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[分享] 如何根据靶点或药物信息获取相关生物序列来做研发立项?

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发表于 2024-9-6 07:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
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发表于 2024-9-6 07:28 | 显示全部楼层
在进行研发立项时,您可以根据靶点或药物信息来获取相关的生物序列信息。以下是一些步骤和建议,帮助您更有效地进行这项工作:

### 1. 确定靶点或药物信息
首先,您需要明确您的研究靶点或药物名称。这可能是已经上市的药物、正在研发中的药物或者是您想要探索的潜在靶点。

### 2. 注册数据库账号
为了在生物序列数据库中进行搜索,您通常需要在相关的数据库注册账号。例如,如果您使用的是智慧芽Bio生物序列数据库,您可以免费申请注册账号。

### 3. 搜索相关生物序列
在数据库中,您可以通过药物/基因索引处输入您的靶点或药物名称来进行搜索。例如,如果您正在研究泰朗妥昔单抗,您可以在数据库中输入该药物的名称,系统将会显示出与该药物相关的生物序列信息。

### 4. 分析和筛选序列
在搜索结果中,您可能会看到多个相关的生物序列。您可以分析这些序列,并根据您的研究需求进行筛选。例如,您可以选择特定的序列长度、序列类型、物种来源等信息来缩小搜索范围。

### 5. 导出序列信息
一旦您找到了感兴趣的序列,您可以将其导出到本地,以便进行进一步的分析和研究。大多数数据库都提供了导出序列信息的选项,通常是通过FASTA文件格式。

### 6. 查看专利和文献信息
除了序列信息外,您还可以查看与这些序列相关的专利和文献信息。这些信息可以帮助您了解该序列的研究现状、应用领域以及可能的创新点。

### 7. 利用专业工具进行深入分析
有些数据库提供了专业的工具,用于对序列进行深入的分析,如变异分析、化学修饰分析等。这些工具可以帮助您更好地理解序列的特点和潜在的应用潜力。

### 8. 考虑时效性
在获取和分析生物序列信息时,您应该注意信息的时效性。最新的研究成果和技术进步可能会对您的研发项目产生重要影响。因此,建议您定期更新和检查相关领域的最新动态。

通过以上步骤,您可以更有信心地进行研发立项,并为您的研究项目奠定坚实的基础。
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发表于 2024-9-6 07:29 | 显示全部楼层
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发表于 2024-9-6 07:29 | 显示全部楼层
在进行靶点或药物研发立项之前,获取相关生物序列是非常重要的一步。
下面是一些常用的方法,可以帮助你获取与靶点或药物相关的生物序列。  
1. 数据库搜索:许多公共数据库提供了大量的生物序列信息,如NCBI、UniProt、Ensembl等。你可以使用关键词来搜索你感兴趣的靶点或药物,并获取相应的生物序列数据。
2. BLAST分析:BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一种常用的序列比对工具。你可以使用已知的序列信息,如蛋白质序列或DNA序列,进行BLAST比对,来找到与之相似的靶点或药物相关的序列。
3. 文献检索:专业领域的科学文献中通常会提供关于靶点或药物的序列信息。你可以使用学术搜索引擎,如PubMed或Google Scholar,来查找相关的研究文章,并从中提取相关的生物序列。  
4. 合作与共享:有时,其他科研人员或机构可能已经对你感兴趣的靶点或药物进行了研究,并提供了相应的序列信息。你可以与他们进行合作或寻求共享数据,以获取所需的生物序列。  
5. 商业数据库:除了公共数据库,一些商业数据库也提供了丰富的生物序列信息,如GenBank、SwissProt等。这些数据库通常收集了大量的已知序列数据,并提供搜索和下载功能。  在获取到相关的生物序列之后,你可以进一步进行分析和应用,如基因功能注释、结构预测、突变分析等,以指导你的靶点或药物研发立项。务必记得对获得的序列数据进行验证和确认,以确保其准确性和可靠性。
实验室仪器-实验试剂-实验室耗材-移液器-生物反应器-苏州阿尔法生物实验器材有限公司
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发表于 2024-9-6 07:30 | 显示全部楼层
2023年7月13日,瓴路药业/ADC Therapeutics泰朗妥昔单抗的上市申请获得NMPA受理。我们以泰朗妥昔单抗为例,检索获取其相关生物序列。
首先,在智慧芽Bio生物序列数据库免费申请注册一个账号,在数据库首页左侧场景搜索里的药物/基因索引处,输入“泰朗妥昔单抗”或者英文名、商品名,都可以联想出来实体并且展示出来序列数量,点击搜索,进入详情页。
点击卡片免费使用

详情页展示出泰朗妥昔单抗的2个序列结果,同时可以在左侧的过滤项里自定义序列长度、序列类型、物种、是否存在修饰序列。选中序列可以一键导出FASTA文件到本地。在结果页面我们看到泰朗妥昔单抗序列相关的所有专利75条、文献12篇和其他库数据。进一步点击查看公开源,可以查看数据详情。




点击专利可以直接跳转至专利库中查看专利详情,也可以同时在左边专利过滤项做一次精准筛选过滤。在专利详情页可以利用序列助手高亮选中序列做匹配。


文献库数据可以看到相关文献的发表日,标题,同时提供DOI链接直接跳转至原文献,同时包含序列注释,Pubmed标识号。


点击卡片免费使用如需体验具体功能可以申请:https://www.zhihuiya.com/bio
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