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[分享] 有没有人会看这个流式细胞的图呀qwq?

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发表于 2024-9-9 06:47 | 显示全部楼层 |阅读模式

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I.What percentage of all CD8+ cells from the Healthy Donor express CD45RA ?
II.What percentage of CD4+ cells from the Healthy Donor are CD27 negative ?  
III.What percentage of CD8+ cells in the Healthy Donor are both CD45RA neg and CD27 positive (CD45RA-/CD27+) ?
IV.What percentage of all CD4+ cells from the Hyperprogressive donor are CD45RA+ and CD27neg  (CD45RA+/CD27-) ?
V.What is percentage of all CD8+ cells from the Hyperprogressive donor lacks CD45RA expression ?
然后这个是问题,能不能最好带上解析TAT呜呜呜实在是不会做这个。以及有没有什么生物,传染病相关的交流群这一类的_(:з」∠)_真的上课学完外加看一些网站的教学视频看完觉得自己会了一做题又啥都不知道了真的很痛苦qwq



原文地址:https://www.zhihu.com/question/625397912
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发表于 2024-9-9 06:47 | 显示全部楼层
先看红色的框。它们告诉你:左边的两个图是健康人(Healthy Donor)的样品,右边的两个是Hyperprogressive donor;上面两个是CD4+细胞,右边的两个是CD8+细胞。所以左上的图表示健康人的CD4+细胞,以此类推可得右上、左下和右下。


再看绿色的框,它们告诉你:对于每一张图,横坐标都是CD27,纵坐标都是CD45 RA。箭头表示数值从小到大的方向。


最后看每张图内部的十字,用于区分阴性和阳性信号,实际检测中要用阴性细胞来对照划门的。这类四象限图的四个象限分别是双阴性(左下)、横轴单阳性(右下)、双阳性(右上)、纵轴单阳性(左上)。
因此具体方法为:
I.What percentage of all CD8+ cells from the Healthy Donor express CD45RA ?
问题I问的是健康人的所有CD8+细胞(找左下图),表达CD45 RA的细胞(即CD45 RA阳性。纵轴是CD45 RA的值,所以找上边的两个象限),所占比例(左上和右上相加)。
II.What percentage of CD4+ cells from the Healthy Donor are CD27 negative ?
同理,问的是左上图,CD27阴性指的是左侧的两个象限,左下+左上。
III.What percentage of CD8+ cells in the Healthy Donor are both CD45RA neg and CD27 positive (CD45RA-/CD27+) ?
CD45RA阴性/CD27阳性,就像上面所说,是第二象限,即右下。
IV.What percentage of all CD4+ cells from the Hyperprogressive donor are CD45RA+ and CD27neg (CD45RA+/CD27-) ?
这个问题需要在右上图里找数据,第四象限左上。
V.What is percentage of all CD8+ cells from the Hyperprogressive donor lacks CD45RA expression ?
这里的“缺乏CD45RA表达”指的就是阴性,具体的数据您应该能找到的。
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发表于 2024-9-9 06:48 | 显示全部楼层
这个图中,上边那两个图是cd8的,下面两个图是cd4的,然后横轴cd27,纵轴cd45ra,他这个是十字圈门的,cd27阳性的就是右边的细胞分群,cd27阴性就是左边的细胞分群,同理,cd45ra看上下,上边的分群是阳性的,下边的分群是阴性的;横轴纵轴合起来看,就可以分成四群,双阳性的naive,双阴性的effect memory,cd27阳cd45ra阴的central memory,cd45ra阳cd27阴的T emra
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发表于 2024-9-9 06:49 | 显示全部楼层
完整具体的流式数据种类和分析方法可以看我的专栏:
睡眠质量5.1:5.2.2 FACS & FC 流式
简单来说你这个图使用density plot密度图表示的共表达四象限图。密度图的意思是上面从蓝到红的颜色指的是从少到多有多少细胞的信号落在那个位置,只是一种定量表达方式,至于这个量就是每个区域里写的数字(百分比)。而四象限图就更简单了,看线的位置这么一切就行:



bitesizebio

每一张图的荧光信号来源的抗原是什么写在最外面的箭头上。以左上角的四象限图为例,横轴是CD27表达量,纵轴是CD45RA表达量;通过CD4/CD8的预筛选,同一个样本被分成CD4(上半图)和CD8(下半图);而其样本来自最上面写着的健康捐献者。
所以回答题目里的小问题,以第一问为例:
Healthy donor:左半图
CD8+:下半图
CD45RA expression:纵轴阳性,即TEMRA+Naive

流式真的不难的。
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