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[分享] 你们实验室在用质谱做什么?

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发表于 2024-9-13 14:12 | 显示全部楼层 |阅读模式
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发表于 2024-9-13 14:12 | 显示全部楼层
用LA-ICP-MS做矿物的原位点、线分析,然后根据时间信号曲线,分析元素赋存状态;或选取同位素对,进行年代学研究,或元素地球化学行为研究;或进行成分投图,来对比不同成因地质体成因成分关系。
挑战在于,样品的制样步骤繁琐,一些罕见矿物难以选择标样。
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发表于 2024-9-13 14:13 | 显示全部楼层
我所参与的课题主要是质谱在神经科学领域特别是脑图谱领域的应用,简单讲是如下三部分:

  • (单细胞)蛋白组学在神经元分型上的应用;


(非原图,本人有修改)
生物学意义和发展趋势可参考近两年single-cell RNA-Seq在neuroscience的应用。


2.质谱成像在脑图谱上的应用,这里贴一个常规的pipeline,即MALDI-MS在组织成像上的应用。


3. 仪器部分的创新因涉及技术细节,暂不方便透露,以后有机会再填坑。
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发表于 2024-9-13 14:14 | 显示全部楼层
在药企:小分子定性。药物杂质研究。药物降解产物定性。体内降解产物定性。药代动力学定量。保健品违规添加检测。
在有机方法学实验室:反应监测。小分子定性,解析结构。偶尔前端液相色谱坏了也弄一弄paper spray 和 DESI,但谱图从来都没有文献里干净,总有强基底。
再后来,没找到有质谱用的工作……
闲着无聊数一数用过的质谱仪吧。
sciex API2000, API4000。
Waters xevo TQD, QDa。
Thermo LTQ。
Agilent 6890-5977MSD。
岛津 GCMS-QP2010, LCMS-2020, IT-Tof 8050。
好像也没有什么高级货,都没试过orbitrap,真是贫穷。
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发表于 2024-9-13 14:14 | 显示全部楼层
本科实验室:
MALDI-TOF-MS/MS
内行一看就知道做啥了,蛋白质组学啊~做蛋白质定性定量方法,分离方法,小分子的软电离方法,蛋白翻译后修饰,药物蛋白相互作用,质谱成像
LC-MS(QQQ),GC-MS
农药及其降解物的结构鉴定

研究生
LC-MS(QQQ) GC-MS
LC-MS(Q-TOF)
LC-MS-NMR
定量靶向/非靶向代谢组学

热点:MALDI小分子电离方法,成像方法,各种难分析物质方法开发,无标记定量手段。同分异构体绝对构型指认。蛋白质组学还是集中在低丰度蛋白分离富集以及位点分析。
LC-MS无非也是定性定量方法开发,包括气相离子反应,nanoLC-MS的蛋白质分析、离子淌度方法。
LC-MS-NMR:请给我提高效率的方法
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发表于 2024-9-13 14:15 | 显示全部楼层
现在:
mRNA drug substance分析
包括cap quant,tail quant,ORF impurity ID,碱基定量
mRNA表达蛋白和杂质蛋白定量
主要是MRM和intact
之前:
antibody drug substance分析
包括intact,charge variant,pep mapping,sequence variant定量, host cell protein定量等等
基本就是LC里看到个啥就ID一下,分不开的只要有文献报道过的也都ID一下
以上多数数据用于内部各种procedure/candidate筛选参考,少部分数据进IND/BLA的characterization部分给FDA。
再之前:
用电子把大分子轰成渣!轰着玩!biubiubiu
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