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[分享] 精准医学大数据和生物信息学有什么区别和共同点?

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发表于 2024-9-6 20:46 | 显示全部楼层 |阅读模式
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发表于 2024-9-6 20:47 | 显示全部楼层
所谓精准医学大数据自我感觉只是一个噱头,精准医学也是搞各种基因测序,比如肿瘤靶向用药的各种Panel,肿瘤风险预测的WGS/WES, 样本只有那些,但是人基因组大那(3亿个碱基,1x就得3G数据量,你想想数据量大么。。。叫个大数据没问题吧),但是再大也就是跑那些类似的流程(数据质控+比对+SNV/CNV/Fusion+你想要的各种分析),都是生物信息学的那一套。后边就是你积累了成千上万样本,你有了这些样本SNV/CNV/Fusion和你分析的各种特征,再套上机器学习或者深度学习模型里面训练一下,看看有啥效果,不都还是生信的那一套。。
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发表于 2024-9-6 20:47 | 显示全部楼层
生物信息学是一个非常广的领域,一般约等于定量生物学/定量生物医学,甚至精准医疗也能涵盖。但是既然题主这么问了,那应该是问传统定义上的生物信息学——下面的区别都是基于这个定义来的。
数据集的区别:

  • 前者一般是临床数据集,可能有临床医疗记录、医学图像等等
  • 后者一般是各种组学数据集
研究问题的区别:

  • 精准医学一般是解决疾病异质性的问题,从而达到精准诊断、个性化医疗的目的
  • 生信就很广了,基本上分子生物学的问题都会涉及(广义上生物信息学还可能涉及显微图像分析、药物筛选、质谱数据分析等等)
研究方法的区别:

  • 前者一般用生物统计学、大数据挖掘、机器学习
  • 后者一般用组学分析、生物数据库挖掘、算法和软件开发
<hr/>还有一个不确切,但是外行人一看就懂的比喻:

  • 不是调包侠的前提下(●'◡'●),生物信息学近似于软件开发,精准医学大数据相当于数据科学
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发表于 2024-9-6 20:47 | 显示全部楼层
生物信息学关注生物分子信息的获取和分析,强调计算机科学和统计学;精准医学大数据注重在医学中应用大规模数据,实现个体化医疗,涵盖基因组等多组学、临床表现等多方面数据。两者共同点在于数据驱动、跨学科合作,服务医学研究和临床实践。
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发表于 2024-9-6 20:48 | 显示全部楼层
前者应该是仍处在探索阶段的定义,很多学科的人都开始做,包括且不限于搞数学、统计、计算机、生物、医学的老师和团队。但是你要说给出这个领域明确的定义、学生培养体系、整体知识或者工程架构,我认为还需要一段时间的探索。
后者是已经经历了几十年发展的成熟学科吧
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