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[分享] 如何理解 PCR技术可以检验目的基因是否插入某细菌(举个例子)的DNA上?

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发表于 2024-9-23 12:44 | 显示全部楼层 |阅读模式
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发表于 2024-9-23 12:45 | 显示全部楼层
pcr全称是聚合酶链式反应,主要作用是放大扩增特定的dna片段。(来自百度百科)
假如我们尝试把A基因转化到B细菌里,我们会用到质粒(一种小型环状dna)。
(要把大象装冰箱,拢共分几步?)
第一步先把质粒用酶切开
第二步把A基因用酶连到质粒上
第三步将质粒转到B细菌中检测A基因
这里就是问题关键,如何检测?
这里就需要pcr出场,之前B细菌是没有A基因的。因此我们设计一对引物p,能够特异性的识别A基因,在pcr仪中开始扩增。
pcr仪中:
先高温把双链dna变成单链dna,
再低温引物p去寻找A基因(叮,找到了/嘣,没找到),
最后合适温度开始复制扩增。
下面会有两种结果
第一种是A基因在B细菌里面,你就会获得一大堆A基因片段,去跑琼脂糖凝胶电泳会看到明亮的条带。
第二种比较坑爹,A基因不在B细菌里,你的琼脂糖凝胶里就空空的,啥都没有(好了,你可以重新做了)。
也就是说,当你在看到凝胶上亮亮的条带时,就说明A基因在B细菌里。
但是,这只是定性的看。如果想看A基因的序列有没有问题(突变),就需要送测序公司进行测序,然后获得测序片段,与数据库中的A基因序列进行比对。
碱基完全一致,OK,结束,进行下一步实验。
碱基不完全一致,好的,重做,再来一遍。
End~
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发表于 2024-9-23 12:46 | 显示全部楼层

  • 目的基因不是插入细菌,而是转化进细菌。转化的意思通俗上讲,就是进入。
2. 目的基因不是直接进入细菌,而是先要连接在载体上。


3. 大肠杆菌一直不断复制,目的基因的量也不断增加。
3. PCR首先预变性,这一步需要95°C的高温,可以使大肠杆菌裂解,载体就暴露出来了,目的基因也就暴露出来了,然后可以用pcr程序检验目的基因。
求赞同求赞同!
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发表于 2024-9-23 12:46 | 显示全部楼层
要理解这个问题,可以先去了解一下pcr技术的原理。聚合酶链式反应(PCR)是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA复制,PCR的最大特点是能将微量的DNA大幅增加而且非常灵敏。如果目的基因在细菌的DNA上,相当于基因组上有我们的目的基因的模板,当加入引物 pcr反应体系后,在适当的反应条件下就可以进行扩增啦。
反之,如果细菌DNA上没有目的基因,那么即便加入再多的引物和反应体系等,都不会扩增出来目的条带。
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发表于 2024-9-23 12:46 | 显示全部楼层
说一个比较常见的,连接T载体,假设把一段序列连接到t载体上,然后转化大肠杆菌,此时用T载体的序列作为引物(一般用M13)进行pcr扩增,如果目的基因已插入,那么扩增出的片段长度应该是(目的基因长度+M13上下游引物长度),如果没插入,那么扩增片段长度是M13上下游引物长度。
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发表于 2024-9-23 12:47 | 显示全部楼层
比如提细菌的DNA,然后以插入序列为靶序列来跑PCR,如果能扩增出来,就说明样品中的确存在插入的序列。
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