为马普所就是全部了吗?




海德堡大学 (Universität Heidelberg) | 德国最老 神圣罗马帝国的传承

我本来不想放上来,因为我一开始觉得海德堡厉害的人都集中在研究所里,而且以为免费的大学设施应该不太行,强行放上来可能会有护短嫌疑,直到博二终于亲自去海德堡大学助教,感觉这个大学拥有的资源真的多。首先新楼旧楼都很精致,根本不像缺钱的样子,我现在回想起 UCL 和帝国理工的部分楼还没海德堡大学好(帝国理工主校区的楼是真的破);师资我其实有点惊讶,我的金主爸爸项目每年组织讲课都是慕尼黑理工、科隆、EMBL、马普所、还有海德堡自己的人一起跑过来讲课,这是植物学啊这么偏门的奇妙学科居然在海德堡大学可以这么庞大;我在海德堡的导师也是 KIT+海德堡 合作的;总之这几天莫名发现海德堡大学真香。推荐。
海德堡现在非常多工地,包括大学和图书馆都在翻新装修等等,感觉发展是挺快的。医疗环境特别特别好,很多人会从世界各地来海德堡的各种世界闻名的医院看病,比如海德堡医院、ATOS 等。部分小诊所和国内顶级医院合作紧密。
International Max Planck Research Schools | 马普所自家研究生院

全球连锁 80+所,都开到中国上海了。不过马普所的工资的确不高不低,还要交税,看个人喜不喜欢这个所所在的这个城市吧。我在中科大的同学去面某自然科学相关马普所的时候居然得知没有CSC不录,所以其实马普所是很小气的,至少面对中国人的时候不阔,但计算机能开到80%,还可以。



德国内部马普所分布

有的马普所很小,比如法兰克福做神经的,但人家做的是章鱼所以贼好玩,大家一定要精确到组地做调查。我列一下生物相关的:

  • Environmental, Cellular and Molecular Microbiology, Marburg
  • Evolutionary Biology, Plön
  • "From Molecules to Organisms", Tübingen
  • Global Biogeochemical Cycles, Jena
  • Heart and Lung Research, Bad Nauheim
  • Infectious Diseases and Immunity, Berlin
  • Neurosciences, Göttingen
  • Cognitive and Systems Neuroscience, Tübingen
  • Marine Microbiology (MarMic)
  • Molecular and Cellular Biology, Freiburg
  • Molecular and Cellular Life Sciences, Munich
  • Molecular Biology, Göttingen
  • Molecular Cell Biology and Bioengineering, Dresden
  • Molecular Biomedicine
  • Multiscale Bio-Systems, Potsdam
  • Organismal Biology
希望你们看到这个 list 的重点,不在于说哪个好不好或者环境如何,在于有这么多研究生院,想空手而归真的很难,至少面试机票蹭一波吧?疫情没过就要申的别哭。
中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所 | 上海的马普所体验

根据评论区的说法这所基本等于没了,删除本段。
亥姆霍兹联合会 (Helmholtz-Gemeinschaft) | 德国真·第一大科研机构

【待补充】
偏基础科学的应用,不像马普所只基础科研。
德国国家癌症研究中心 (DKFZ) | 癌症相关才是长期热门

【待补充】
硕士同学有一个医生,读生信就是为了做癌症 wet + dry lab 科研,癌症相关的课题永远都是资金不断的。DKFZ 一般来讲是和海德堡大学合作,但最近看到有个 DeepMind 的 researcher 是 DKFZ+KIT 毕业的,细节就不写了。
日本(英语)

众所周知,日本是欧美国家。大学我就不说啦,入学考试麻烦的很。但 OIST 必须有姓名:
沖縄科学技術大学院大学 (OIST) | 日本国际化的世外桃源

进去还是做生物的,出来可能就是量子物理,因为他们选方向不像是欧洲这种为了一个项目而招人进来的。研究所头头是以前马普所的 boss. 认识这个所还是因为一个剑桥/UCL/OIST三教职的 PI,所以不论是质量还是方向都靠谱。·这个地方去上海 2h,比去东京 2.5h 还近。待遇比不上欧洲,但住的应该很舒服,喜欢海的朋友必须关注!!!



OIST

但是我说实话吧,去机场真的难。
<hr/>北欧(英语)

北欧五国的财力和对女性的友好程度,如果没有好好了解过,应该真的很难想象。在北欧国家,博士毕业即享受永居政策!!在瑞典带高薪休产假可以休480天,最长2年!产假不通过导师,是政府的规矩。因为答主很早就做了选择来现在的组,所以真的没有看太多地方,北欧只能提一下我朋友喜欢的两个:
卡罗琳斯卡学院 (Karolinska Institutet) | 发诺奖的世界最大医学院

【待补充】



Karolinska Institutet

以色列(英语)

魏茨曼科学研究所 (Weizmann Institute of Science) | 《自然》2019评的学术世界第二

【待补充】



Weizmann Institute of Science

<hr/>请勿转载谢谢。以后根据自己的认知更新也会回来更新的。觉得我漏了很宝藏的机构请评论区补充!如果觉得我哪里说得不好也欢迎评论。
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发表于 2024-9-27 08:57 | 显示全部楼层
谢邀。
关于生物信息学方向的好学校

  • 首推EMBL,全球三大生物信息学机构之一,我们现在所用数据库大多由他们开发。但是他们的PhD项目招聘每年有固定的时间,你可以从这里查看,EMBL International PhD Programme按你的描述,应该能赶上下次申请。
  • 高校类的话,像海德堡大学,根特大学,鲁汶大学,卡罗林斯卡学院,KTH, 格罗宁根大学,莱顿大学等。每个学校都有很强的研究组,具体可去他们的官网查看,关于这些学校是否有open position,最快的查看方式是从https://euraxess.ec.europa.eu/jobs/search这里看,比如搜索“bioinformatics”and“Ghent”,会展示目前所有有关的项目,通过“read more”获取更多信息,包括导师的联系方式以及需要的材料等,这样可开始套磁或者按照上面的指示走网申通道。


具体的申请经验参考我这篇:
贰拾壹:DIY欧洲带薪博士,你可以的祝好运。
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发表于 2024-9-27 08:58 | 显示全部楼层
你好,另一个回答里已经介绍了几个学校,我来补充北欧的学校吧。北欧生物制药方面最厉害的是卡洛琳斯卡大学了,它是诺贝尔医学奖的评奖方之一。其他的比如乌普萨拉大学、隆德大学这方面也有不错的教育水平。
另外,博士在瑞典是工作,不需要交学费,而是可以每个月领工资。这点是蛮大的优势。不过我们舍夫德大学中国区招办这边只负责本科和硕士阶段的招生,那就借楼为看到的同学们讲解一下我们舍夫德大学的生物信息学吧~
专业和课程介绍

生命科学是舍夫德大学的强势领域,开设有英语授课的生物信息学3年制本科和1年制硕士项目。
本科阶段着重于生命科学的基础知识,处理和分析生物数据的知识和技能,硕士阶段侧重生物信息的分析、编程、统计。
强大的科研背景

舍夫德大学生物信息学领域设立有System biology系统生物学研究小组,该小组的研究领域包括生物研究方法的算法和软件开发。目前,该小组的重点在生物标记的鉴定和大规模数据的分析整合。舍夫德大学的研究团队与行业合作伙伴、其他学校的科研团队有密切的合作,并在多个领域取得了成果。我们的合作伙伴包括:Astra Zeneca, Takara Bio Europe,Unilabs AB,Swedish knowledge foundation,哥德堡大学等。这点对于想申请博士的同学,可以了解一下。
就业机会

瑞典在生物制药方面拥有非常先进的技术,此次率先研发出新冠疫苗的Astra Zeneca就是英国和瑞典合资的生物制药公司。除瑞典外,你也可以在欧盟其他国家,或者欧盟以外的地区从事跨学科、多领域的科研或者专业工作。

——瑞典舍夫德大学驻中国区招办,欢迎留言和私信咨询~希望大家都能进入心仪的学校,干杯~
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发表于 2024-9-27 08:58 | 显示全部楼层
欧洲的话重点推荐EMBI几个重点lab: 英国一个 、德国两个。ETH也有相当不错的program,不过好像是硕士。但他们也有相关的phd在cs department。剑桥有computational biology。伦敦也有几个。 楼主想读bioinformatics phd最佳选择还是美国。
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