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酶 是一类大分子生物催化剂,大部分酶是蛋白质,有少部分酶是具有催化活性的RNA分子。由生物合成后,多留存于其细胞内,一部分会释放到其生存环境。几乎所有细胞内的代谢,都离不开酶。
己糖激酶催化木糖反应,图片来源:Wikipedia
无机催化剂 多为金属单质、氧化物或盐。大多为自然存在,少部分可以由生物合成。
二氧化锰,图片来源:Wikipedia
酶 & 无机催化剂有如下差别:
由于催化机制的差别,酶相对于大部分普通无机催化物具有极大的高效性 [1]。一个比较极端的例子是乳清苷-5'-磷酸脱羧酶,该酶可以使在无催化剂条件下需要进行数百万年的化学反应在几毫秒内完成 [2][3]。
同样由于催化机制的差别,酶相对于大部分普通无机催化物具有专一性。酶在催化化学反应前必须要与底物结合,且通常仅能与寥寥数种底物结合。专一性通过结合区的形状、电荷、亲水性与底物互补实现。因此,酶可以用来区分化学选择性上、区域选择性上、立体专一性上有所不同的结构相似的分子 [4]。而无机催化物通常可以催化一类反应,没有专一选择性。
生物可以通过多种方式精准地调控酶的性能。如辅助因子作为正反馈机制 [5],亦或是酶抑剂作为负反馈机制 [6]。而无机催化剂少有精准调控的机制。
蛋白质与核酸的不稳定性,决定了酶的不稳定性。当超出适宜的温度和ph值后,酶的活性会显著下降。加热时或与化学变性剂接触时,酶结构会发生去折叠(即变性),原有的结构被打乱,活性也往往随之丧失 [7]。但是也存在耐极端环境的酶,如生活在火山环境(比如热泉)中的细菌的酶具有很强的耐热性。
总结
酶的高效性、专一性、可精准调控性决定了其在生物化学中不可替代的地位,而不稳定性却又限制了酶在工业上的应用。
引用:
[1]:Stryer L, Berg JM, Tymoczko JL. Biochemistry 5th. San Francisco: W.H. Freeman. 2002. ISBN 0-7167-4955-6.
[2]: Radzicka A, Wolfenden R. A proficient enzyme. Science. January 1995, 267 (5194): 90–931. Bibcode:1995Sci...267...90R. PMID 7809611. doi:10.1126/science.7809611.
[3]: Callahan BP, Miller BG. OMP decarboxylase—An enigma persists. Bioorganic Chemistry.
December 2007, 35 (6): 465–9. PMID 17889251. doi:10.1016/j.bioorg.2007.07.004.
[4]: Jaeger KE, Eggert T. Enantioselective biocatalysis optimized by directed evolution. Current Opinion in Biotechnology. August 2004, 15 (4): 305–13. PMID 15358000. doi:10.1016/j.copbio.2004.06.007.
[5]: de Bolster MW. Glossary of Terms Used in Bioinorganic Chemistry: Cofactor. International Union of Pure and Applied Chemistry. 1997 [30 October 2007].
[6]: Laurence A. Moran, Robert Horton, Gray Scrimgeour & Marc D. Perry. Properties of Enzymes. Principles of Biochemistry (Fifth Edition)], Pearson. 2011: 148–152. ISBN 0-321-70733-8.
[7]: Petsko GA, Ringe D. Chapter 1: From sequence to structure. Protein structure and function. London: New Science. 2003: 27. ISBN 978-1405119221. |
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