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[分享] 免疫荧光图片Merge,荧光强度统计PS+ImageJ

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发表于 2024-9-16 16:24 | 显示全部楼层 |阅读模式

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免疫荧光


PS图片处理:
Step.1 将图片拖入ps软件
Step.2 “command +M”调用"curve"功能,调节图片曝光程度
Step.3 然后根据图片的尺寸大小建立一个相同大小的画布,300 像素/英寸的清晰度;黑色背景。
Step.4 首先,在右下角把图层选项中“正常”改为“滤色”,然后将两组dapi和染色图层一同选上,右键进行“图层合并-merge”
Step.5 将图片的透明度调节至50%左右,并可以根据具体情况进行调节。
Step.6 然后根据之前选择好的curve参数调节两组图片。
谷歌图片处理:
设置参数-谷歌-20211029

targetBlackwhite
DAPI5200
VPS13C20253
GSTP15180
Image J 处理荧光强度处理:
Step.1 导入图片
打开Image J,File→Open→打开要测量的图片。


Step.2 转换图片格式
Image→Type→16-bit(此步骤是将照片转换成为灰度图片,举例为16-bit,但实际可根据需要选择8-bit或32-bit)。


Step.3 设置测量参数
1.Analyze→Set Measurements;


2.在弹出的测量参数设置选项框中,勾选需要的测量参数:Area(所框选区域面积);Mean(框选区域平均灰度值);IntDen(Integrated Density)(框选区域荧光总强度),点击OK确认;IntDen=Area×Mean。
2.在弹出的测量参数设置选项框中,勾选需要的测量参数:Area(所框选区域面积);Mean(框选区域平均灰度值);IntDen(Integrated Density)(框选区域荧光总强度),点击OK确认;IntDen=Area×Mean。


Step.4 调出ROI Manager界面
1.Analyze→Tools→ROI Manger;


2.得到并框选Show All及Labels。


Step.5 在图片上选择测量对象(带荧光的细胞以及背景)并计算
1.点击主界面的套索工具;


2.选择第二步中转换格式的图片,用套索工具在图上勾画出一个荧光细胞轮廓后,在ROI Manager界面点击Add,在下ROI Manager左侧栏处会出现一个对象,点中后选择Rename,可以对该对象重命名,此处就先将其命名为a,点击确定OK;




3.按照步骤2继续用套索工具在照片上勾选出多个测量对象,并按照顺序以及目的重命名,这里就框选了4个细胞a、b、c、d,及两个背景对象A、B(在具体实验中框选细胞自然是多多益善);


4.选中ROI Manager左侧栏第一个对象或最后一个对象,按住Shift,点击相对应的最后一个对象或第一个对象,即可对所有对象进行框选(如选中B后,Shift点击a);


5.ROI Manager界面点击Measure,弹出如下所框选对象的数据。


Step.6 整理数据
1.Edit→Copy,可以将数据拷贝到Excel表中;



2.最后一列数据RawIntDen可以删去不需要(有些Image J软件不会出现该项数据),整理计算数据:修正IntDen-Area×Mean(背景)。


Step.7 按同样的操作步骤对另一张图进行分析
最后,分析结果如下:






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