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[分享] Western blot条带图片排版和数据分析过程

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发表于 2024-9-26 20:13 | 显示全部楼层 |阅读模式

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Western blot免疫印迹(以下简称WB)实验作为检测蛋白表达相对定量的技术,在完成Western blot实验后,得到的是蛋白条带,还需要再对Western blot条带进行结果处理。对于WB结果处理的过程,主要分为3个部分:
1. 用PS软件进行排版;
2. 用image J进行灰度值分析;
3. 用prism软件进行作图分析。

一、 图片排版
1. 打开PS软件,打开WB图。选择【标尺工具】,对着WB条带画一条直线,接着点击【拉直图层】



Western blot条带显影图

2. 新建画布,将用【矩形选择框工具】选中条带,复制到新建的画布中;在不改变台条带趋势的情况下,可以对条带进行曝光度调整(图像-调整-曝光度);


3. 同样的方法,我们可以将第二个条带第三个条带拖进来



4. 描边。选择图片后,点击编辑-描边,修改宽度和颜色


5. 最后标注就可以了。


二、 灰度值分析
1. 打开image J软件,打开以上排版好的WB图;
2. 转为灰度图片:点击image- type-8 bit
3. 设计参数:点击analysis-set measurments



4. 设计单位:点击analysis-set scale ,选择pixel单位



5. 分析条带:选择矩形选框工具,框住条带,点击Analysis-Gels-Selecit First Lane(或快捷键control +1),然乎再次点击Analysis-Gels-Plot Lanes(或快捷键control +3)
6. 封闭开口:选择直线工具,将开口封住,按住shift键,同时画下直线,将开口封住



6. 得出数据:选择魔棒工具,一次点击各个框,即可得到相对应的灰度值数据


三、 数据分析
1. 对于我们得到的数据,可以将目的蛋白的条带数值/内参条带的数值,再将得出的数值以对照组数据为参考做均一化处理,即可得到表达趋势值。
2. 我们可以将得到的数值标注在wb条带的下方,如果进行了3次重复实验,也可以通过prism软件进行数据处理,做成柱状图并进行统计学分析。

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原文地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/633554803
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