ctDNA含量超过10%，液态活检灵敏度将接近100%

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Foundation Medicine在对23482例液态活检样本中的ctDNA含量与变异检测灵敏度进行回顾性研究后发现，当ctDNA含量超过10%，液态活检灵敏度将接近100%。
ctDNA（循环肿瘤DNA）是肿瘤液态活检的经典检测对象之一。虽说ctDNA较容易获取，并且能同时检测到来自不同部位肿瘤的变异信息，可在实际的临床应用过程中仍面临一些挑战。由于ctDNA在血液中含量较低，其检测灵敏度较组织样本低。研究表明液态活检对驱动基因突变的检测灵敏度相对于组织为58%-86%。通常，当ctDNA检测为阴性时，临床医生还需要对组织样本进行检测才能确认最终结果。

为了突破这一困境，Foundation Medicine团队在两年间对23,482例液态活检样本，进行了ctDNA 含量与液态活检变异检测灵敏度相关性的回顾性分析。结果发现如果液态活检为阴性的样本中存在足够丰度的ctDNA（>10%），该样本对应的组织检测为阴性的可能性非常高，即该样本可以确认为阴性，且无需对组织进行检测来确定是否有突变漏检。该结论可以在临床医生看到ctDNA检测报告为阴性而决定是否要再做组织检测时给与指导。根据该研究，只有ctDNA含量较低的阴性检测样本需要进一步做组织检测确认。这无疑让部分患者避免了不必要的重复检测，降低了他们的经济与健康负担。该研究成果近日由Foundation Medicine团队发表于JCO precision oncology。



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研究重点

从2020年9月至2021年10月，Foundation Medicine 公司共对23,482例样本进行了研究。这些样本涉及25个癌种，其中有94%的样本可以检测到不同含量的ctDNA，平均 ctDNA 含量为2.2%(图1)。



图1. 不同肿瘤液态活检样本的 ctDNA 含量

其中有1289例样本同时具有血液和组织样本的检测结果，对比发现液态活检的驱动基因突变检测的灵敏度相对于组织为58%-86%；但当液态活检中 ctDNA 含量超过10%时，液态活检的灵敏度是100%或接近100%。(图2)。
研究结果说明，如果液态活检阴性样本中的 ctDNA 含量超过10%，就预示着该样本对应的组织中含有阳性位点的概率极低，则无需为了验证结果再获取组织样本进行检测。



图2. 液态活检相对于对应组织检测的灵敏度(蓝色为所有样本，红色为 ctDNA 含量超过10%的样本)

虽说上述结论在应用到临床检测之前还需要更多的证据和数据支持。但我们已经可以想象未来病人和医生不必再担心高ctDNA含量样本液态活检的结果会遗漏阳性位点，同时病人和医疗系统也无需在为此承担更多的冗余检测费用。

参考文献
Husain, Hatim et al. “Tumor Fraction Correlates With Detection of Actionable Variants Across > 23,000 Circulating Tumor DNA Samples.”JCO precision oncologyvol. 6 (2022): e2200261. doi:10.1200/PO.22.00261



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